小鼠原始卵泡形成过程中可变剪切的动态变化

目的：通过对新生小鼠卵巢单个生殖细胞转录组数据进行挖掘,探究可变剪切事件是否参与调控小鼠卵泡组装过程的阶段转换。方法：基于小鼠单个生殖细胞转录组数据,用生物信息学方法分析卵泡组装过程3个细胞发育阶段的可变剪切事件及阶段转换之间的差异可变剪切事件,并用PCR验证差异可变剪切相关同源异构体的变化。结果：在小鼠卵泡组装3个发育阶段转换之间均检测到差异可变剪切事件,其中卵泡生成阶段可变剪切事件以及包囊破裂到卵泡生成时期的差异可变剪切事件富集最多,PCR验证了减数分裂相关同源异构体的变化。结论：可变剪切和小鼠卵泡组装细胞发育阶段转换相关,调控生殖细胞到卵母细胞转变过程。     

多物种A-to-I编辑事件的可视化注释数据库

目的 构建涵盖多物种,并提供精确、可视化注释信息的A-to-I编辑事件的数据库.方法 用多种方法收集9个项目中包含7个物种超过230万个RNA编辑位点,将数据整合并上传至MySQL数据库.利用Django、Boot-strap和Echarts等框架,在阿里云服务器搭建数据库平台.结果 dbRED数据库(https://...