宁夏H3N2流感病毒血凝素基因分子特征分析

目的 了解2014—2020年宁夏H3N2流感病毒血凝素( Haemagglutimin,HA)基因变异情况,为宁夏的流感防控提供科学依据。方法 选取2014—2020年宁夏分离的30株H3N2流感毒株,提取病毒RNA,采用RT-PCR方法扩增HA片段并测序,利用生物信息软件对测序结果进行比对分析。结果 与疫苗株A/Texas/50/2012比较,宁夏H3N2流感毒株抗原表位在A区、B区和C区均有氨基酸变异,D区和E区抗原位点相对保守,未监测到变异。所有毒株在A区R142G/K、N145S,B区F159S/Y、P198P/S及C区N278K均发生变异。所有毒株受体结合位点左壁发生N225D变异,2016年和2017年部分毒株前壁发生T131K变异,2019—2020年宁夏流感毒株前壁发生T135K和S137F变异,底壁发生W153F变异,其他位点未发生变异。糖基化位点变异多发生于A区抗原位点和受体结合位点左壁、前壁及底壁。半胱氨酸相关位点均未发现氨基酸替换和插入。与分支带代表株比较,2014年、2015年及2016年部分毒株位于3C.3a分支,2016年部分毒株和2017年毒株位于3C.2a1分支,2019年和2020年毒株位于3C.2alb分支。结论 宁夏H3N2流感病毒HA蛋白重要氨基酸位点的变异表现出遗传多态性,在基因进化上呈现多分枝进化的特点,在抗原特异性、毒力和感染性上有可能已经发生变化。     

2021年—2022年宁夏Victoria系乙型流感病毒基因特性分析

目的 了解2021年—2022年宁夏Victoria系乙型流感病毒基因变异情况，为宁夏流感防控提供参考依据。方法 采集流感样病例标本进行核酸检测和病毒分离，对30株Victoria系乙型流感毒株的HA和NA片段进行基因测序，利用生物信息学软件分析进化变异特征。结果 30株宁夏Victoria系乙型流感毒株HA和NA基因在进化上与疫苗株B/Washington/02/2019(2020—2022)亲缘关系较近，属于V1A.3分支。HA基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为98.5%～99.0%和98.0%～98.6%;NA基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为99.0%～99.4%和98.9%～99.6%。与疫苗株B/Washington/02/2019相比，多数毒株在HA区有H122Q、A127T、R133G、G141R、P144L、N150K、G184E、N197D、K203R和R279K突变，涉及3个抗原表位，并在受体结合位点140-loop、190-helix及240-loop处存在突变位点。所有毒株均未发生耐药位点变异。结论 2021年—2022年宁夏Victoria系乙型流感病毒与本年度...