深圳地区男男同性恋人群中HIV-1分子流行病学研究

目的 了解深圳地区男男同性恋人群中艾滋病病毒-Ⅰ型(HIV-1)毒株的分子流行情况,帮助分析HIV-1在该人群中传播的危险因素.方法 收集深圳市2006年男男同性恋人群中HIV-1确认为阳性的样本18例,应用套式聚合酶链式反应(Nested-PCR)技术,对该样本膜蛋白基因(env基因)和核心蛋白基因(gag基因)进行扩增,并对各基因区核苷酸序列进行测定和分析.结果 18份样本中共存在CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC 3种重组毒株及B 一种亚型,分别占55.56%(10/18)、16.67%(3/18)、5.56%(1/18)和22.22%(4/18);在env基因区与对应的流行代表株01_AE.TH.90.CM240、07_BC.CN.97.97CN001、08_BC.CN.97.97CNGX_9F、B. US. 86. JRFL的基因离散率分别为(8.778±1.296)%、(7.650±0.212)%、11.300%和(13.300±0.819)%;CRF01_AE、CRF07_BC重组株和B亚型组内离散率分别为(10.192±4.179)%、(2.000±0.000)%和(14.367±8.812)%;在gag基因区与对应的流行代表株01_AE.TH.90.CM240、07_BC.CN.97.97CN001、08_BC.CN.97.97CNGX_9F、B. FR. 83. HXB2的基因离散率分别为(5.070±1.132)%、(2.167±0.551)%、4.800%和(7.350±1.926)%;CRF01_AE、CRF07_BC重组株和B亚型组内离散率分别为(4.504±1.692)%、(0.700±0.346)%和(10.167±4.352)%.结论 深圳地区男男同性恋人群HIV-1流行株以CRF01-AE重组亚型为主,其次是B亚型,也存在CRF07_BC和CRF08_BC重组亚型.     

吸毒人群和HIV-1感染者人群DC-SIGN/DC-SIGNR基因多态性分析

目的 研究等位基因DC-SIGN/DC-SIGNR在人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV-1)感染者与HIV-1阴性吸毒人群中的分布,筛选出HIV-1抗性基因.方法 选择深圳市戒毒所HIV抗体阴性戒毒者的样本257份,HIV-1感染者的样本220份.提取外周血基因组DNA,对DC-SIGN/DC-SIGNR颈区基因进行特异性聚合酶链反应(PCR)扩增,PCR扩增产物行琼脂糖凝胶电泳检测和基因序列测定分析.结果 通过统计学分析发现,DGSIGNR颈区中杂合子7/5、7/6和7/7在HIV阴性吸毒者中出现的频率为13.33%、7.50%、49.4%,在HIV-1感染者中出现的频率为11.05%、4.65%、51.74%,两者无明显差异.说明DC-SIGN在吸毒者与HIV-1感染者中的基因型及等位基因的分布无明显差异.结论 深圳市吸毒人群中DC-SIGNR和DC-SIGN基因型分布和等位基因出现频率,与HIV-1感染者无显著性差异,推测DC-SIGNR和DC-SIGN基因多态性对HIV-1易感性无明显影响.     

深圳市孕产妇人群中AIDS流行情况及母婴传播的预防与控制

目的 了解深圳市孕产妇人群中艾滋病(AIDS)流行率及艾滋病病毒(HIV)母婴垂直传播发生率。以及通过采取综合性预防策略降低母婴传播的发生率。方法 对所有产前保健检查的孕妇，在首诊时进行自愿咨询和免费HIV抗体筛查；对HIV抗体阳性的孕产妇实施综合性干预；应用逆转录．聚合酶链式反应(RT-PCR)、套式PCR和基因芯片技术对其新生儿的HIV感染状况进行早期诊断。结果 2001～2003年4月，分别有8021、69976、23413名孕产妇接受了AIDS自愿咨询检测，分别发现2、10、4例HIV感染者，发生率分别为2．49/万、1．43/万、1．71/万。16名HIV感染孕产妇中，经性接触传播占81．3％(13／16)，经血液传播占18．7％；有3人其配偶为HIV抗体阳性。4名孕妇终止妊娠(25．0％)，6名产妇接受产后干预(37．5％)，失访2名，转外地1名。2名接受综合性干预后分娩，1名正接受随访和干预；1例新生儿证实为垂直传播感染(1／8，12．5％)。结论 通过对孕产妇人群提供AIDS自愿咨询检测服务和对该人群中的HIV感染者采取综合性干预措施，可有效防止和降低HIV母婴传播的发生率，提示将健康教育、行为干预和婚前咨询检查与母婴传播预防控制策略相结合，可取得良好的防制效果。     

深圳部分吸毒人群HIV感染者HIV-1分子流行病学调查

目的对深圳市2008年吸毒人群进行HIV-1分子流行病学调查研究,了解本地区吸毒人群HIV-1流行情况、亚型种类、毒株来源、变异情况等,为预防和控制HIV在吸毒人群中的流行提供有价值的资料。方法收集深圳市2008年份吸毒人群HIV-1抗体阳性样本21例,应用巢式聚合酶链式反应（nested—PCR）技术,对该样本膜蛋白基因（env基因）和核心蛋白（gag基因）进行扩增,并对其各基因区核苷酸序列进行测定和分析。结果21例HIV-1阳性样本中共存在CRF01-AE 1种重组毒株以及A11种亚型,其在所有分析样本中的比例分别为90．5％和9．5％;其中12份Env基因样本中,10份为CRF01-AE重组亚型,与国际参考株01AE．TH．90．CM240最近,基因离散率为（9．910±2．432）％,组内离散率为（12．747±3．066）％;2份为A1亚型,与国际参考株a1．gu.92．92ug037最近,基因离散率为（17．15±0．354）％,组内基因离散率0．900％。21份Gag基因样本中,19份为CRF01-AE重组亚型,与国际参考株01AE．TH．90．CM240最近,基因离散率为（5．083±1．341）％,组内离散率为（6．072±1．968）％;2份A1亚型,与国际参考株01ae．en．97．97cngx2f最近,基因离散率为（11．550±0．636）％,组内离散率为2．200％。结论2008年深圳地区HIV-1抗体阳性吸毒人群中HIV-1流行株以CRF01-AE重组亚型为主,并首次在深圳地区吸毒人群中发现A1亚型。     

用mRNA差异显示方法筛选HIV/HCV合并感染者差异表达基因

目的 建立信使RNA(messenger RNA,mRNA)差异显示技术平台,寻找艾滋病病毒/丙型肝炎病毒(HIV/HCV)合并感染者差异表达基因.方法 分离正常人、HIV感染者、HCV感染者及HIV/HCV合并感染者的外周血单核细胞,提取RNA,定量后利用锚定引物进行逆转录合成cDNA,然后利用10对随机引物及锚定引物进行PCR扩增,行6%变性PAGE凝胶电脉,银染后分析结果,回收差异条带测序.通过SYBRgreen实时荧光定量PCR以β-actin为内参,进行大量人群样本的定量分析鉴定.结果 共筛选出107条差异表达条带,其中大部分是感染者与正常人之间的差异显示条带.已鉴定6个序列,其中2个序列是未知功能基因,3个序列为锌指蛋白141(RNF141),1个序列为环磷酸腺苷磷酸化蛋白(ARPP-19)基因.经过对超过10份病人血样RNF141荧光定量PCR初步鉴定,在HIV/HCV合并感染者、HCV感染者中,RNF141的表达水平高于正常人.结论 RNF141与HIV/HCV合并感染及HCV感染可能存在一定相关性,同时证明,利用mRNA差异显示方法可以筛选出与HIV/HCV合并感染或单独感染相关的差异表达基因.     

DC-SIGNR基因多态性与人类免疫缺陷病毒-1易感性的关联研究

目的 探索DC-SIGNR基因多态性对中国汉族人群人类免疫缺陷病毒-1(human immunodeficiency virus-1,HIV-1)病毒易感性的影响.方法 用聚合酶链反应、琼脂糖凝胶电泳结合测序对345例HIV-1血清阳性感染者及468例H1V-1血清阴性高危人群的DC-SIGNR基因绞链区重复序列分型,然后用卡方检验检测DC-SIGNR基因各亚型在不同人群组中出现的频率.结果 共发现DC-SIGNR基因14个基因型和5种等位基因,其中等位基因7出现的频率最高(67.1%),明显高于美国白人(67.1% vs.46.0%,P<0.01).HIV-1感染组7/7基因型的出现频率明显低于高危人群组(38.55% vs.48.29%,P=0.0057),而HIV-1感染组的9/5基因型的出现频率明显高于高危人群组(4.35% vs.1.07%,P=0.0029).结论 中国人群DC-SIGNR基因多态性分布有着独特的遗传学特征,中国人群中DC-SIGNR基因型9/5可能增加对HIV-1的易感性.     

2009-2011年深圳市头孢曲松低敏淋病奈瑟菌的流行特征

目的 调查2009-2011年深圳市头孢曲松低敏淋病奈瑟菌(淋球菌)流行的基因型和特征.方法 收集2009至201 1年深圳市淋球菌296株,采用琼脂稀释法筛选出头孢曲松低敏株(最小抑菌浓度为0.06 ～0.50 μg/ml),用logistic回归分析方法,分析与头孢曲松低敏淋球菌感染相关的因素;根据1∶1抽样原则抽取出高敏菌株,与低敏菌株一起进行淋病奈瑟菌抗原序列分析(NG-MAST)基因分型和邻接法(neighbor-joining,NJ)进化树分析.结果 在296株淋球菌中,未发现头孢曲松耐药菌株,头孢曲松低敏菌株53株(17.9％).近2个月的抗生素使用史与头孢曲松低敏淋球菌感染相关(OR=3.080,95％ CI:1.376 ～6.894).53株低敏株的NG-MAST共得到48个ST型,由5个成簇的ST(ST1768、ST3927、ST641、ST7076、ST7078各包含了2株淋球菌)和43个单一的ST构成,其中26个ST型中国香港等地曾有报道.NJ进化树未观察到低敏株单独成簇的情况.结论 深圳市2009-2011年分离到的296株淋球菌中头孢曲松低敏株的比例较高;深圳市头孢曲松低敏淋球菌菌株的流行可能有其独特的特点.     

2013—2017年深圳市非结核分枝杆菌流行状况分析

目的 分析深圳市非结核分枝杆菌(NTM)的流行状况,为NTM病防控策略提供依据。方法 搜集2013—2017年深圳市慢性病防治中心和各区慢性病防治院收治的37630例疑似肺结核患者,对上述患者进行痰分枝杆菌培养(BACTEC MGIT 960和改良罗氏法)检出阳性菌株8850株,采用MPB64免疫胶体金法和对硝基苯甲酸生长试验进行结核分枝杆菌复合群和NTM的初步菌种鉴定,对初步菌种鉴定为NTM的菌株应用HAIN基因分型鉴定法进行NTM菌种鉴定。分析NTM菌株在不同年度、性别、年龄、感染类型、地区来源、户籍来源,以及NTM不同种类菌株的分布特征。率的比较采用χ ²检验,以P<0.05为差异有统计学意义。 结果 8850株分枝杆菌培养阳性菌株中,初步菌种鉴定获得366株NTM菌株,检出率为4.14%(366/8850);HAIN基因分型鉴定法确定293株NTM菌株的菌种,鉴定率为80.05%(293/366)。2013—2017年深圳市NTM的检出率呈轻微上升趋势[3.81%(71/1864)~4.50%(82/1821)],但各年度间差异无统计学意义( {\chi }_{\mathit{趋势}}^2 =1.159,P=0.885)。366例NTM感染患者中,女性患者的检出率[4.87%(144/2957)]明显高于男性患者[3.77%(222/5893)](χ ²=6.038,P=0.014);感染的高峰年龄均为25~34岁,分别占28.83%(64/222)和23.61%(34/144),差异无统计学意义(χ ²=1.213,P=0.271)。初治患者、郊区患者、流动人口患者、郊区流动人口患者的NTM检出率 [分别为2.31%(187/8104)、1.77%(105/5909)、3.89%(324/8323)、1.61%(91/5663)]明显低于复治患者[23.99%(179/746)]、市中心患者[8.87%(261/2941)]、户籍人口患者 [7.97%(42/527)]、城区流动人口患者[8.77%(235/2681)](χ ²=810.400、249.512、20.778、248.418,P值均=0.000)。293株NTM分离株中,构成比占前3位者依次为脓肿分枝杆菌[41.64%(122/293)]、鸟-胞内分枝杆菌[22.18%(65/293)]、堪萨斯分枝杆菌[16.04%(47/293)];另外,发现7例[2.39%(7/293)]混合感染类型。 结论 深圳市近几年NTM检出率稳定,分布种类多样,以脓肿分枝杆菌、鸟-胞内分枝杆菌和堪萨斯分枝杆菌为主;多见青壮年感染者,需重点关注女性、复治患者,以及来自市中心、户籍人口、城区流动人口患者的流行情况。     

深圳地区1992--2008年HIV-1分子流行病学研究

目的 了解1992-2008年深圳地区HIV-1亚型的流行特点.方法 抽取1992-2008年深圳地区HIV确认阳性患者血清489份,应用巢式PCR扩增膜蛋白基因(env基因),并对PCR产物进行序列测定和分析.结果 共有464份样本获得分型结果,主要为CRF01 AE亚型(64.4％,299/464),其次是CRF BC( 17.5％,81/464)、B'(14.7％,68/464)和B亚型(2.4％,11/464),还发现C(0.4％,2/464)、A1 (0.2％,1/464)、CRF02_AG(0.2％,1/464)和CRF06_cpx (0.2％,1/464)亚型/重组亚型.CRF01 AE和CRF BC主要流行于异性性传播、同性性传播和静脉吸毒人群,B'亚型主要经异性、同性性传播和血液传播.另外经系统进化分析发现,不同时间段的样本出现明显的时间汇聚现象,并伴随传播途径的聚集以及交叉感染现象;各亚型/重组株样本组内及与标准参考株间的基因离散率随着时间的增加有明显增大趋势.结论 CRF01 AE重组株是深圳地区HⅣ-1的主要流行株,CRF_BC、B、B'、C、A1和CRF02_AG、CRF06_cpx亚型/重组亚型也在深圳地区少量流行,各亚型在流行过程中发生较大变异.     

五种不同沙眼衣原体实验室筛查试剂检测性能评价

目的通过对不同商品化沙眼衣原体(CT)检测试剂的检测结果,与Roche Cobas Amplicor检测结果的分析比较,评价5种沙眼衣原体检测试剂的性能。方法采用分层按比例的方法抽取32家医疗机构,收集各抽样单位2009年9月至11月期间,皮肤(性病)科、妇产科、泌尿科门诊就诊者的泌尿生殖道标本1 986人份。比较各个医疗机构采用的检测方法与Roche Cobas Amplicor检测方法所得检测结果,分析各不同检测试剂的特异度和灵敏度。结果共对1 986例样本进行了Roche Cobas Amplicor沙眼衣原体核酸检测,沙眼衣原体阳性为367例(18.48%)。3种免疫层析法(ICA)检测试剂中,ICA1(国产)、ICA2(国产)、ICA3(进口)灵敏度分别为34.48%、15.22%、52.53%;特异度分别为99.45%、98.04%、98.93%;阳性预测值(Positive predictive value,PPV)分别为93.75%、63.64%、92.86%;阴性预测值(Negative predictive value,NPV)分别为86.36%、83.68%、88.73%。2种聚合酶链反应(PCR)法检测试剂中,PCR1(国产)、PCR2(国产)灵敏度分别为70.09%、96.43%;特异度分别为99.44%、100.00%;阳性预测值分别为96.15%、100.00%;阴性预测值分别为94.34%、99.31%。用免疫层析试剂检测的四种样本间的敏感性和特异性有明显差异;PCR检测方法中,各类型标本的评价相近。结论不同公司生产的免疫层析检测试剂的性能存在显著差异,且总体水平均低于PCR法检测试剂。另外,不同类型标本对沙眼衣原体的检测也有影响,免疫层析法检测试剂较适用于女性阴道拭子和宫颈拭子标本的检测。