TAP1基因多态性与结核病易感关联性的家系病例对照研究

目的 分析结核病多发家系中TAP1基因rs1135216和rs1057141位点单核苷酸多态性和环境因素与结核病患病的关联,为结核病防治提供理论依据。方法 从广东省结核病防治单位纳入结核病多发家庭患者,同病例组有血缘关系的作为家庭密切接触者,另取同期体检的健康人群作为健康对照,共413人纳入本次研究。采用家系病例对照研究方法,通过自行设计的问卷,收集研究对象的一般人口学特征、行为危险因素以及环境因素。采用χ2检验进行单因素分析及Hardy - Weinberg遗传平衡检验,多因素条件logistic回归模型用于分析各因素与结核病患病的关联。应用Haploview软件对两位点进行连锁不平衡分析和单倍型构建。采用GMDR分析基因 - 基因、基因 - 环境交互作用对结核病患病的影响。结果 共纳入413名研究对象,其中结核病患者（TB）133人,健康对照者（HC）173人,家庭密切接触者（HHC）107人。显性模型分析结果显示,携带CT - CC基因型是结核病患病的危险因素,在HHC组和HC组中,其患病风险分别是携带TT基因型的2.409倍（95%CI:1.377～4.214）和2.014倍（95%CI:1.249～3.247）。单体型分析结果显示,C - T单体型可能是肺结核患病的保护因素。GMDR分析结果显示,基因 - 基因交互作用在TB组和HC组间的最优模型是rs1135216单因子模型（P＜0.05,CVC = 10/10,TA = 0.579）;基因 - 环境交互作用在TB组和HHC组中,最优模型为rs1135216位点、性别、年龄和文化程度四因子模型（P＜0.05,CVC = 10/10,TA = 0.651）;在TB组和HC组中,最优模型为rs1135216位点、文化程度、BMI、居住环境潮湿与否和环境卫生五因子模型（P＜0.05,CVC = 8/10,TA = 0.655）。结论 TAP1基因rs1135216位点与结核病患病风险相关,且宿主 - 环境因素对结核病的发生发展起着重要的作用。     

TRAF1/C5和TNF-α基因多态性与结核病易感性分析

目的 分析肿瘤坏死因子受体相关蛋白1(tumor necrosis factor receptor-associated factor 1,TRAF1)/补体5(complement component 5,C5) rs10818488和肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-alpha,TNF-α) rs1800629基因多态性、环境因素及其交互作用对结核病(tuberculosis, TB)易感性的影响。方法 选取TB多发家庭中TB确诊患者作为TB病例组,当地社区同期体检的健康志愿者作为健康对照(healthy controls, HC)组,与TB组有血缘关系且共同居住者组成家庭密切接触(healthy household contacts, HHC)组。采用logistic回归分析模型分析基因型和环境因素与TB的关联,叉生分析结合logistic回归分析模型分析基因与环境交互作用。结果 年龄>45岁(χ²=7.90,OR=2.28, 95%CI:1.28～4.04,P=0.005)、吸烟(χ²=15.27,O...     

TAP2基因多态性与肺结核易感性的病例对照家系研究

  目的  肺结核(pulmonary tuberculosis,PTB)感染具有个体差异性,研究抗原处理相关转运蛋白2(transporter-associated with antigen processing 2,TAP2)基因多态性对PTB发病的影响,并分析TAP2基因与人口学特征、行为因素、环境因素在PTB发病中的交互作用。  方法  使用病例对照家系研究方法,将广东省多个结核防治单位收集的PTB多发家系中确诊患者作为病例组(PTB组),PTB多发家系中未患病者作为健康家庭密切接触者(healthy household contacts,HHC)组,当地同期收集的健康家系的家庭成员作为健康对照(healthy controls,HC)组。logistic回归分析模型分析各影响因素与PTB的关联,决策树(classification and regression tree, CART)模型分析发病危险因素间交互作用。  结果  logistic回归分析模型分析结果显示,对于HHC组,年龄、男性、吸烟和缺乏健身活动是PTB发病危险因素;对于HC组,城镇户口、BMI>18.5 kg/m2和室内干燥是发病保护因素,男性、吸烟、缺乏健身活动和室内环境卫生较差是PTB发病危险因素。PTB组与HHC组、HC组比较均发现rs3819721与PTB易感性相关。PTB组与HHC组的CART模型分析结果显示,不吸烟与有健身活动共存可降低PTB发病风险。PTB组与HC组模型分析结果显示,缺乏健身活动且携带rs3819721 AG+AA基因型的人群PTB患病风险更高。  结论  TAP2 rs3819721位点基因多态性与PTB发病相关,且其与缺乏健身活动在PTB发病中存在交互作用。暂未发现rs241447位点基因多态性与PTB发病有关。