学龄儿童肥胖与肠道菌群多样性及菌属丰度的关联研究

目的分析学龄肥胖儿童和正常体重儿童肠道菌群多样性差异, 识别肥胖儿童肠道特征菌属, 为后续相关机制研究和学龄儿童肥胖的防治提供依据。方法基于2016年在上海市嘉定区某小学建立的研究队列人群, 将2016-2018年3年均处肥胖状态的儿童共63名纳入肥胖组, 其中男生43名, 女生20名。在3年均为正常体重的儿童中, 根据年龄、性别和所在班级, 将其与肥胖组儿童进行1∶1匹配, 共选择63名纳入对照组。采用问卷收集儿童基本信息、饮食状况、母乳喂养等情况, 收集两组儿童的粪便样本并进行16S rDNA测序。对质量优化后的测序序列按照97%相似性进行可操作分类单元聚类及物种注释。分析肥胖组和对照组儿童肠道菌群多样性及菌属丰度差异。计算肠道菌群的Ace、Chao1、Shannon、Simpson 4种α多样性指数, 并利用主坐标分析, 在非加权Unifrac距离和加权Unifrac距离的基础上表示β多样性。使用相似性分析(ANOSIM)比较两组β多样性的差异。利用STAMP软件挑选出两组儿童共有菌属中的差异细菌, 并利用广义线性模型(GLM)分析肥胖与α多样性以及显著差异菌属的关联。结果肥胖组...     

微流芯片检测流感病毒多重逆转录聚合酶链反应产物的实验研究

[目的 ]　建立应用微流芯片检测甲 1型、甲 3型、乙型流感病毒多重逆转录聚合酶链反应 (mRT -PCR)产物的方法 ,在mRT -PCR扩增核酸的基础上自动化灵敏的定量检测扩增产物 ,快速检测甲亚型、乙型流感病毒 ,帮助临床快速诊断和鉴别诊断其他呼吸道病毒感染 ,以及明确流感病毒在人群中感染、流行情况。　 [方法 ]　采用经MDCK细胞分离培养的甲 1型、甲 3型、乙型流感病毒毒株病毒液 ,使用 3组特异引物经mRT -PCR扩增核酸 ,扩增产物分别采用毛细管电泳技术经Caliper10 0 0微流芯片分析仪自动化检测和经 2 %琼脂糖凝胶电泳法检测。　[结果 ]　设计三组引物对相应甲 1型、甲 3型、乙型流感病毒靶基因的mRT -PCR扩增产物片段分别为 43 0bp、2 10bp、3 91bp ,本实验mRT -PCR扩增产物经 2 %琼脂糖凝胶电泳 ,与Marker比照 ,DNA条带基本在此位点附近 ;产物采用毛细管电泳法经Caliper10 0 0微流芯片分析仪后 ,分别于 413bp、2 0 3bp、3 79bp处出现陡峭的峰 ,如图所示。　[结论 ]　应用微流芯片采用毛细管电泳法可对流感病毒mRT -PCR产物进行定位及相对定量 ,有助于快速诊断流感病毒感染 ,有助于对流感的监测。     

腺病毒3型急性呼吸道感染暴发流行的病原学调查

目的以血清学方法证实2004年江苏省苏北地区中小学生腺病毒3型急性呼吸道感染的暴发流行.方法应用酶联免疫吸附法（ELISA）检测患者急性期IgM抗体、恢复期IgG抗体;应用中和试验方法检测患者急性期、恢复期血清和未患病学生对照血清的中和抗体,并应用SPSS11.0软件对试验数据进行统计分析.结果患者急性期IgM抗体阳性率为3.7%,恢复期IgG抗体阳性率为44.4%,恢复期中和抗体阳性率为59.5%;未患病学生分别为0%、8.3%和33.3%,卡方检验P值分别为0.510、0.018、0.226;9例患者配对双份血清中有6例患者恢复期血清中和抗体保护作用均较急性期血清明显增长;ELISA方法检测IgG与中和试验检测中和抗体的一致率为61.4%,Kappa检验P=0.070.结论血清学方法进一步证实苏北地区急性呼吸道感染暴发流行的病原体为腺病毒3型.     

混合细胞瓶对临床标本中流行性感冒病毒和肠道病毒的分离检测

目的 比较犬肾细胞系(MDCK)、人喉表皮癌细胞(Hep-2)和非洲绿猴肾细胞(Vero)制备的MHV混合细胞与相应单一敏感细胞株对流行性感冒(流感)病毒、肠道病毒的分离结果.方法 流感样患者咽拭子标本接种MHV混合细胞和MDCK细胞,手足口病患儿咽拭子或粪标本接种MHV混合细胞和Vero细胞,观察病毒致细胞病变效应(CPE),采用多重反转录-聚合酶链反应(mRT-PCR)检测甲、乙型流感病毒和肠道病毒.结果 MDCK和Vero细胞的CPE较MHV混合细胞明显.138份流感病毒接种MHV混合细胞,分离出34株流感病毒,分离率为24.6％;MDCK细胞分离出流感病毒39株,分离率为28.3％.MHV混合细胞与MDCK细胞流感病毒分离率比较,差异无统计学意义(x2=1.92,P＞0.05).32株肠道病毒接种MHV混合细胞,分离出肠道病毒9株,分离率为28.1％;Vero细胞分离出12株肠道病毒,分离率为37.5％.MHV混合细胞与Vero细胞肠道病毒分离率比较,差异无统计学意义(x2 =3.00,P＞0.05).结论 MHV混合细胞CPE不如单一细胞易于观察;MHV混合细胞适用于生物性突发公共卫生事件中,可分离培养临床标本中甲型、乙型流感病毒和表现为呼吸道症状的肠道病毒.     

甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素蛋白基因进化研究

Objective To determine the evolutionary rate and divergence time of influenza A virus HA gene isolated recently worldwide pandemic and explore the origin and its transmission. Methods A total of 344 HI sequences available in the GenBank (including 248 isolated from human, 84 from swine, 11 from avian, and 1 from ferret) and 7 isolated in Shanghai were collected. The nucleotide substitution rate and time to most recent common ancestor (tMRCA) was calculated using molecular clock theory and Bayesian Skyline Plot (BSP) based on Markov chain Monte Carlo. Then genetic phylogeny was constructed referring to posterior distribution. Results It was found that H1 sequences in the US from human, swine and avian were clustered significantly with swine H1 ones from Asia phylogenetieally (Cluster US). The second cluster (Cluster Eurasian Human) nearly consisted of human H1 sequences isolated in other regions. The third cluster (Cluster Eurasian Animal) consisted of swine and avian H1 sequences from China and Italy respectively. As for all the H1 sequences, the evolutionary rate was of 2.57×10-3substitutions/site per year averagely (95% Highest Posterior Density: 1.96×10-3-3.03×10-3/site per year). The estimated dates for tMRCA of human H1 in Europe and swine H1 in the mainland of China were the earliest, with the corresponding rates of 6.46×10-3/site per year and 0.97×10-3/site per year respectively. The tMRCAs of human and swine H1 sequences from the US were similar, with the rates of 5.86×10-3/site per year and 5.02×10-3/site per year. Conclusion The present flu outbreak was possibly induced by long-term circulation of influenza A virus (H1 N1) in human population and swine herds in America. There was no evidence proving that influenza virus in China involved in the present outbreak.     

H1N1流感病毒的遗传进化研究

2009年3月底,墨西哥流感样疾病（ILI）病例异常增加,2009年4月17～28日期间,共报道1551例严重肺炎流感疑似病例（其中7例确诊死亡病例）,随后与之毗邻的美国也相继出现类似病例。2009年4月25日,世界卫生组织（WHO）宣布本次疫情为国际关注的突发公共卫生事件（PHEIC）,并于4月30日将流感大流行警戒级别从4级提高到5级,     

多重逆转录聚合酶链反应检测主要上呼吸道病毒

目的：建立用多重逆转录聚合酶链反应（mRT-PCR）检测甲1型、甲3型、乙型流感病毒以及呼吸道全胞病毒（RSV）A型、B型等主要上呼吸道病毒的方法，以快速检测上呼吸道感染主要病毒及对甲型、甲亚型、乙型流感病毒在上海地区人群感染、流行情况设计。方法：采用经MDCK细胞接种培养的甲3型、乙型流感病毒和Hep-2细胞接种培养的RSV A型、B型标准毒株病毒液，以及甲1型、甲3型、乙型流感病毒和RSV A型、B型混合毒株病毒液，使用5组引物，分别为HA1-5al和Hal-3al（甲1型流感病毒）、HA3-5al和HA3-3al和HA3-3al（甲3型流感病毒）、NP-5b1和NP-3bl（乙型流感病毒）、RSVAF和RSVAR(RSVA型)、RSVBF和RSVBR(RSVB型)，经mRT-PCR，琼脂糖凝胶电泳，于紫外灯下观察上述病毒特异核苷酸条带。结果：甲1型、甲3型、乙型流感病毒，RSVA型、B型分别在431，210，390，334，183bp处出现清晰的5条DNA条带。结论：应用5组引物，mRT-PCR可用于快速检测临床上呼吸道感染标本中的流感病毒和RSV，并可对其进行分型，对上呼吸道病毒感染性疾病的诊断和流感的监测方面是非常重要的。     

手足口病病原在自来水中的存活能力

目的 了解手足口病病毒在生活用自来水中存活情况.方法 2008年上海市及浙江省手足口病监测病例分离到的手足口病病毒中,选择5株肠道病毒(EV)71型、1株柯萨奇(Cox)病毒,分别混合含氯量1.0 mg/L的自来水;采用Vero细胞培养,细胞病变效应(CPE)观察,每日监测水中病毒存活情况.运用散点图分析水中病毒存活量下降趋势.结果 该6株手足口病病毒在初始含氯量1.0 ppm模拟出厂自来水中可以存活1个月以上,并持续有感染细胞能力,病毒株间活病毒存活能力有差别.结论 EV71型及Cox病毒在水中具有较强存活能力,手足口病流行期间,城市、农村及城乡结合部需要注意手足口病病原经水传播的途径.

Abstract：

Objective To evaluate the survivability of hand foot mouth disease(HFMD)virus,in tap water for daily use.Methods HFMD viruses were isolated from cases of HFMD in Shanghai and Zhejiang from in 2008.Six isolated strains (five subtype of enterovirus 71 and one coxackie virus)were selected in this study.These viruses were mixed with chloride 1.0 mg/L tap-water and then inoculated into Vero cells.The cytopathic effect (CPE)was checked everyday in order to survey the survivability of each virus strain.The decline of virus survivability was analyzed by scatter diagram.Results These six strains of HMFD virus could survive longer than one month in tap water with initial chloride concentration of 1.0 mg/L and still had celluar infectivity.The survivabilities were varied between viruses isolated from different HFMD cases.Conclusions The survivabilities of enterovirus 71 and coxackie virus stains are quite strong in water.Therefore,the transmission route of water-borne pathogens should be monitored in regions using tap water during HFMD epidemic period.     

甲型流感病毒分类与通用流感疫苗及广谱中和活性抗体的研究

流感是对人类危害极大的传染病,疫苗接种被认为是预防流感的最有效手段.为解决流感病毒变异导致现有疫卣时效性与有效性的问题,研制能够预防所有流感病毒毒株、可诱导持久保护性免疫的通用流感疫苗一直是流感研究的热点,同时,能中和所有甲型流感病毒的广谱中和活性抗体的研究也已成为目前关注的重点,因此对甲型流感病毒分类研究也提出了相应...