基于网络药理学探讨胆宁片治疗慢性胆囊炎的活性成分及其分子作用机制

目的：基于网络药理学探讨胆宁片治疗慢性胆囊炎的活性成分及其分子作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台数据库和草本组鉴数据库获得中药胆宁片的化学组分,并根据药动学参数筛选有效活性成分和潜在作用靶点;通过GeneCards、DisGeNET及Drugbank数据库获取慢性胆囊炎的相关靶点,通过Venny 2.1.1绘制韦恩图得到两者共有靶点;应用STRING数据库构建化合物和疾病共有靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络图后,运用Cytoscape 3.7.2软件实现可视化并进行网络拓扑学分析筛选核心靶点,最后利用R语言软件Cluster Profiler GO.R插件对核心靶点进行富集分析。结果：中药胆宁片与慢性胆囊炎共有靶点60个,其中关键靶点有肿瘤蛋白p53、Cyclin依赖性激酶抑制剂1、G1/S-特异性Cyclin-D1、原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶1、表皮生长因子受体、血管内皮生长因子A、肿瘤坏死因子、基质金属蛋白酶9、受体酪氨酸蛋白激酶2和视网膜母细胞瘤相关蛋白1等,主要涉及膀胱癌、人巨细胞病毒感染以及磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B等信号通路。结论：胆宁片治疗慢性胆...     

基于网络药理学的刺芒柄花素抗颈动脉粥样 硬化斑块的作用靶点及机制

目的 利用网络药理学方法联合GEO基因芯片数据及分子对接技术探索刺芒柄花素治疗颈动脉粥样硬化斑块的潜在分子作用机制。 方法 在PubChem等数据库获取刺芒柄花素的作用靶点,在GeneCards、DisGeNET等数据库获取颈动脉粥样硬化斑块相关靶点基因,与GEO芯片筛选的差异基因合并去重后得到颈动脉粥样硬化斑块靶点基因;通过构建韦恩图,得到药物与疾病共有靶点;利用R软件包对共有靶点进行富集分析;利用String在线平台构建共有靶点蛋白互作网络,运用Cytoscape软件对网络进行拓扑学参数筛选得到核心靶点;再运用分子对接技术将筛选出来的核心靶点分别与刺芒柄花素的结合活性进行验证。 结果 筛选出413个刺芒柄花素作用靶点及1 244个颈动脉粥样硬化斑块表达差异基因,两者取交集后得到55个刺芒柄花素干预颈动脉粥样硬化斑块的潜在靶点,KEGG富集分析显著富集于PPAR信号通路、MAPK信号等通路,并显示基因功能与炎症及细胞凋亡相关;运用Cytoscape筛选得到核心靶点CAP1、CXCL8、EGFR、FOS、CTSS、IGF1、MMP9、PPARG;分子对接模拟验证显示,CAP1、CXCL8、EGFR、FOS、IGF1、MMP9、PPARG等核心靶点与刺芒柄花素结合强,有较好的结合活性。 结论 刺芒柄花素作用于CAP1等多个核心靶点调节炎症相关信号通路,进而发挥抗动脉斑块形成的作用,可为后续临床用药提供数据支持。