α干扰素抗病毒相关全基因组表达谱的生物信息学分析及其对新型冠状病毒肺炎潜在药物研究的意义

目的通过分析α干扰素抗病毒相关全基因组表达谱,探索其对新型冠状病毒肺炎的潜在治疗意义。方法应用R语言对来自基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)的α干扰素相关的全基因组表达谱开展差异分析、富集分析、蛋白互作分析,再应用自主研发的表观精准治疗预测平台（epigenomic precision medicine prediction platform,EpiMed）,寻找与α干扰素调控基因表达谱呈负相关的疾病类型,以及呈正相关的药物。结果α干扰素对基因组表达谱影响复杂,其调控的核心基因有OAS1、MX1、OASL、ISG15、IST1、IRF7等,参与病毒生命周期的负调控、B细胞受体信号通路、肝炎、双链RNA绑定、人类免疫缺陷病毒感染,以及JAK-STAT信号通路等。进一步分析,α干扰素调控的基因组表达谱与社区获得性肺炎和脓毒症等感染性疾病呈高度负相关,而与利托那韦、利巴韦林、奈韦拉平、氟伐他汀呈高度正相关。结论基于α干扰素抗病毒相关基因组表达谱的分析对于探索新型冠状病毒肺炎潜在治疗药物具有一定的借鉴意义。     

从"肾主生殖"角度评价腺嘌呤与氢化可的松诱导的肾阳虚模型

目的从“肾主生殖”角度，比较腺嘌呤诱导与氢化可的松诱导的SD大鼠肾阳虚模型的优劣，从而得到在形态学及性腺指标方面更符合中医“肾阳虚”证的动物模型，以供科研、教学使用。方法雄性SD大鼠100只，随机分成正常组、腺嘌呤组及氢化可的松低、中、高剂量组，每组20只。造模4周后通过HE染色，观察模型大鼠睾丸、精囊、前列腺、肾上腺、组织形态变化；放免法检测大鼠睾酮、雌二醇的改变情况。结果腺嘌呤制作的SD大鼠肾阳虚证动物模型在肾上腺、前列腺、精囊、睾丸组织形态改变及睾酮、雌二醇等性腺指标的变化较氢化可的松诱导组明显。结论腺嘌呤诱导的肾阳虚证SD大鼠模型在形态学与性腺指标方面更符合中医肾阳虚形态学表现。     

基于MEDLINE数据库挖掘高尿酸血症的中医药研究

正原发性高尿酸血症(hyperuricemia)是指在排除其他疾病的基础上,由于嘌呤代谢紊乱和(或)尿酸排泄障碍所致血尿酸增高,细胞外液尿酸盐呈超饱和的状态。37℃时,血清尿酸的饱和浓度约为416μmol/L,高于此值即为高尿酸血症~[1]。超高蛋白膳食是引起嘌呤代谢紊乱的重要原因,过量糖、脂肪、蛋白质、盐的摄入及大量饮酒与患病率增加有重要关系~[2]。近年来,随着生活水平的提高,饮食结构的变化,蛋白质摄入大量增     

冠状病毒感染相关心肌损伤机制的组学分析及治疗药物的预测

目的研究冠状病毒感染相关心肌损伤机制并预测可能有效的治疗药物。方法在基因表达数据库检索并筛选得到GSE59185数据集,根据不同的亚型分为wt组、ΔE组、Δ3组、Δ5组和对照组。用R语言Limma程序包对各组进行差异表达基因分析,将各组上调、下调表达基因分别取交集,作为共同差异表达基因,在DAVID数据库进行基因本体学(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。采用自主研发的表观精准治疗预测平台(EpiMed)进行治疗药物预测。用STRING数据库对共同差异表达基因构建蛋白质互作网络并筛选核心基因。结果各组差异表达基因分析,共交集上调基因191个,下调基因18个,共同差异表达基因共209个。GO富集分析发现,共同差异基因主要富集在病毒反应、病毒防御反应、Ⅰ型干扰素反应、γ干扰素调节、γ干扰素介导的信号通路、先天免疫反应调节等;KEGG通路富集主要与细胞因子与受体相互作用、病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体相互作用、TNF、Toll样受体、缺氧诱导因子1及白细胞介素17信号通路等有关。通过EpiMed预测的药物主要为白藜芦醇、利托那韦、维甲酸、连翘、鱼腥草等。网络分析筛选得到干扰素调节因子7、干扰素刺激基因15、抗粘液病毒基因1、β型蛋白酶体亚基8、干扰素调节因子9、 2′,5′-寡聚腺苷酸合成酶(OAS)1、OAS2、OAS3、含基本S腺苷蛋氨酸域2、2′,5′-寡聚腺苷酸合成酶样等核心基因。结论多个炎症通路的异常活化可能是冠状病毒感染后患者发生心肌损伤的原因。白藜芦醇、利托那韦、维甲酸、连翘、鱼腥草可能对此具有治疗作用。     

肾阳虚证的研究进展

中医认为肾为脏腑之本，是机体阴阳消长之枢纽，因此肾阳虚证的本质一直是研究重点。自20世纪80年代以来，许多学者进行了肾阳虚证的现代物质基础研究，并深入到神经生物学、亚细胞学、细胞分子免疫学、基因组学、蛋白质组学、代谢组学等领域，同时亦创立了多种肾阳虚证的造模方法，为中医基础理论的现代科学技术研究提供了有益的尝试。     

SARS病毒感染相关免疫损伤分子机制和干预药物的生物信息学预测及其对COVID-19的意义

目的:通过对SARS病毒转录组数据进行临床生物信息学分析,探讨免疫损伤组学机制,预测针对性治疗药物,并为COVID-19的临床治疗提供参考。方法:收集公共基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中的SARS病毒转录组数据并筛选差异基因,应用富集分析、蛋白质相互作用分析探讨SARS病毒感染相关免疫损伤机制,并应用表观精准治疗平台预测潜在治疗药物。结果:SARS病毒感染相关免疫损伤机制复杂,包括通过Toll样受体等信号通路影响免疫细胞的功能、通过Th17信号通路诱导血浆细胞因子水平升高,以及通过IL-6、NF-κB、TNF等分子生成自身抗体介导自身免疫应答等。川穹、益赛普等药物可能对SARS病毒感染相关免疫损伤具有治疗作用。结论:SARS病毒能够引起大量免疫相关分子及信号通路的异常,川穹、益赛普等药物可能对SARS病毒感染相关免疫损伤具有治疗作用。本研究可为COVID-19的临床治疗提供参考。     

穴位埋线对胆囊结石缓解期合并胆囊收缩功能不全患者胆囊收缩功能的影响

目的:观察穴位埋线对胆囊结石缓解期合并胆囊收缩功能不全患者胆囊收缩功能的影响。方法:采用实效性临床试验设计,将70例胆囊结石缓解期合并胆囊收缩功能不全患者按照本人意愿分为治疗组、对照组,每组35例。对照组予牛磺熊去氧胆酸治疗,治疗组在此基础上联合穴位埋线疗法(主穴为:右侧日月、胆俞、阳陵泉),两组疗程均为8周。观察胆囊排空指数(GBEF%)及中医证候疗效,比较中医证候积分变化情况,并进行安全性评价。结果:①试验过程中治疗组脱落2例,对照组脱落5例,最终完成试验者63例,其中治疗组33例、对照组30例。②治疗组GBEF%有效率为63.64%、对照组为36.67%,治疗组有效率优于对照组(P0.05);治疗组中医证候疗效总有效率为57.58%、对照组为33.33%,治疗组有效率优于对照组(P0.05)。③治疗后,治疗组右上腹痛、右上腹压痛、上腹饱胀、大便情况评分及中医证候总积分较治疗前均显著降低(P0.05),对照组右上腹痛、右上腹部压痛、上腹饱胀评分及中医证候总积分较治疗前降低(P0.05);治疗后,治疗组大便情况评分明显低于对照组(P0.05)。④两组均未出现明显不良反应。结论:穴位埋线可有效改善胆囊结石缓解期合并胆囊收缩功能不全患者的胆囊收缩功能;与牛磺熊去氧胆酸联用,有利于提高临床疗效并协同改善患者的临床症状,且安全性好。     

基于三代测序技术对中药灵芝和食用菌rRNA基因及其基因间序列的鉴定研究

目的：基于三代PacBio测序技术,建立中药灵芝和食用菌rRNA 18S-ITS-28S全长序列文库,从分子水平快速、准确鉴定和研究品种。方法：对收集到的8种食用菌和1种中药材真菌灵芝抽提基因组DNA,设计引物扩增18S-ITS-28S全长序列,18S-ITS-28S全长序列包括连续且完整的18S rRNA-ITS1-5.8S rRNA-ITS2和28S rRNA部分序列,其总长度>3.3 kb。将18S-ITS-28S全长序列进行建库和三代PacBio测序。结果：食用菌和药用灵芝的18S rRNA、5.8S rRNA及部分28S rRNA基因序列相似度高且序列保守,而rRNA基因间（ITS1和ITS2）的序列差异性大。结论：本研究的结果提示,分析rRNA基因间（ITSs）区域,而不是仅仅分析rRNA基因,有助于真菌类中药材的鉴定和研究。     

哮喘与中医体质关联性研究的系统评价与Meta分析

目的 系统评价哮喘与中医体质的关联性.方法 通过对中国生物医学文献数据库(Si-noMed)、中国知网(CNKI)、万方数据库(WanFang Database)、重庆维普中文科技期刊数据库(VIP)、PubMed及Web of Science数据库进行检索,搜集关于哮喘与中医体质关联性的横断面研究及病例对照研究等,检...     

基于均匀设计的降尿酸方最佳配伍及其抗小鼠高尿酸血症效应研究

目的：探索以＂清热祛湿、补肾通络＂为治法的降尿酸方主效应中药最佳配伍及其可能的降尿酸机制。方法：以氧嗪酸钾250 mg/kg腹腔注射诱导昆明小鼠高尿酸血症模型,对降尿酸方中肉桂、黄柏、秦皮、桑寄生4味中药根据均匀设计U9（96）表分组实验,以血尿酸为考察指标,用逐步回归分析法筛选最佳配伍;以血清黄嘌呤氧化酶（XOD）及肾脏尿酸转运蛋白URAT1、OAT1、OAT3为靶点,检测最佳配伍组可能的降尿酸机制,并以苯溴马隆为阳性对照进行效应验证。结果：回归方程提示,降尿酸方中黄柏、秦皮、桑寄生组合且其生药剂量分别为50、260、50 mg/kg时降尿酸效果最佳;该配伍组可明显抑制XOD的生物合成,上调rOAT1、rOAT3蛋白与下调rURAT1蛋白表达。结论：该筛选结果可靠,且其作用机制可能与抑制XOD的生物合成及其上调rOAT1、rOAT3蛋白表达及下调rURAT1蛋白表达相关。