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目的:构建食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)中miRNA-mRNA的调控网络,对候选基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,为ESCC发生发展的分子机制研究提供一定的理论指导。方法:从GEO数据库中筛选ESCC组织中的差异表达miRNA(differentially expressed miRNA,DE miRNA)和差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并用在线数据库预测调控DE miRNA的靶基因。对DE miRNA的靶基因及DEGs取交集得到候选基因,使用DAVID在线数据库对其进行GO富集分析和KEGG分析,并运用GEPIA网站进行生存分析。结果:筛选出4个DE miRNA(miR-34c-5p、miR-944、miR-133b、miR-139-5p),分析DE miRNA在ESCC组织和正常食管组织中的表达情况。候选... 相似文献
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