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目的:研究血清外泌体来源microRNA(miRNA)作为预测绝经期女性骨质疏松症的潜在生物标志物。方法:检测65岁以上骨质疏松症女性病人和健康对照者血清中的miRNA。RNA测序用于鉴定差异表达的miRNA。使用TargetScan、PicTar和miRanda数据库预测靶基因。通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein protein interaction, PPI)网络,并使用Cytoscape软件进行可视化处理。最后,利用基因本体论(gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)对目标靶基因的生物学功能进行分析。结果:绝经期女性骨质疏松病人中发现8个显著上调的miRNA。使用Cytoscope中的cytohubba插件,通过其网络功能计算出排名前十的核心基因为SOS1、ITGB3、SMAD4、PAK1、NRAS、PLCG1、MET、HGF、CCND1和CDKN1B。GO富集分析表明,靶基因主要集中在蛋白质结合、金属离子结合、DNA结合和ATP结合... 相似文献
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