2012－2016年北京市胸科医院肺结核合并症患者的回顾性分析

目的 对北京市胸科医院住院肺结核患者合并症情况进行回顾性分析,为改善结核病的诊断和治疗提供参考。方法 收集于2012－2016年间初次住院的艾滋病病毒抗体检测阴性、年龄>15岁的肺结核患者的病历资料,分析肺结核合并症谱、主要合并症的时间、人群分布特征。结果 共纳入初次住院的肺结核患者9 653例。8种肺结核合并症包括营养不良（19.49%,1 881/9 653）、2型糖尿病（19.18%,1 851/9 653）、贫血（16.70%,1 612/9 653）、白细胞减少症（3.53%,341/9 653）、病毒性肝炎（3.46%,334/9 653）以及与呼吸系统相关的肺癌（1.65%,159/9 653）、慢性阻塞性肺疾病（1.61%,155/9 653）、矽肺（0.81%,78/9 653）均为老年组（≥60岁）高于中青年组（<45岁和45～59岁）（P<0.05）;男性组高于女性组（P<0.05）;除白细胞减少症和病毒性肝炎外,其他均为无业组高于在职组（P<0.05）。结论 该结核病专科医院肺结核的主要合并症为营养不良、2型糖尿病、贫血。男性、年龄≥60岁的肺结核患者易出现合并症。应规范肺结核合并症患者的诊疗研究,提高对复杂肺结核病的诊断治疗水平。     

中国结核分枝杆菌谱系2群体遗传学研究

目的 研究中国流行的结核分枝杆菌谱系2的遗传结构和地理分布,为制定结核病防控策略提供科学依据。方法 采用标准15位点分枝杆菌散在重复单位-数目可变串联重复序列（variable number tandem repeats,VNTR）技术对来自全国31省市抽样调查的2 900株结核分枝杆菌谱系2进行基因分型。基于上述菌株15-VNTR数据,采用贝叶斯聚类法STRUCTURE进行群体遗传结构分析;构建邻接（Neighbor-Joining,NJ）树和最小生成树（Minimum Spanning Trees,MST）进行群体遗传分化分析。运用主成分分析（principal component analysis,PCA）验证。结果 STRUCTURE分析显示谱系2可分为4个亚群;MST拓扑结构提示亚群2位于奠基者位置,较古老;其他亚群（亚群1、3、4）位于分枝位置,较现代。亚群2主要分布于西南地区和东北三省;亚群1,3,4主要分布于我国东中部地区,推测由于人口的迁徙,造成菌株间遗传距离较近,由东北地区向东中部地区传播。主成分分析显示4群菌株分化不明显。结论 结核分枝杆菌谱系2可分为4个亚群,各亚群的遗传地理分布不同,上述结果对制定我国精准结核病防控策略将产生积极影响。     

四对结核分枝杆菌毒素-抗毒素系统基因功能的初步研究

目的探讨结核分枝杆菌毒素-抗毒素(toxin-antitoxin,TA)系统中的4对基因的功能,为研究结核分枝杆菌的传播机制提供基础科学数据。方法选取结核分枝杆菌TA系统VapBC家族中4对基因,包括VapC 4个毒素基因(Rv1720c、Rv2103c、Rv2494和Rv3408)和VapB4个抗毒素基因(Rv1721c、Rv2104c、Rv2493、Rv3407),在大肠杆菌和耻垢分枝杆菌中分别构建严谨型阿拉伯糖诱导质粒体系及乙酰胺诱导穿梭质粒体系观察VapC对细菌生长的抑制作用,及其对应的VapB解除抑制作用。结果在大肠杆菌和耻垢分枝杆菌的实验结果一致,Rv2103c具有一定抑制作用和Rv2104c具有消除抑制作用,其余3对毒素-抗毒素基因未见到明显的对细菌生长的抑制和消除抑制的作用。结论成功构建了VapBC家族在大肠杆菌及耻垢分枝杆菌中的表达体系,并发现了一对TA系统基因对细菌生长的抑制和消除抑制的作用。     

二甲双胍对肺结核合并2型糖尿病患者辅助治疗的横断面研究

目的 探讨二甲双胍在抗结核治疗及结核病灶愈合过程中的辅助作用。方法 从2012 年1月1日—2016年12月31日北京胸科医院收治的肺结核合并2型糖尿病患者1 851例中随机抽取患者,依据使用二甲双胍、胰岛素等降糖药的不同将患者分组：未使用任何降糖药物（组一）;未使用二甲双胍+使用胰岛素以及其他降糖药（组二）;只使用二甲双胍（组三）;使用二甲双胍+胰岛素或其他降糖药（组四）。分析每组患者基本信息（年龄、性别、职业）、生化检查以及影像学特点。计数资料使用χ2检验,计量资料使用t检验。结果 共纳入515例患者,四组分别为156例,247例,19例和93例。四组患者在性别、年龄、职业分布上差异无统计学意义（P>0.05）。四组糖化血红蛋白差异有统计学意义（P <0.05）,其中单纯使用二甲双胍组血糖控制在正常范围内的患者比例远高于其他三组。胸部影像学复查结果,使用二甲双胍的组三与组四在左肺与右肺的病变比例分别为68.4%、63.2%和43.0%、39.8%,低于未使用二甲双胍的组一（85.3%、84.0%）和组二（83.4%、82.6%）,并且单纯使用二甲双胍组结核空洞闭合比例比其他组高,组一组二空洞未闭合或增多的比例高于组三、组四,四组出现结核病灶和空洞的差异有统计学意义（P<0.05）。结论 降糖药二甲双胍对于抗结核治疗和结核病灶的愈合有辅助作用,有利于近期血糖的控制,促进结核空洞的闭合。     

肺结核患者治愈后肺内残留的非活动性结核病灶的CT特征研究

目的: 探讨肺结核治愈后肺内残留的稳定的非活动性结核病灶的分布、CT特点及其在长时间无医疗干预情况下的演化情况。方法: 采用回顾性队列分析的方法,搜集2017年5月至2020年7月首都医科大学附属北京胸科医院符合入组标准的100例患者的两次随访CT资料,对两次资料中肺内非活动性病灶的分布、CT形态和特点,以及两次CT中的病灶演化特点进行归纳和分析。结果: 100例肺结核治愈患者最常见的肺内非活动性病灶征象为索条(88.0%)、结节(67.0%)和斑片(63.0%)。人均可检出结节病灶6.5(1.0,8.3)个、斑片病灶1.6(1.0,2.0)个。可见钙化表现、与胸膜粘连、边缘存在索条的结节、斑片及条片病灶发生率分别为92.6%(403/435)、52.9%(54/102)及81.0%(17/21),72.2%(314/435)、93.1%(95/102)及100.0%(21/21),76.6%(333/435)、96.1%(98/102)及100.0%(21/21)。结节、斑片、条片病灶在随访前后两次的检查中横断最大径[6.97(5.44,10.47)mm和6.72(4.87,9.67)mm,18.30(10.67,30.46)mm和16.00(9.59,30.76)mm,42.30(21.63,74.90)mm和41.75(18.75,73.37)mm]和病灶体积[18.03(14.86,77.89)mm³和16.10(14.02,55.04)mm³,201.57(61.02,633.55)mm³和144.29(58.68,612.75)mm³,3224.00(410.50,5265.00)mm³和3138.25(302.08,3865.50)mm³]均显著减少(Z=-10.289,P<0.001;Z=-3.658,P<0.001;Z=-2.312,P=0.021;Z=-7.524,P<0.001;Z=-3.334,P=0.001;Z=-2.194,P=0.028),且结节和斑片的病灶CT均值[157.01(126.24,236.77)HU和211.22(144.96,342.05)HU,19.79(17.22,45.89)HU和31.15(16.16,64.08)HU]显著增加(Z=-10.342,P<0.001;Z=-4.094,P<0.001)。结论: 肺结核治愈患者最常见的肺内非活动性病灶征象为索条、结节和斑片,且多数表现出钙化、与胸膜粘连、边缘存在索条不光整。非完全钙化和纤维化病灶在治疗停药后的随访中表现为体积进行性病灶缩小、密度增加的变化趋势,这种变化对于判断肺内病灶活动性具有重要意义。     

不同可变数目串联重复序列组合对中国流行结核分枝杆菌分辨力的评价研究

目的 在规范化的结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis,MTB）可变数目串联重复序列（variable number of tandem repeats,VNTR）基因分型的基础上,构建我国31个省（自治区、直辖市）VNTR数据库,每个省优化一套VNTR位点组合,为我国结核病预防控制策略的制定提供科学依据。方法 对2007－2008年全国结核病耐药性基线调查的4 116株MTB15位点VNTR（15-VNTR）基因分型。汉高指数（Hunter-Gaston Index,HGI）分析每个位点的分辨率。依据谱系流行特征,以分辨率高和稳定性强为原则,为各省设计一套VNTR优化组合（12-VNTR、10-VNTR、8-VNTR和5-VNTR）,采用HGI和成簇率进行评价。结果 完成了涵盖率为96.36%（3 966/4 116）MTB完整15-VNTR图谱。发现QUB11b、MIRU26等7个高分辨率位点;QUB26、MIRU16、Mtub21、QUB11b在部分地区遗传稳定性差。内蒙古自治区、重庆市、黑龙江省的最优组合为10-VNTR,其他各省的最佳组合为8-VNTR。结论 VNTR数据库的建立将推动全国范围MTB传染源的追踪;各省优化VNTR组合的推出有助于当地结核病疫情的监测和群体遗传学的研究。     

基于CT图像的肺结核病灶治愈状态判定深度学习模型的建立

目的:基于CT影像构建深度学习模型判定肺结核病灶的活动性。方法:回顾性纳入2018年12月至2020年12月首都医科大学附属北京胸科医院就诊的具有治疗前、中和后时间点的CT影像资料的肺结核治愈患者(102例),按照8∶2的比例将病灶随机分为训练集和测试集。另外,于2021年10月至2022年12月在同一家医院前瞻性纳入肺结核治愈患者(72例),在治疗前、中和后时间点纳入CT资料作为独立验证集。通过迁移学习方式进行深度学习模型构建;采用掩膜区域卷积神经网络(Mask R-CNN)架构实现病灶自动分割及活动性判定。基于三维病灶标签进行模型训练,通过计算测试集受试者工作特性(ROC)曲线下面积(AUC)、敏感度、特异度,并与独立验证集比较,评估模型对肺结核病灶活动性的判定效能。结果:回顾性队列共纳入符合标准的肺结核治愈患者102例,共收集到770份CT影像资料;332个病灶为活动性,464个病灶为非活动性。前瞻性队列纳入肺结核治愈患者72例,共收集到540份CT影像资料。基于迁移学习的Mask R-CNN深度学习模型计算,测试集的AUC为87.5%,敏感度为85.7%,特异度为78.6%;独...     

结核分枝杆菌单核苷酸多态性特征的分析

目的 通过全基因组序列分析结核分枝杆菌（MTB）单核苷酸多态性（SNP）特征,为结核病的预防、控制及治疗提供参考依据。方法 从美国国立生物技术信息中心（NCBI）和欧洲核酸数据库（ENA）中共下载来自全球2 372株MTB全基因组序列,原始数据按照质控要求去除冗余,BWA v 0.7.12软件将菌株的测序文件回帖到结核杆菌参考基因组H37Rv上;SAMtools v 1.3、Picard v 1.112、Varscan筛选SNPs位点以及去除非特异性SNP 位点;采用最大似然法软件RAxML v 8.2.8构建系统进化树;Genepop v 4.5.1软件计算每个SNP位点的遗传分化系数（Fst）;SnpEff v 4.3c软件注释。结果 初步筛选得到107 654个SNP位点,构建的系统进化树将2 347株MTB明确地划分为7个谱系以及69个亚谱系。优化后得到285个谱系定义的SNP位点,将2 347株MTB准确划分为7个分支及67个亚谱系。结论 本研究通过基因组序列分析发现一批基于系统进化的SNP位点,而且基于系统进化285个SNP位点不仅可以用于系统发育及进化相关分析,同时也能够作为基因分型技术靶标,用于结核病分子流行病学。