结合生物信息学和分子对接技术探讨基于肝糖异生抑制策略治疗2型糖尿病的靶标蛋白标志物

目的 基于肝糖异生抑制策略筛选2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的标志性靶标蛋白。方法 从NCBI数据库下载人类肝组织基因芯片数据集,使用GEO2R在线分析工具筛选T2DM易感性基因;利用GeneCards和OMIM数据库检索糖异生相关靶点;整合数据获取T2DM-肝糖异生交互靶点,并构建蛋白质间相互作用网络筛选标志性靶标蛋白;使用Metascape数据库对靶点进行基因本体论和通路富集分析;借助分子对接预测T2DM治疗药物与标志性靶标蛋白之间的相互作用能力;最后联合二甲双胍对标志性靶标蛋白在自发性T2DM KKAy小鼠肝组织中的影响进行验证。结果 共识别出1 143个T2DM易感性基因和958个糖异生相关靶点,获得56个T2DM-肝糖异生交互靶点,并经网络分析筛选出2个标志性靶标蛋白PTPRC和VCAM1;交互靶点主要富集在葡萄糖分解代谢、典型糖酵解、葡萄糖-6-磷酸糖酵解等生物过程,通过糖酵解/糖异生、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、内分泌抵抗等通路调节发挥作用;26个降糖药物均与标志性靶点同时具有较好的空间匹配、能量匹配以及不同程度的结合能力;T2DM模型组小鼠血糖较正常组显著增高,且在治疗后显著降低;T2DM模型组小鼠肝组织中PTPRC、VCAM1的蛋白表达水平均较正常对照组显著增高,并且均在二甲双胍治疗后显著降低。结论 本研究系统筛选并验证了肝组织中可能影响T2DM肝糖异生的2个标志性靶标蛋白,揭示了T2DM中肝糖异生调控通路,为深入研究肝糖异生防治机制,寻找新的降糖药物作用靶点提供依据。     

逍遥散治疗糖尿病的网络药理学分析

新型冠状病毒肺炎（COVID-19）已成为全球性的重大疫情,中医药在重大疫情防控过程中发挥了重要作用。基于对COVID-19的认识以及中医药防控路径,以疏风解毒胶囊为例,概述了中医药针对早期干预、阻断病情进展、改善症状、抗炎免疫、抑制“细胞因子风暴”以及辨证分型、发挥配伍优势等方面的思路和研究实践,并提出中药新药研发科学模式建立的设想。     

基于PTP1B活性区域靶向中药成分治疗糖尿病的虚拟筛选及动力学模拟验证

目的 利用计算机辅助技术,在中药成分中针对蛋白酪氨酸磷酸酶1B(PTP1B)多个作用位点筛选抑制剂。方法 整理TCMSP数据库,利用Autodock Vina和Ledock筛选,利用数据库预测中药成分类药性质、生物活性、药动学,通过动力学模拟验证结合稳定性。结果 2,3,7-trihydroxy-5-(3,4-dihydroxy-E-styryl)-6,7,8,9-tetrahydro-5H-benzocycloheptene有良好的类药性质,满足类药原则,有良好的药动学性质,与PTP1B多个活性位点共同作用并稳定结合。结论 2,3,7-trihydroxy-5-(3,4-dihydroxy-E-styryl)-6,7,8,9-tetrahydro-5H-benzocycloheptene具有治疗糖尿病的潜在可能性,可以对其做进一步结构优化、实验验证。     

基于糖尿病相关靶点SWELL1-LRRC8的中药单体抑制剂虚拟筛选

目的 利用计算机辅助技术筛选糖尿病相关靶点SWELL1-LRRC8的中药成分活性结构。方法 按照类药性对中药单体进行筛选,以Autodok Vina对接筛选,在PASS中预测中药单体的糖尿病治疗活性,以Gromacs进行动力学验证。结果cnidimonal、dianthramine与关键残基R103、D102和L101同时存在作用,dianthramine有更好的PASS预测结果并且与受体结合更为稳定。结论 cnidimonal、dianthramine可能存在潜在糖尿病治疗活性。