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目的:老年抑郁障碍的自杀和血管性痴呆等风险较高,本研究基于基因转录调控网络,整合并利用生物信息学分析,探索老年期抑郁症(geriatricdepression,GD)的诊断生物标志物。方法:从公共数据库Gene ExpressionOmnibus(GEO)中下载基因表达谱数据集GSE76826。R软件鉴定GD与健康对照样本两组之间的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。基于DAVID数据库对DEGs进行基因本体论(Gene Ontology,GO)功能注释、京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。STRING在线生物信息学工具对DEGs进行调控网络分析并构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,Cy toscape软件筛选枢纽基因。之后,采用pROC软件包进行受试者工作特征(receiver operatingcharacter i stic,RO C)曲线分析,筛选转录因子以获得诊断生物标志... 相似文献
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