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1.
目的 通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别慢性肾脏病(CKD)足细胞损伤相关的基 因模块与关键基因。方法 从基因表达综合数据库(GEO)中下载包含足细胞损伤体外模型及CKD 患者肾小 球组份的表达谱GSE66107、GSE93798、GSE30528、GSE32591 4 个数据集。利用R 软件包做数据预处理并选 取错误发现率(FDR)<0.05 及差异倍数≥ 1.5 作为差异表达基因(DEG);结合数据集GSE993395(133 例 CKD 患者肾小球样本)用WGCNA 进行模块化分析并对模块内基因进行功能注释(GO),根据GO 结果和 含有文献报道的足细胞标准基因(PSG )情况确定足细胞损伤相关模块,根据模块内基因连接度(Kwithin) 挑选枢纽(hub )基因;利用Cytoscape 软件及插件Cluego 构建足细胞损伤相关模块基因的加权共表达网络。 结果 4 个数据集共得到 趋势一致的DEG 7 957 个,其中15 个DEG 在4 个数据集中均有差异(coDEG)。 GSE993395 中包含的4 031 个DEG 被用于WGCNA 分析;最终得到12 个基因模块,其中green 模块包含最多的 coDEG 和PSG,进一步通过Kwithin 发现其中同时作为coDEG 和PSG 的MAGI 2 基因是其hub 基因之一。结论 WGCNA 表达网络分析方法是一个高效的系统生物学方法,应用该方法发现CKD 时关键节点基因MAGI 2 在 足细胞损伤中可能起到重要作用。  相似文献   
2.
蒯巧林  于然  王维  陈皓瑜  宋坚  王万鹏 《江苏医药》2021,47(9):865-868,封2
目的 探讨白藜芦醇(RSV)对嘌呤霉素氨基核苷(PAN)引起的足细胞氧化应激损伤的保护作用及可能机制.方法 将小鼠肾脏足细胞系MPC5分为空白对照组(A组)、PAN处理组(B组)和PAN+RSV处理组(C组).采用台盼蓝染色法和流式细胞术分别检测足细胞活力和凋亡情况,共聚焦显微镜下观察细胞骨架排列情况,DCFH-DA染色检测足细胞内活性氧(ROS)含量,比色法检测乳酸脱氢酶(LDH)和谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性,羟胺法检测超氧化物歧化酶(SOD)活性,硫代巴比妥酸法检测丙二醛(MDA)含量.结果 与A组相比,B组小鼠足细胞活力、SOD和GSH-Px活性降低(P<0.05),足细胞凋亡以及ROS、LDH和MDA含量增加(P<0.05),足细胞骨架出现紊乱、重组和降解,并向边缘聚集;而C组经RSV干预后各项观察指标均得到有效改善(P<0.05).结论 RSV可以部分逆转PAN诱导的足细胞损伤,其保护作用可能与抑制氧化应激、改善线粒体功能障碍相关.  相似文献   
3.
目的探讨微小RNA-130b(miR-130b)在嘌呤霉素氨基核苷(puromycin aminonucleoside,PAN)诱导的足细胞损伤中的作用及机制。方法小鼠肾脏足细胞系MPC5予以PAN 25、50、100μg/mL干预,实时定量PCR检测MPC5细胞系内miR-130b及其宿主基因2610318N02Rik(RIK)表达;转染miR-130b抑制剂(miR-130b inhibitor)或对照(NC inhibitor)后予以PAN 100μg/mL刺激,24 h后采用Western blot检测足细胞裂孔膜蛋白Synaptopodin和Nephrin蛋白表达变化;采用鬼笔环肽染色检测足细胞骨架改变;采用流式细胞技术检测细胞凋亡变化;采用Targetscan 7.2预测miR-130b潜在靶基因,Western blot检测miR-130b模拟物(mimic)对于潜在靶基因PGC1α蛋白表达的影响;采用双荧光素酶报告基因系统检测miR-130b mimic对于荧光活性的影响。结果 PAN可以抑制足细胞内的miR-130b及宿主基因RIK表达;与转染NC inhibitor组比较,miR-130b inhibitor提高足细胞裂孔膜蛋白synaptopodin和nephrin表达;鬼笔环肽染色显示抑制miR-130b可以部分缓解PAN诱导的足细胞骨架紊乱及重组;流式细胞技术检测结果示干扰足细胞miR-130b表达可以减少PAN诱导的细胞凋亡;Targetcan 7.2分析显示PGC1α是miR-130b的潜在靶基因,Western blot结果显示,转染miR-130b mimic可以降低足细胞内PGC1α表达;双荧光素酶报告基因系统结果示,与NC mimic及突变的PGC1α3'-UTR共转染组比较,miR-130b mimic与野生型PGC1α3'-UTR共转染组荧光素酶活性降低。结论 miR-130b通过靶向抑制PGC1α表达参与PAN诱导的足细胞损伤。  相似文献   
4.
目的比较PPF方案(平阳霉素8 mg/d,第1、3、5、7天-Fu 500 mg/m^2,第1~5天静脉滴注)和PF方案(顺铂20mg/m^2,第1~5天静脉滴注;5-Fu 500 mg/m^2,第1~5天静脉滴注)治疗初治局部晚期(T4N2~3M0)的鼻咽癌的近期疗效和急性毒副反应.方法67例初治鼻咽癌(T4N2~3M0)随机分成PF组(n=34)和PPF组(n=33),完成2周期诱导化疗后进行常规外照射放疗.结果PPF组治疗后6个月内鼻咽腔肿物完全消退率为87.79%(29/33),颈部淋巴结转移灶完全消退率90.00%(27/30),PF组上述指标分别为64.71%(22/34)和66.67%(20/30).PPF组疗效明显高于PF组(P<0.05).在急性毒副反应方面,2组血红蛋白下降、血小板减少、恶心呕吐、腹泻和口腔炎无明显差异(P>0.05),仅有脱发PPF方案组较PF组严重(P<0.01).结论初治局部晚期鼻咽癌的诱导化疗中,PPF方案比PF方案近期疗效明显提高,但还需扩大样本进行研究,另还需观察其远期生存率.  相似文献   
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