基于单细胞组学分析LCLAT1在喉鳞癌中的表达及其与预后的关系

目的 探讨心磷脂酰基转移酶1（LCLAT1）在喉鳞癌中的表达及其与预后的关系。方法 对3例喉鳞癌患者的肿瘤、癌旁及淋巴转移组织进行单细胞RNA测序。使用R软件对上述样本进行数据分析,观察LCLAT1在上皮细胞亚群中的表达情况。然后使用癌症基因组图谱（TCGA）中喉鳞癌的数据,分析了包含LCLAT1在内128个甘油磷脂合成途径相关基因的表达情况及对预后的影响,并使用Cytoscape软件评估了LCLAT1在喉鳞癌甘油磷脂合成途径中的重要作用。最后使用免疫组化实验检测LCLAT1在20例喉鳞癌标本中的表达情况。结果 识别出10个主要的细胞簇,其中上皮细胞包含11个亚群,标记为c0～c10。簇c1是处在高增殖状态的恶性细胞,并且高表达LCLAT1。LCLAT1作为甘油磷脂合成途径中的关键基因之一在肿瘤组织中高表达,并且是喉鳞癌的危险因素和独立预后指标。免疫组化验证LCLAT1在喉鳞癌肿瘤组织中表达量高于癌旁组织。结论 LCLAT1在喉鳞癌高增殖状态的恶性上皮细胞中高表达,可能作为甘油磷脂合成途径中的关键基因促进喉癌发展,影响喉癌预后。     

头颈部鳞状细胞癌临床预后模型中SERPINE1及SLC20A1的作用

目的 构建一个TGF-β基因相关通路的风险评分模型,探讨该模型对头颈部鳞状细胞癌(HNSC)患者预后的预测价值。方法 从美国癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载TCGA-HNSC队列作为训练组,GEO数据库中下载GSE41613作为测试组,筛选出训练组中肿瘤组织与正常组织间的差异表达基因,随后采用单因素和多因素Cox回归分析确定影响HNSC患者生存的TGF-β通路相关基因(TRGs),并构建预后风险模型。通过风险生存曲线、受试者工作特征(ROC)曲线及生存状态图对模型进行评价,并对风险评分进行独立预后分析。整合风险评分及其他临床预测指标绘制列线图以评估患者预后。利用R软件对训练组中高、低风险组患者进行基因突变频率分析及免疫微环境特征分析。结果 从训练组中初步筛选出6个差异表达的TRGs,通过Cox回归分析筛选出2个与预后相关的基因:纤溶酶原激活物抑制因子-1(SERPINE1)及磷酸盐转运蛋白-1(SLC20A1)。在训练组和测试组中高低风险组生存差异均有统计学意义(均P <0.05),ROC曲线显示该风险评分可靠,可作为独立预后因子。高风险组和低风险组HNSC具有完全不同的集...