伤寒沙门菌小RNA T64的功能

［摘要］目的: 探究小RNA T64对伤寒沙门菌(Salmonella enterica serovar Typhi, S. Typhi)表型的影响。方法: 用λ Red重组系统构建小RNA T64的基因缺失变异株,并将携带T64基因序列的重组质粒导入T64缺陷株制备T64回补株,同时将该质粒导入hfq基因缺陷变异株。绘制T64高表达株的生长曲线,观察T64对细菌生长的影响;接种半固体平板观察细菌的动力;结晶紫染色法观察细菌生物膜形成情况。 结果： 序列分析表明,T64基因缺失变异株构建成功;生长曲线显示,T64高表达促进细菌的生长;与空载体对照株相比,T64高表达株的动力稍减弱;生物膜分析结果显示,T64高表达株生物膜形成能力强于空载体对照株;回补T64基因后,T64缺陷株生物膜形成能力基本恢复,而hfq缺陷株依旧难以形成生物膜。结论： T64能促进细菌生长,且在一定程度上抑制细菌的动力;其有助于S. Typhi形成生物膜,但不足以消除hfq基因缺失对生物膜形成的抑制作用。     

GLDN基因在结直肠癌中的表达及其意义

目的探讨GLDN基因在结直肠癌中的表达及其意义。方法从GEO数据库下载GSE50760数据包。利用R语言对数据包进行分析,得出与结直肠癌相关的差异表达基因,并绘制热图和火山图。运用starbase在线数据库对获得的差异基因在结直肠癌与癌旁组织中的表达水平进行分析。进一步利用Onco Lnc在线数据库进行差异基因与结直肠癌的预后分析。在临床样本层面,利用q PCR及免疫组化技术探索GLDN基因在结直肠癌中的表达差异。结果通过分析GSE50760数据包获得前100个差异表达的基因。利用starbase在线数据库对这100个差异表达基因的表达水平进行分析发现,GLDN基因在结直肠癌组织中的表达比癌旁组织明显下调。生存分析也提示,当GLDN基因高表达时,结直肠癌患者的预后相对较好。q PCR及免疫组化技术也验证了GLDN临床样本的癌旁组织中高表达,并且GLDN表达量与患者预后密切相关。结论 GLDN是结直肠癌的潜在抑癌基因,并且可以作为判断结直肠癌患者预后的重要生物学标记物。