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目的 探讨肝癌细胞中CXCL3的表达与氧化应激水平的关系。方法 生物信息学分析CXCL3在肝癌组织和正常组织中的表达差异,其表达情况与生存率的关系,并筛选与CXCL3表达相关的氧化应激基因。过氧化氢对肝癌细胞SMMC-7721进行氧化应激刺激后,qRT-PCR检测CXCL3表达变化。建立CXCL3高表达和CXCL3低表达的肝癌细胞模型,利用CCK-8实验检测细胞增殖情况,利用酶联免疫吸附试验、Western Blotting法等检测细胞中的超氧化物歧化酶(SOD)、丙二醛(MDA)、血红素氧合酶(HO-1)。结果 对TCGA数据库的生物信息学分析可以发现,CXCL3在肝癌组织的转录水平与正常组织比较差异无统计学意义(t=0.864,P=0.075);CXCL3高表达患者与CXCL3低表达患者相比,总生存率较低(P=0.001);肝癌组织中有7个与CXCL3表达相关的氧化应激基因;过氧化氢刺激后肝癌细胞CXCL3表达降低(200μmol/L时t=3.275,P=0.004;400μmol/L时t=5.162,P<0.001)。高表达CXCL3的细胞增殖能力增强(t=4.180,P&... 相似文献
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目的:研究CC趋化因子配体20 (CCL20)在肝细胞肝癌(LIHC)组织中的表达,并探讨其对LIHC患者预后的影响,阐述CCL20影响LIHC恶性行为的机制。方法:采用Rstudio (4.03)软件从癌症基因图谱(TCGA)和UCSC Xena平台获取LIHC患者癌组织和癌旁组织中CCL20 mRNA表达水平和临床数据,比较CCL20 mRNA在2种组织中的表达差异,并利用GEPIA联合GTEx数据对上述结果进行验证;采用Kaplan-Meier生存分析和Cox回归分析法分析CCL20 mRNA表达水平与LIHC患者预后的关系。通过Pearson相关分析对LIHC患者CCL20 mRNA表达水平与甲胎蛋白(AFP)水平的相关性进行分析,并通过受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)、诺谟图和校正曲线分析LIHC患者CCL20 mRNA表达水平与患者临床诊断和生存预测情况的相关性。采用TCGA数据库对LIHC患者癌组织中CCL20 mRNA的表达进行基因集富集分析(GSEA),分析CCL20 mRNA表达水平与DNA拷贝数突变和DNA甲基化水平的相关性。结果:与癌旁组织比较,LI... 相似文献
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目的：基于生物信息学分析蛋白激酶Cδ(PKCδ,PRKCD)在肝细胞癌组织中的表达及临床意义,以期为寻找肝细胞癌的临床诊疗潜在分子标志物和靶点提供参考。方法：利用The Cancer Genome Atlas(TCGA)和UCSC Xena平台获取肝细胞癌和癌旁组织中PRKCD的mRNA表达量和临床数据,比较PRKCD mRNA在两组样本中的表达差异;利用Human Protein Atlas数据库分析PRKCD蛋白在肝细胞癌和癌旁组织中的表达差异;利用TCGA分析PRKCD mRNA表达与肝细胞癌临床病理特征和预后的相关性;利用TCGA数据库对肝细胞癌中PRKCD表达进行GSEA富集分析,并从遗传和表观遗传学的观点分析PRKCD表达变化的原因。结果：PRKCD在肝细胞癌组织中的mRNA和蛋白质水平均显著高于癌旁组织;PRKCD表达与TNM分期、组织学级别、甲胎蛋白含量和患者生存状态相关,并且其表达水平具有一定的临床诊断准确性;Kaplan-Meier分析显示PRKCD低表达患者的预后显著优于高表达患者;单因素和多因素Cox回归分析显示,PRKCD是肝细胞癌患者独立预后因素,且TNM为... 相似文献
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