基于网络药理学结合GEO数据库多芯片分析法探讨糖痹外洗方治疗糖尿病足的作用机制

目的 基于网络药理学结合GEO数据库多芯片研究糖痹外洗方治疗糖尿病足相关疾病的潜在治疗靶点及可能作用机制。方法 采用TCMSP、TCMIP、TCMID、HERB数据库筛选糖痹外洗方化学成分及作用靶点。在GEO数据库中检索糖尿病足及相关疾病差异表达基因,汇总得到糖尿病足靶点。使用微生信在线作图平台对疾病靶点和化学成分靶点取交集,并构建交集靶点蛋白互相作用（PPI）网络。采用Metascape平台工具对交集靶点进行基因本体（GO）分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析。根据分析结果,选取度值排名靠前的化合物和蛋白,使用AutoDock Vina进行分子对接。结果 共得到糖痹外洗方活性成分99个,成分靶点427个,糖尿病足靶点2 217个,交集靶点64个。关键靶点蛋白主要有表皮生长因子受体（EGFR）、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、环加氧酶2(PTGS2)、Janus激酶2(JAK2)、基质金属蛋白酶1(MMP1)等,关键成分有槲皮素、山柰酚、木犀草素等。GO功能富集分析得到665个生物过程、30个细胞组分、80个分子功能。KEGG通路富集分析共得到100条通路信息...     

复方黄柏液涂剂治疗糖尿病足溃疡的网络药理学及实验研究

目的 利用网络药理学和实验研究探讨复方黄柏液涂剂对糖尿病足溃疡的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库(TCMSP)检索复方黄柏液中药有效成分及相关靶点，应用GeneCards和OMIM数据库搜索糖尿病足溃疡疾病靶点，使用Cytoscape 3.9.1构建“活性成分-靶点”网络图，利用Venny 2.1.0选取药物成分和疾病交集靶点，将交集靶点导入STRING 11.0平台构建蛋白互作网络(PPI)；通过DAVID 数据库进行GO生物功能和KEGG通路富集分析。实验研究选取30只SD大鼠，随机分为正常溃疡组、糖尿病溃疡组及复方黄柏液治疗组，每组10只。ELISA法检测各组大鼠血清中白细胞介素(IL)-1β、IL-6、肿瘤坏死因子(TNF)-α、血管内皮生长因子(VEGF)和表皮细胞生长因子(EGF)表达情况，HE染色法观察足部溃疡愈合情况。结果:网络药理学共检索到复方黄柏液88种有效成分，有效成分作用靶点518个；检索到药物和疾病交集靶点225个；通过分析得到TNF-α、IL-6、VEGFA、IL-1β、EGF、CXCL8等15个关键靶点；GO功能富集分析主要包括细胞因子活性、生长因子活性等多种功能途径；KEGG通路富集分析主要包括MAPKA信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、AGE-RAGR信号通路等。动物实验结果显示，复方黄柏液可显著降低血清中TNF-α、IL-6、IL-1β的含量，提高VEGF和EGF的表达；HE染色结果表明复方黄柏液治疗后足溃疡中肉芽组织及成纤维细胞含量显著增加。结论:复方黄柏液可通过多途径、多靶点、多通路治疗糖尿病足溃疡，复方黄柏液通过降低血清中炎性因子TNF-α、IL-6、IL-1β的含量，提高血清中VEGF和EGF表达量，加速肉芽组织生成，促进糖尿病足溃疡的愈合。