IGKC在泛癌中的差异表达及其相关临床特性分析

目的 通过生物信息学方法了解癌组织中免疫球蛋白轻链kappa恒定区(immunoglobulin kappa constant, IGKC)功能,并从临床角度认识IGKC在癌症发生发展中所扮演的角色。方法 使用UCSC、TCGA、GTEx、GEPIA2等数据库从基因表达、预后分析、基因变异、免疫细胞分析、肿瘤干性、富集分析等角度对不同癌组织中的IGKC进行全面分析。结果 大多数癌组织中的IGKC表达水平显著高于正常组织,IGKC表达水平显著升高与部分肿瘤患者预后、基因变异、肿瘤干性和免疫细胞浸润相关。IGKC相互作用基因和共表达基因参与了T细胞受体信号通路、癌症中PD-L1表达和PD-1检查点通路和Th1、Th2和Th17细胞分化通路等多种信号通路。另外,这些基因也参与了免疫应答、结合U1/2/6 snRNP和结合T细胞受体等多种生物过程。结论 IGKC在多种癌组织中高表达,在多种癌的4个病理阶段具有显著差异,与患者预后之间存在相关性,IGKC有望成为多种癌症新型生物标志物。