浅析支原体污染对手足口病相关肠道病毒分离率的影响

目的探讨支原体污染对手足口病（Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD）相关肠道病毒（Enterovirus,EV）分离率的影响。方法随机选择13个省的HFMD相关EV培养物共26份,同时从EV复核率较低的某省送检的HFMD相关EV培养物中,随机挑选18份,采用套式聚合酶链反应（Nested Polymerase Chain Reaction,nPCR）对细胞培养物中的支原体核酸进行检测。对阳性产物进行序列测定,通过基本多序列比对工具（Basic Local Alignment Search Tool,BLAST）对序列进行同源性比对。结果随机挑选13个省的EV培养物中,4个省的标本支原体检测结果为阴性,1个省同时检出猪鼻支原体和精氨酸支原体,8个省检出精氨酸支原体。EV复核率较低省送检的18份培养物中均检出牛支原体。结论支原体污染在中国HFMD实验室使用的细胞系中普遍存在,某些支原体的污染,可能降低细胞的敏感性．引起病毒分离率的下降。避免细胞系的支原体污染对提高HFMD实验室网络运转质量具有重要意义。     

2015—2018年青海省手足口病病原谱变化和流行趋势

目的了解青海省手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)患者中肠道病毒流行情况和基因型特征。方法采集青海省HFMD患者的咽拭子标本, 进行病毒分离和特异性引物聚合酶链反应(RT-PCR), 对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析, 并参考NCBI部分毒株序列构建基因进化树。结果采集临床诊断HFMD阳性病例标本1 738份, 其中人肠道病毒A组71型(EV-A71)型326例, 占18.76%、人肠道病毒柯萨奇A16型(CV-A16)型237例, 占13.64%、人肠道病毒柯萨奇A6型(CV-A6)型628例, 占36.13%, 4年间不同基因型别间存在差异, 具有统计学意义(EV-A71, χ2=245.315,P<0.001; CV-A16, χ2=27.680,P<0.001; CV-A6, χ2=702.713,P<0.001), 用RD细胞分离后共得到到317株细胞培养物, 测序后选取2017年和2018年典型基因型的VP1区核酸序列进行序列分析, 全部基因型VP1区核酸序列间同源性在59%～100%之间, 19株EV-A71...     

海南省2010年柯萨奇病毒A组16型VP1区基因特征分析

目的 分析2010年引起海南省手足口病流行柯萨奇病毒A组16型（Coxsackievirus A16,CA16）的分子流行病学特征.方法 从海南省2010年手足口病（hand,foot,and mouth disease,HFMD）标本中分离到56株CA16毒株,用RT-PCR的方法对VP1编码区扩增及核苷酸序列的测定和整理分析,并与CA16各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树.结果 其中34株属于B基因型中的B1a基因亚型,22株属于B1b基因亚型.B1a基因亚型的毒株主要分布于海口市以及海南省西北部相邻的4个县市,B1b基因亚型的毒株主要分布于海口市以及海南省中部、西南部相邻的4个县市.结论 2010年海南省B1a和B1b基因亚型在人群中共循环,两个基因亚型呈现一定区域性分布的特点,提示在海南省CA16至少存在两条大的传播链.在2008年至2010年,海南省手足口病例中CA16感染的比例明显上升,分别为8.05％、5.35％、35.45％.     

手足口病相关柯萨奇病毒A组8型全基因组序列特征分析

目的 研究中国2013-2018年手足口病病例分离的柯萨奇病毒A组8型（CV-A8）全基因组序列特征及对全基因组各编码区进行遗传进化分析。方法 对我国不同地区手足口病患者分离的11株CV-A8的全基因组序列,采用Sequencher 5.0、MEGA 7.0等软件对获取的全基因组序列进行比对和遗传进化分析。结果 序列比对显示11株CV-A8基因组长度在7 393~7 400 bp之间,与原型株比较,在编码区无碱基插入或缺失,在非编码区存在个别碱基的插入或缺失。11株CV-A8毒株VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别为78.3%~98.6%和92.6%~99.7%;与CV-A8原型株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为78.3%~98.2%和92.6%~99.7%。对CV-A8的VP1区序列进行了系统发育分析,可将CV-A8分为5个基因型：A、B、C、D和E,本研究11株CV-A8分属于C（1株）、D（2株）、E（8株）3个基因型。11株CV-A8毒株全基因组序列核苷酸和氨基酸同源性分别为81.3%%~98.8%和95.9%~99.5%,P2区进化树图显示,本研究的8株E基因型CV-A8和CV-A4、CV-A14和CV-A16原型株进化距离最近,P3区进化树图显示,本研究8株E基因型CV-A8和CV-A5、CV-A16、CV-A14和CV-A4进化距离最近。结论 本研究中11株CV-A8其衣壳区呈现基因多样性,非衣壳区呈现重组多样性,提示CV-A8正在经历变异动态变化;CV-A8有可能成为手足口病的重要病原体,因此需要进一步加强监测CV-A8。     

陕西省2010-2012年柯萨奇病毒A组16型VP1基因特征分析

目的 对陕西省2010-2012年来源于手足口病（hand,foot and mouth disease,HFMD）病例的科萨奇病毒A组16型（Coxsackievirus A16,CVA16）毒株的VP1基因特征进行分析,以阐明其分子流行病学特征.方法 利用特异性引物对分离鉴定为CVA16的21株病毒进行VP1编码区扩增.对阳性产物进行序列测定,并用MEGA软件进行序列的生物信息学分析.结果 根据亲缘性分析,本研究的CVA16分别属于B1a和B1b基因亚型,其中仅2011年分离自宝鸡市的10株属于B1a基因亚型,分离自其他4个地市的11株则属于B1b基因亚型.B1a和B1b基因亚型内核苷酸序列同源性分别为99.9％ ～100％和92.93％ ～ 100％.不同基因亚型毒株间核苷酸序列差异为8.43％～9.45％.结论 2010-2012年,属于B1a和B1b基因亚型的CVA16在陕西省共同循环,其中B1b基因亚型流行范围较广,可能为陕西省的优势亚型.     

2023年5月中国需关注的突发公共卫生事件风险评估

目的 评估2023年5月在我国（不含香港、澳门特别行政区和台湾地区，下同）发生或者可能由境外输入的突发公共卫生事件风险。方法 根据国内外突发公共卫生事件报告及重点传染病监测等各种资料和部门通报信息，采用专家会商法，并通过视频会议形式邀请省（自治区、直辖市）疾病预防控制中心专家参与评估。结果 预计2023年5月突发公共卫生事件报告数可能较4月增多，以新型冠状病毒感染、水痘、诺如病毒肠炎和手足口病等传染病类事件为主。我国本土新型冠状病毒感染疫情在2023年4月上旬达到2022年11月以来的最低水平，4月中下旬疫情开始出现上升趋势，XBB进化分支病毒已成为我国疫情主要流行株，预计再感染疫情将逐渐增多，但出现对医疗和社会冲击的规模性疫情可能性则较小。目前全国手足口病整体疫情处于快速上升初期，预计5月疫情将上升。根据既往趋势预测，5月开始进入食物中毒事件高发期。结论 对新型冠状病毒感染予以特别关注，对食物中毒和手足口病予以一般关注。