噬菌体基因组PaP1的鸟枪法测序及其生物信息学分析

目的对分离的铜绿假单胞菌噬菌体PaP1进行全基因组测序，并进行初步的生物信息学分析，为噬菌体的改造及其治疗奠定基础。方法采用鸟枪法随机测序和重叠群组装的策略对PaP1进行基因组测序，并通过EditSeq、开放读码框架（ORF）finder、GeneMark^TM、BPROM、FindTerm、Palindromes、Equicktandem及FAStRNA等软件对所获得的基因组序列的一般特征、蛋白质同源性序列及tRNA基因等进行分析和预测。结果PaP1基因组约为90000bp，其中最大重叠群为28249bp。在已获得序列中预测出120个ORFs、41个推定基因及9个簇集在5’末端的tRNA基因。在41个推定基因中，预测出编码DNA末端酶大亚单位、DNA解旋酶B亚单位、肽聚糖结合蛋白及3个尾丝蛋白等6个基因的功能。结论鸟枪法只能测出噬菌体基因组PaP1的部分序列，重复序列的存在是该基因组测序困难的原因。     

烧伤后肠源性高代谢及其调理

烧伤后高代谢是创伤应激、缺血缺氧、炎症反应的重要组成部分。适度代谢反应有利于伤后机体修复，代谢率过高则加剧耗损，不利于机体恢复。烧伤后高代谢来源主要是创面，已是公认的事实，但伤后是否存在内源性特别是肠源性高代谢，国内外均未见报道。如确实存在肠源性高代谢，则给予适当调理措施，降低伤后高代谢，必将有利于烧伤机体恢复。     

在药学专业课程中设置生物信息学的重要性

药学专业主要培养能够从事药物分析、临床药学、药物研究与开发、药物制剂生产与管理、医药营销等方面的高级科技人才。根据这一培养目标 ,纵观现代生物学及信息技术的发展 ,笔者认为应设置生物信息学这一新兴课程 ,以满足该专业学生对不断增长的生物学信息的获取与处理能力。生物信息学 (Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ)是在生命科学的研究中 ,以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。它是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一 ,同时也是 2 1世纪自然科学的核心领域之一。生物信息学兴盛得益于人类基因组计划 ,但并不局…     

蛋白酶复合体在衰老中的作用

蛋白酶复合体 (Proteasome,PS)系统存在于所有的中枢神经系统中。PS系统在维持神经元内环境的稳定中起着重要的作用 ,该系统的抑制可引起神经细胞的凋亡。在不同的物种 (从果蝇到人 )及不同类型的组织和细胞 [包括中枢神经系统(CNS) ]中 ,PS系统均会发生年龄相关性变化。近年许多文献报道 ,PS系统的改变与衰老过程密切相关 ,可能直接加强了氧化性损伤及神经退行性作用。下面对 PS系统在衰老中的作用及与蛋白质氧化性损伤的相互联系作一综述。1　 PS系统的结构与功能及其调节1.1　 PS系统的组成及功能　 PS系统是真核细胞胞浆中主要…     

大鼠骨骼肌中19S调节复合体的分离、提纯及其在严重烫伤后蛋白水平的变化

目的：探讨19S调节复合体蛋白在烫伤大鼠骨骼肌蛋白降解中的作用机制。方法：利用层析技术，分离、纯化大鼠骨骼肌19S调节复合体，并常规免疫制备其抗体。制作Wistar大鼠烫伤模型，随机分为烫伤组，设伤后1、2、3、5、7d时相点（每时相点8只），另取8只正常大鼠设为对照组。用固相免疫印迹法测定19S调节复合体含量的变化。另取64只烫伤大鼠，行19S抗体注射实验，分为：注射组，由尾静脉分两次注射纯化的19S抗体（3mg/kg),分别于注射后第1、2、3天处死；对照组；尾静脉注射相同体积等渗盐水，其余处理同注射组。测定烫伤大鼠骨骼肌中酪氨酸的释放速率。结果：获得了纯度较高的19S调节复合体。从烫伤后第1天起，与对照组比较，大鼠骨骼肌中的19S调节复合体含量开始明显增加，骨骼肌蛋白质降解速率也在伤后第2天显增强，大鼠骨骼肌中的19S调节复合体含量开始明显增加，骨骼肌蛋白质降解速率也在伤后第2天显增强，19S抗体则能明显抑制蛋白质降解的增加。结论：烧伤刺激可上调骨骼肌19S调节复合体的蛋白水平，从而激活26S蛋白酶复合体对蛋白质的降解作用，这可能是烧伤后负氮平衡的发生重要原因。     

不同营养支持途径对烧伤大鼠肠三叶因子表达的影响

目的探讨不同营养支持途径对烧伤大鼠肠三叶因子（ITF）及其mRNA表达的影响及可能的机制。方法采用30%体表面积Ⅲ度烧伤大鼠模型,随机分成伤前对照（C）组,静脉营养（PN）及肠道营养（EN）组。EN和PN组除营养支持途径不同外,其它条件均相同。在此基础上采用原位杂交、免疫组化和高效液相色谱等手段观察了烧伤后两组大鼠ITF及ITFmRNA的变化。结果正常大鼠小肠中ITF及ITFmRNA均有一定表达,它们主要分布于肠绒毛杯状细胞中。烧伤后PN组大鼠肠道组织结构严重受损,ITFmRNA表达明显降低,肠杯状细胞分泌ITF的能力大幅下降,特别是ITF二聚体的含量远远低于伤前（P＜0.01）。两组比较,EN组大鼠肠组织中ITF及ITFmRNA水平明显高于PN组,同时EN组肠粘膜受损程度也明显低于PN组。结论严重烧伤后肠粘膜结构受损是ITF合成下降的主要原因,肠道营养与静脉营养相比可降低伤后ITF特别是ITF二聚体下降的幅度。     

医学微生物学教学改革的实践研究

本文旨在探讨医学微生物学教学改革的实践及效果.采取的方法有重组更新教学内容,反映学科的知识前沿,加强与学科课程间的横向联系,实验课教学相对独立,开设综合性和探索性实验课,构建医学微生物学教学新体系等.同时,编写配套的教学辅助教材.课程改革后的教学效果受到教学督导组和广大学生以及同行专家的肯定.     

肠三叶因子在大鼠肠道中表达的实验研究

目的 研究肠三叶因子（ＩＴＦ）及其ｍＲＮＡ大鼠肠道的分布规律。方法 采用原位杂交、免疫组化等手段观察了ＩＴＦ及ＩＴＦｍＲＮＡ在大鼠肠道的表达并使用高效液相色谱仪检测了不同肠段ＩＴＦ的含量。结果 从十二指肠至结肠均有ＩＴＦ及ＩＴＦｍＲＮＡ表达，主要分布于肠绒毛杯状细胞，其中ＩＴＦｍＲＮＡ仅在杯状细胞的基底和边缘表达，其它区域的杯状细胞则呈ＩＴＦｍＲＮＡ阴性反应，同时发现部分其它部位的肠上皮细胞中亦有     

严重烫伤大鼠骨骼肌泛素基因表达的变化

烧伤后机体蛋白质分解代谢增强 ,超过合成代谢 ,造成负氮平衡。本室研究表明 ,依赖三磷酸腺苷及泛素的 2 6Ｓ蛋白酶复合体 (ＡＴＰ -ｕｂｉｑｕｉｔｉｎ - 2 6Ｓｐｒｏ ｔｅａｓｏｍｅ)系统为烫伤后骨骼肌蛋白质降解的主要途径[1 ] ,且烫伤后泛素含量呈明显的进行性增加。笔者拟应用皮肤全层烫伤大鼠模型观察多聚泛素ｍＲＮＡ水平的变化 ,以探讨骨骼肌泛素基因表达的变化与蛋白质代谢的相关性。一、材料与方法1.实验动物 :雄性健康Ｗｉｓｔａｒ大鼠40只 ,体重 ( 15 0± 2 0 )ｇ ,本校动物所提供。2 .动物分组及处理 :随机分为正常对照组及烫…     

肿瘤坏死因子α可增强骨骼肌中泛素的基因表达

骨骼肌蛋白分解作用增强是急性或慢性炎症过程的代谢性反应。许多报道认为是细胞因子的释放导致了肌肉组织的分解,但细胞因子尤其是TNFa对骨骼肌代谢的作用机理却不甚明了。参与骨骼肌蛋白分解作用的并非酶体内的组织蛋白酶,而是广