miR-19a在鼻咽癌细胞上皮间质转化中的作用

目的 研究微小RNA-19a(miR-19a)在鼻咽癌细胞中的表达以及对体外鼻咽癌细胞上皮间质转化(EMT)的作用.方法 利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测miR-19a在鼻咽癌细胞株CNE2、SUNE-1、HNE1、58F及人正常鼻咽上皮细胞株NP69中的转录水平;使用miR-19a模拟物(miR-19a...     

转录组-芯片数据联合分析鉴定鼻咽癌发生潜在关键信号通路和调节基因

目的　本文主要探究鼻咽癌（Nasopharyngeal carcinoma，NPC）发生的潜在关键基因和信号通路。方法  通过GEO数据库中2个转录组测序数据以及1个芯片数据，总计包括57例鼻咽癌数据和9个正常对照组数据，筛选出差异表达的基因，再进行GO和KEGG等分析。结果　筛选得到580个共有上调表达基因，52个共有下调表达基因。上调基因主要与表皮、腺体和皮肤等与上皮发育相关的信号通路有关。下调基因主要与白细胞凋亡过程的负调控、Notch信号通路等有关。利用蛋白互作网络筛选，结果显示这些关键蛋白主要与G-蛋白耦合受体信号通路，趋化因子传导信号通路等有关。结论　通过联合分析转录组和芯片数据，发现了与鼻咽癌的发生有关的信号通路和关键基因，为鉴定鼻咽癌的发生发展提供了重要依据。