血流感染O139群霍乱弧菌的耐药性及基因组特征分析

目的分析1株从菌血症患者血液中分离到的O139群霍乱弧菌产毒株的耐药性及基因组特征。方法使用肉汤稀释法和全自动药敏分析仪测定菌株的抗生素敏感性, 使用二代基因测序和纳米孔测序获得菌株的完整基因组序列, 使用BLAST在线比对与CARD、Resfinder、ISfinder、VFDB等数据库进行比对分析, 明确菌株携带的耐药基因、插入序列和毒力基因等, 使用MEGA 5.1软件构建基于核心基因组单核苷酸多态性的遗传系统发生树。结果霍乱弧菌SH400为O139群产霍乱毒素的菌株, 携带了多个毒力相关基因和4个毒力岛。该菌株对链霉素、四环素、磺胺甲恶唑/甲氧苄啶耐药并携带了相应的耐药基因。该菌株携带了大小为172 914 bp并且含有10种耐药基因的IncA/C型质粒。结合基因组进化关系发现, 菌株间携带耐药基因和耐药质粒的情况呈现出一定聚集性。菌株SH400的传统ST型为ST69, cgMLST型为与cgST-252高度相似的新型别。结论该株O139群霍乱弧菌携带ctxAB毒力基因、多种耐药基因和IncA/C型质粒, 且存在多重耐药岛。     

郑州市某三甲医院耐碳青霉烯类抗生素肺炎克雷伯菌的基因组分型分析

目的:分析郑州市某三甲医院耐碳青霉烯类抗生素肺炎克雷伯菌（CRKP）的基因组分型特征。方法:于2019年12月4日至2020年1月10日,自郑州市某三甲教学医院各临床科室送检且开展微生物检测的标本中分离出67株CRKP菌株。通过将全基因组测序和序列分析,确定多位点序列分型（MLST）型别（ST）和碳青霉烯类抗生素耐药基...     

虾源达卡气单胞菌全基因组分析和致病性研究

目的 为了解虾源达卡气单胞菌的毒力、耐药基因分布和全基因组信息,并初步评估达卡气单胞菌的致病性。方法 对虾源分离株进行分子鉴定和多位点序列分型;利用β-溶血和胞外蛋白酶实验、秀丽隐杆线虫液体毒性实验、细胞毒实验、小鼠实验及毒力基因检测研究其致病性;通过药敏实验及耐药基因检测分析其耐药特征;利用eggnog、Prophage Hunter工具对全基因组序列进行分析。结果 菌株18FX22鉴定为达卡气单胞菌。该菌的致病性主要表现：有β-溶血能力和胞外蛋白酶活性;对秀丽隐杆线虫、小鼠成纤维细胞和小鼠均有致病性。经检测,该菌携带7种毒力基因和12种耐药基因,发现其对阿莫西林/克拉维酸、头孢唑林和多粘菌素3种药物有耐药性。全基因组测序结果发现：18FX22的全基因组大小为4 811 079 bp, GC含量为61.33%。COG注释发现18FX22共有3850个基因,具有20类功能。前噬菌体预测结果发现18FX22的基因组中含有2个前噬菌体序列。全球达卡气单胞菌的聚类结果显示该菌与GCA016729585的进化关系更近。结论 本研究从商品虾分离出达卡气单胞菌,发现该菌株的毒性较强,指示应加强海鲜...     

2013-2014年黑龙江省婴儿配方粉加工环节克罗诺杆菌污染状况及分子分型

目的 了解婴儿配方粉加工环节克罗诺杆菌污染状况和分子分型特征.方法 2013-2014年采集黑龙江省婴儿配方粉生产企业加工环节的各类样品2405份,进行克罗诺杆菌检验,并通过脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)和多位点序列分型(multi-locus sequen...     

我国东部沿海地区江河入海口水体中致病性弧菌分布特征

目的 分析我国东部沿海江河入海口水域的弧菌分布以及不同季节弧菌种类的差异,为致病性弧菌环境检测策略的制定提供数据支持.方法 分别在2019年8月和2020年1月,在我国濒临渤海、黄海、东海、南海的4个监测地市分别挑选2条河流,在入海口采集水样,进行弧菌分离培养,每份水样挑选30个疑似弧菌菌落,通过微生物质谱仪进行鉴定....