基于铁死亡相关的长链非编码RNA生物标志物可准确预测肾透明细胞癌患者预后

目的:肾癌是一种具有高发病率与高死亡率的恶性肿瘤,肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma, ccRCC)是其中一个重要的组织亚型。关于铁死亡相关长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)生物标志物预测ccRCC患者生存的系统研究国内尚未开展,故有必要探索相应的铁死亡相关的lncRNA生物学标志物。方法:从美国癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库中获得了539份ccRCC样本中lncRNA的表达谱。利用lncRNA与铁死亡相关基因的共表达网络选择铁死亡相关的lncRNA,使用单因素Cox回归进一步筛选预后相关的lncRNA,此外,使用Lasso回归和多因素Cox回归来构建铁死亡相关的lncRNA预测模型。在此基础上建立风险评分,根据风险评分中位值将患者分为高风险组和低风险组,识别ccRCC患者死亡风险。利用基因本体论(Gene Ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)对铁死亡...