2011-2021年湖北省荆州市手足口病流行特征及病原学监测分析

目的 描述2011—2021年湖北省荆州市手足口病(HFMD)流行病学特征,分析重症病例危险因素,为该地区HFMD防制提供科学依据。方法 自《中国疾病预防控制信息系统》收集荆州市HFMD病例、病原学监测结果、聚集性和暴发疫情资料。采用描述性流行病学方法描述HFMD三间分布特征,计算发病率、重症率、占比、标本检测阳性率及亚型占比。采用logistic回归分析HFMD重症的危险因素。结果 2011—2021年荆州市累计报告HFMD 62 521例,年均发病率100.87/10万,重症数146例,重症率0.23%,死亡5例,病死率0.80/万,重症死亡率3.42%。发病率随年份无明显趋势变化(r_s=-0.21,P=0.539);重症率随年份呈下降趋势(r_s=-0.66,P=0.031)。HFMD发病呈双峰型特点(4—6月和11—12月);县(市/区)发病率介于51.85/10万～140.23/10万,高发地区随年份不断变化;人群分类以散居儿童(69.58%)和幼托儿童(28.18%)为主,男性(59.01/10万)发病率高于女性(41.66/10万...     

非药物性干预措施对0～14岁儿童法定传染病发病的影响

目的 以荆州市数据为例,探讨非药物性干预措施(non-pharmaceutical interventions, NPIs)对0～14岁儿童法定传染病(notifiable infectious diseases, NIDs)发病的影响。方法 2015年第1周—2020年第5周作为历史数据拟合贝叶斯结构时间序列(Bayesian structural time series, BSTS)模型并预测2020年6—53周NIDs发病例数。相对下降(relative risk,RR)评价指标被用于评价NPIs对NIDs的影响。分病种、年龄组、性别、人群、传播途径和时期进行亚组分析。结果 荆州市2020年6—53周0～14岁儿童共报告NIDs 16种5 219例,较2015—2019年同期下降64.57%。基于模型2020年6—53周NIDs发病例数总体下降54.51%,其中甲乙类传染病下降59.09%,丙类传染病下降54.28%。从传播途径看,呼吸道传染病的发病例数下降幅度最大(RR=87.58%,95%CI:56.64%～118.16%)。不同性别NIDs的发病例数下降幅度相当。从年龄看,...     

2004 - 2018年中国布鲁氏菌病流行特征及趋势变化分析

目的分析2004 - 2018年全国布鲁氏菌病(布病)流行特征, 了解布病发展趋势。方法自公共卫生科学数据中心收集2004 - 2018年全国布病监测资料。采用joinpoint回归分析全国和各省份布病发病率趋势变化, 总体趋势采用平均年度变化百分比(AAPC)进行估计;采用局部回归季节分解法分析全国和各省份布病季节特征;同时绘制各年龄发病率随年份变化热力图。结果 2004 - 2018年全国累计报告布病524 980例, 死亡16例, 发病率为2.61/10万, 病死率为(3.05 × 10-3)%。全国布病发病率呈上升趋势(AAPC = 11.58%, 95%CI:7.91% ～ 15.25%, P < 0.001);内蒙古自治区、山西省和陕西省未见明显变化趋势(均P > 0.05);西藏自治区呈下降趋势(AAPC = - 55.19%, P < 0.001);其他省份均呈上升趋势(均AAPC > 0, 均P < 0.05)。全国发病高峰出现在4 - 6月;按省份划分, 海南省、四川省、贵州省、福建省、安徽省发病高峰以4 - 8月为主, 重庆市、上海市...     

新冠病毒奥密克戎变异株感染的核酸转阴时间分析

目的 分析新冠病毒感染奥密克戎变异株上呼吸道标本核酸转阴时间,为了解新冠病毒感染奥密克戎变异株传染期提供参考。方法 以2022年11月1日—2023年1月10日湖北省荆州市某单位新冠病毒感染者为研究对象,收集感染者年龄、性别、新冠病毒疫苗接种史、2022年流感疫苗接种史以及发病日期、首次核酸检测阳性日期以及往后隔日核酸检测结果。发病日期或首次核酸阳性较早者定义为第0 d;连续2次（至少间隔24 h）核酸检测阴性定义为核酸转阴。采用生存分析计算转阴时间,Cox比例风险回归进行亚组比较。对定点收治医院感染者进行基因测序,监测荆州市流行毒株。结果 共102例新冠病毒感染者纳入研究,男女性别比0.96:1,年龄以40岁以上人群（65例,63.73%）居多,所有感染者既往均接种3剂次灭活疫苗,73例2022年7—8月接种4价流感疫苗。研究期间35名感染者进行基因测序结果显示均为Omicron BA.5.2变异株。感染者发病（或核酸检测首次阳性）5 d后核酸阳性率为97%。核酸转阴中位时间为12 d(95%CI:12～14 d),18 d后核酸均转阴。不同性别和年龄组感染者核酸转阴时间存在差异（P...     

TBATS模型在流行性腮腺炎发病率预测中的应用

目的 探讨TBATS模型在流行性腮腺炎发病率预测中的可行性.方法 以2004—2017年江西省流腮数据作为演示数据.2004年1月至2017年6月数据作为训练集,2017年7～12月数据作为测试集.训练集分别训练TBATS模型、SARIMA模型,并预测2017年7～12月发病率并与测试集比较,采用MAPE,RMSE,M...     

2017-2020年湖北省荆州市肾综合征出血热流行特征及时空聚集性分析

目的 分析2017—2020年湖北省荆州市肾综合征出血热（HFRS）流行特征及时空聚集性,为该市HFRS的防控提供参考。方法 采用描述性流行病学方法描述荆州市HFRS病例的三间分布和死亡病例的特征。采用核密度估计（KDE）分析HFRS病例的空间聚集性;采用时空扫描统计分析HFRS病例的时空聚集性。结果 2017—2020年荆州市累计报告HFRS 875例,发病率为3.89/10万,死亡15例,病死率为1.71%。2020年发病率最高为5.67/10万,2017年发病率最低为2.18/10万。荆州市8个县（市、区）均有病例报告,发病率居前3位的地区分别为江陵县（9.98/10万）、公安县（5.96/10万）、监利县（5.60/10万）。HFRS存在2个流行高峰,为4—7月和11月至次年1月。男性发病率高于女性（RR=2.71,95%CI:2.33～3.14）。发病率最高的年龄组为60～64岁（10.90/10万）、65～69岁（8.96/10万）、55～59岁（8.07/10万）。60岁以上病例数占病例总数的36.06%。职业以农民（666例,占76.11%）为主。KDE显示较高及以上强...     

基于真实世界数据奥密克戎BA.5.2变异株传播动力学参数估算

目的 利用湖北省荆州市2起由奥密克戎BA.5.2变异株引起的局部疫情数据，估算奥密克戎BA.5.2变异株的传播动力学参数，为认识奥密克戎BA.5.2变异株传播能力提供科学依据。方法 采用自行设计表格收集2起疫情中感染关系明确的感染者与被感染者的感染时间、发病时间及首次核酸阳性采样时间等数据。对获得数据分别拟合对数正态分布、伽马分布和伽马分布计算潜伏期、世代间隔(GT)、代际间隔(SI)。分别采用指数增长模型(EG)和极大似然估计法(ML)计算基本再生数(R0)，取R²较大者作为R0估算值。结果 荆州市2起疫情中，疫情A为外市来荆人员在荆州市进行社交活动引起，主要通过同住、同餐、同娱乐和同工作传播，为常见社交传播情形；疫情B涉及人群聚集的批发市场，首发病例进入后停留3 h后随即离开，在农贸市场快速传播并外溢至同住人员，为人群密集场所传播情形。2起疫情共计纳入感染者与被感染者39对52例的数据用于潜伏期、GT和SI估算。潜伏期中位数为2.52 d(44例，1.32～4.84 d),SI中位数为2.13 d(37例，1.63～2.64 d),GT中位数为1.91 d(2...     

传染病组合预测模型的构建——基于R软件

目的 利用R软件构建传染病组合预测模型，为疾病监测工作者提供参考。方法 以全国（不含香港、澳门特别行政区和台湾省数据）、吉林省、辽宁省、黑龙江省2004—2017年肾综合征出血热（HFRS）逐月发病率作为训练数据拟合模型，2018年1—12月数据用于评价预测效果。组合模型选择自回归移动平均模型（SARIMA）、指数平滑模型（ETS）、自回归神经网络模型（NNETAR）、指数平滑空间状态模型（TBATS）进行组合，采用R软件“forecastHybrid”包构建。单一模型权重相同的组合模型记为组合模型A；单一模型权重根据训练数据拟合效果确定，记为组合模型B。采用平均绝对误差百分比（MAPE）、离均差平方和（RMSE）评价6个模型拟合及预测效果。选取2004—2011年、2004—2012年、2004—2013年、2004—2014年、2004—2015年、2004—2016年、2004—2017年数据作为训练集分别建立模型，预测未来1—12月发病率进行敏感性分析。计算组合模型拟合及预测的MAPE、RMSE顺位累计和评价模型拟合及预测效果稳定性。结果 SARIMA、ETS、NNETAR、T...     

2005-2021年荆州市肾综合征出血热发病率的贝叶斯年龄-时期-队列分析

目的 分析2005-2021年荆州市肾综合征出血热(HFRS)病例的年龄、时期和出生队列特征。方法 自传染病监测系统收集2005-2021年荆州市HFRS发病率数据。采用描述性流行病学方法描述HFRS病例的时期、年龄分布特点。采用Spearman等级相关分析HFRS变化趋势。采用贝叶斯年龄-时期-队列分析分析HFRS发病率的年龄、时期和出生队列效应。所有分析均比较不同性别差异。结果 2005-2021年荆州市累计报告HFRS 1 407例，年均发病率为1.43/10万。2005-2021年荆州市HFRS发病率总体呈上升趋势(r_s=0.94,P=0.000)。相较于2013年，2016年后发病风险均有统计学意义(RR>1,P<0.05)。年龄分布呈倒“V”型，发病高峰出现在60～64岁(4.22/10万)、65～69岁年龄组(4.12/10万)。60～64岁年龄组相较45～49岁年龄组发病风险高(RR=1.63,95%CI:1.07～2.26)。14岁及以下人群随时期构成比在0.00%～6.90%波动，发病率在0.00～0.37/10万波动；60岁及以上...