肿瘤全基因组关联研究的现状与挑战

全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)是目前复杂性疾病遗传易感性研究最有效的研究设计,其通过高通量的基因分型平台,在基因组范围内根据连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)原理同时选择几十万甚至上百万个标签位点(tagging SNP,tSNP)进行检测,这种设计的特点是没有预设的研究假设(hypothesis free),对基因组常见变异覆盖率较高,要求病例-对照研究样本量较大(1000对以上),并辅以多个独立的研究进行后期的验证.     

新医科背景下的预防医学教育改革思考

人才培养是公共卫生体系建设的核心和基石,新型冠状病毒肺炎疫情暴露出的疾病预防与公共卫生领域人才匮乏问题,更突显了改革发展预防医学教育的重要性。本文分析了"医防分离"现实困境中医学教育面临的挑战,以及健康中国战略下新医科建设对预防医学教育提出的新要求,从加大预防医学教育资源配置和投入力度、培养"顶天立地"的公共卫生专业人才、实施公共卫生核心能力的全体医学生教育、建立健全预防医学继续教育制度等四个方面进行了思考,并提出建立全链条闭环的研究体系支撑公共卫生拔尖创新人才培养、加强临床医学专业执医准入的公共卫生核心能力考核、制定"医防融合"的基层卫生人才培养方案、实施"平战结合"模式下的公共卫生人才预备役制度等一系列具体建议,以期对我国预防医学教育改革发展提供参考。     

染色体1q22区域遗传变异影响胃癌易感性的生物学机制研究

  目的  探索染色体1q22区域易感基因在胃癌发生中的作用和机制。  方法  基于genotype-tissue expression（GTEx）数据库,鉴定候选易感基因;通过人群样本进行基因差异表达分析,并通过细胞和动物实验探究易感基因在胃癌发生中的作用;通过全转录组测序探究候选易感基因在胃癌发生中参与的下游通路和机制。  结果  表达数量性状基因座（expression quantitative trait loci,eQTL）分析证实rs760077基因型与THBS3、GBA和GBAP1基因的表达水平均显著相关（P值分别为1.20×10-21,1.80×10-4和3.49×10-17）。差异表达分析和功能学实验证实GBAP1在胃癌组织中呈现高表达状态,并且敲低GBAP1后能够显著抑制胃癌细胞增殖能力。全转录组测序表明GBAP1能够影响PHGDH、PSAT1和PSPH基因的表达水平并参与包括甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸代谢和一碳代谢在内的多种代谢通路。  结论  本研究证实1q22区域的遗传变异可以通过调控促癌基因GBAP1的表达,影响氨基酸合成代谢通路关键酶基因PHGDH、PSAT1和PSPH的表达,从而促进胃癌的发生。      

中国国家出生队列研究质量控制策略与措施

出生队列是研究孕前和孕期各种环境暴露因素与胎儿、婴幼儿、青少年健康之间关系的有效方法。出生队列建设周期长、环节众多,研究质量可能受到多种因素的影响。本文对中国国家出生队列建设过程中的各项质量保证和质量控制措施进行梳理,归纳总结建设经验。以期为相关队列研究提供经验,减少相关因素对队列研究的影响,提升队列研究质量。中国国家出生队列在质量保证的顶层设计方面采取一系列措施保障研究质量,包括研究中心筛选、成员管理系统开发、标准化操作流程制定及工作人员规范化培训;在质量控制方面,包括针对队列数据产生过程的实时、及时、定时质控,针对生物样本采集、处理及保存的全周期质控,以及针对参与工作人员的培训、督查和量化考核的全面立体质控。     

核苷酸切除修复通路基因多态性与肺癌易感性研究

目的研究显示核苷酸切除修复通路在去除吸烟引起的DNA损伤中发挥着重要的作用,旨在探讨核苷酸切除修复通路单核苷酸多态性与吸烟相关性肺癌易感性的关系。方法选取1010例肺癌患者和1011例正常对照。采用基于通路的候选基因选点策略,从核苷酸切除修复通路相关的8个核心基因中筛选出40个标签SNPs进行检测和分析。结果单个位点分析发现6个SNPs（ERCC1 2个,DDB2 2个,ERCC4／XPF 1个,XPC 1个）与肺癌的易感性相关。进一步采用Logistic回归模型,调整年龄、性别、吸烟史和肿瘤家族史后,仍有3个SNPs（ERCC1 rs3212948,DDB2 rs830083,ERCC4 rs3136038）与肺癌易感性存在统计学关联。等位基因联合分析结果进一步表明肺癌的发病风险随着风险等位基因个数的增加而增加,尤其是ERCC1,ERCC2,ERCC3,ERCC5,XPA和XPC。结论本研究结果提示核苷酸切除修复通路基因多态性可能与中国汉族人群的肺癌个体易感性有关,值得进一步进行功能学探讨及大样本人群验证.     

IGF1和IGFBP3多态性与乳腺癌易感性的Meta分析

[目的]综合分析胰岛素生长因子1(Insulin-likegrowthfactor1,IGF1)和胰岛素样生长因子结合蛋白3(Insulin-likegrowthfactorbinding-protein3,IGFBP3)多态性和乳腺癌易感性关系。[方法]采用固定效应和随机效应模型进行Meta分析,研究IGF1(CA)n和IGFBP3(A-202C)多态性和乳腺癌患病风险的关联。[结果]本文研究共包括关于IGF1(CA)n的6个和IGFBP3(A-202C)的4个独立研究。累计病例对照数分别为3053和3391;2793和4136。研究发现,位于IGF1启动子上游1Kb左右的(CA)n重复序列,对比于携带野生型的(CA)19基因型,非携带(CA)19基因型[non19/non19 non19/19]并不增加乳腺癌的发病风险[OR=0.99,95%CI=0.87￣1.12]。对于IGFBP3(A-202C)多态性,我们分别做了显性模型和隐性模型,两个模型OR值分别为1.01(0.91￣1.31)和1.03(0.82￣1.30)。两多态性[IGF1(CA)n和IGFBP3(A-202C)]研究均无发表偏倚(分别为α=2.11,P=0.06和α=-8.40,P=0.47)。[结论]IGF1(CA)n的多态性和IGFBP3启动子区A-202C的多态性改变与乳腺癌的发病风险均不存在明显的关联。     

中国国家出生队列建设背景和设计简介

随着生活行为方式、自然和社会环境的急剧变化,育龄人口生殖健康状况持续下降,快速增加的由辅助生殖技术（ART）孕育的子代的远期健康状况亟待评估。因此,妇幼保健和生殖健康相关研究关注的重点亟需从妊娠期、围产期的死亡和严重疾病表型逐渐向全生命周期和全疾病谱拓展。为了满足这样的研究需求,在我国12个省（自治区、直辖市）启动了中...     

孕中晚期胎儿宫内生长的影响因素研究

目的:探讨影响胎儿孕中晚期宫内生长的母体和孕期相关因素.方法:收集在南京医科大学附属妇产医院产检并分娩的孕妇孕期B超监测数据及母体和孕期健康相关信息.纳入在2016年8月-2019年5月孕满20周并在孕22～24周、孕30～32周和孕34～36周均有B超检查的单胎活产家庭,共计1457个家庭.本研究通过B超采集的胎儿双...     

新型冠状病毒肺炎疫情对重大传染病疫情防控信息采集的启示

完整、准确、及时和开放的数据对重大传染病疫情防控决策的制定至关重要。本文基于突发公共卫生事件应对理论和传染病传播理论, 围绕控制疫情播散、救治在院病例和后勤保障3项核心工作, 系统梳理了重大传染病疫情防控决策中所需关键信息及其在本次新冠肺炎疫情中的采集现状。针对本次疫情防控中暴露出的主要数据采集问题, 提出4条建议:(1)进一步完善现有传染病网络直报系统和突发公共卫生事件报告管理信息系统; (2)尽快全面规范医疗机构临床诊疗信息的采集工作; (3)制定重大传染病疫情决策所需核心信息采集规范、应用平台技术标准和管理架构; (4)尽快推进数据开放和共享, 提高数据的使用。     

肿瘤全基因组关联研究的现状与挑战

全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)是目前复杂性疾病遗传易感性研究最有效的研究设计,其通过高通量的基因分型平台,在基因组范围内根据连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)原理同时选择几十万甚至上百万个标签位点(tagging SNP,tSNP)进行检测,这种设计的特点是没有预设的研究假设(hypothesis free),对基因组常见变异覆盖率较高,要求病例-对照研究样本量较大(1000对以上),并辅以多个独立的研究进行后期的验证.