城市对海口市南渡江的微生物群落及其毒力因子与抗生素耐药基因组的影响

目的探讨河流流经海口市前后河水中细菌菌群结构、抗生素耐药基因组和病原菌毒力基因组的变化, 及其传播扩散模式。方法从流经海口市前的南渡江上游至南渡江入海口划分前、中、后段3个研究区域, 每个区域选择3个采样点, 每个采样点平行采集6份样本并混合为1份, 每份3 L。通过宏基因组测序和16S rRNA基因全长测序获得相关生物信息数据, 分析前、中、后3段水体中微生物群落结构以及耐药基因、毒力因子和可移动遗传元件信息。运用主坐标分析、普氏分析和曼特尔检测等方法分析样本间菌群分布差异以及传播模式相关性。结果随着河水流经海口市, 微生物的α多样性呈现逐渐降低趋势。其中变形菌门在前、中、后段的细菌群落中均占据主导地位, 中、后段变形菌门相对丰度高于前段。抗生素耐药基因、毒力因子及可移动遗传元件的多样性和丰度在前段均处于较低水平, 流经海口市后, 均明显升高。同时, 可移动遗传元件介导的水平传播在抗生素耐药基因和毒力因子扩散中发挥较大作用。结论城市化对河流中的微生物及其携带的耐药基因、毒力因子和可移动遗传元件产生显著影响。在海口市南渡江, 河流流经城市受纳了人群排出的抗生素耐药菌和病原相关细菌, 同...     

2009年海南省手足口病样本病原学检测结果分析

目的明确引起海南省2009年手足口病（Hand-foot-mouth disease,HFMD）暴发流行的主要病毒型别,为手足口病病例诊断和制定防控措施提供病原学依据。方法依据卫生部发布的《手足口病预防控制指南》（2009年版）附件1,提取手足口病临床诊断病例各种样本中的病毒核酸,用肠道病毒通用引物、肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A16型（CoxA16）特异性引物进行逆转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）和实时荧光-聚合酶链式反应（real-time PCR）。核酸检测阳性的原始样本接种人横纹肌肉瘤细胞（RD细胞）进行肠道病毒分离培养。结果海南省2009年各市县采集的1 085份手足口病样本中EV71、CoxA16和其它肠道病毒核酸阳性率分别为23.13%、1.57%和9.59%,不同类型病例的肠道病毒核酸阳性率分别为死亡病例55.56%（10/18）,重症病例36.07%（145/402）,普通病例32.63%（217/665）。不同类型样本肠道病毒核酸检测阳性率不同,肛拭子和粪便阳性率达到49.62%,疱疹液检测阳性率为43.84%,鼻咽拭子的检测阳性率为22.89%。结论引起海南省2009年手足口病暴发流行的主要病原是EV71,其次为CoxA16。应继续加强手足口病的病原学监测,掌握病毒型别变化趋势,更好地为手足口病防控工作提供技术支持。     

海南省2010～2011年手足口病例病原学监测结果分析

目的分析引起海南省2010-2011年手足口病（Hand-Foot-Mouth Disease,HFMD）暴发流行的主要病原及其变化趋势,为海南省手足口病病例诊断和制定防控措施提供病原学依据。方法依据卫生部发布的《手足口病预防控制指南》进行手足口病例样本的处理和实验室检测。采用实时荧光-聚合酶链式反应（Real-time PCR）进行肠道病毒通用引物、肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A16型（CoxA16）的核酸检测,核酸检测阳性的原始样本接种人横纹肌肉瘤细胞（Human Rhabdomyosarcoma,RD细胞）进行肠道病毒分离培养,选取有代表性的毒株进行病毒基因序列分析。结果 2010年和2011年海南省手足口重症病例中EV71感染率分别为45.52%和19.45%,而CoxA16的感染率仅为6.9%和4.7%;普通病例中的CoxA16感染率分别达到19.63%和24.8%,EV71的感染率分别为16.34%和6.36%。海南省2010年和2011年流行的EV71基因型均为C4a亚型,CoxA16病毒的基因型包括B1a和B1b,CoxA10、CoxA6和CoxA4也扮演着重要的角色,同时存在CoxA5、CoxB1、CoxB2、ECHO 3和ECHO 11等感染病例。引起海南省手足口重症病例的病原以EV71为主,也有少数病例为CoxA16的感染引起,2010年和2011年重症病例中CoxA16的感染率分别为6.9%和4.7%;而且CoxA10和CoxA6感染引起的重症病例比例较之CoxA4感染引起的重症病例的比例更高。结论海南省2010~2011年手足口重症病例仍以EV71感染为主,普通病例中EV71感染率逐渐下降,CoxA16感染率上升。在海南省人群中同时存在多种肠道病毒病原,导致海南省手足口病疫情的高发和重症病例的持续出现,尤其是CoxA10和CoxA6感染易导致重症病例的发生,值得进一步开展相关研究工作。     

不忘初心,继续前行

初心来自日本禅者铃木俊隆的著作,《禅者的初心》英文是"Zen,Beginner's Mind"这本书当时在美国引起了很大的轰动,乔布斯深受这本书的影响.书中围绕初心有很多的解释,初心,即"初学者的心",修行的目的就是要始终保持这颗初心,几乎每个人都听过"不忘初心,方得始终",却少有人知道下一句"初心易得,始终难守".做任何事情,难在坚持,贵在坚持.     

洁净手术室微生物污染分析

目的了解海南部分医院洁净手术室的微生物污染情况,为手术室管理提供依据。方法采用微生物检验和现场检测方法,于2008-2010年对海南部分医院洁净手术室进行了检测。结果在检测空气细菌浓度方面,Ⅰ级洁净手术室手术区检测合格率为75%、周边区检测合格率为80%,Ⅰ级眼科专用手术室周边区检测合格率为83%,Ⅱ级洁净手术室检测合格率为86%,Ⅲ级洁净手术室检测合格率为96%,洁净辅助用房的检测合格率均为100%;在检测工作台表面染菌密度方面,其检测合格率则为100%。结论新建洁净手术室级别要求越高,其微生物污染检测合格率越低,应加强其硬件建设和实行严格的科学管理。