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目的 构建DNA甲基化相关的肝激酶B1(LKB1)突变肺腺癌预后风险模型。方法 下载并分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库中RNA和甲基化测序数据。筛选甲基化调控显著影响预后的差异表达基因,构建预后风险模型,将LKB1突变肺腺癌患者分为高风险组和低风险组,并进行相关功能学分析。结果 筛选出3个低甲基化高表达的预后相关基因并构建LKB1突变肺腺癌的预后风险模型。多因素COX回归分析表明,Risk score可作为独立预测因子(HR>2,P<0.001)。受试者工作特征曲线证实,Risk score比其他临床病理特征有更好的生存预测能力。功能分析表明,高风险LKB1突变肺腺癌患者促癌通路激活、免疫细胞浸润程度明显高于低风险患者。结论 在LKB1突变肺腺癌中发掘了3个因异常甲基化而表达失调的分子标记物,据此构建的预后风险模型可以准确筛选LKB1突变肺腺癌患者中的高风险人群,提供生存预测,为LKB1突变肺腺癌的分子机制研究及临床预后分析提供新思路。 相似文献
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目的: 运用回顾性研究的分析方法,探究异时双原发肺癌(metachronous dual primary lung cancer,mDPLC)的独立预后因素,并建立列线图预后模型。方法: 通过美国癌症监测、流行病学和结果(Surveillance,Epidemiology and End Results,SEER)数据库获得mDPLC患者的临床数据。将数据分为训练集和验证集进行建模和验证。采用单因素和多因素Cox回归分析确定训练集患者的独立预后因素,并纳入列线图对患者生存时间进行预测。通过C-指数、校准图、受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线、决策曲线分析(decision curve analyses,DCA)和综合鉴别改进(integrated discrimination improvement,IDI)评分对预后模型的准确性和可靠性进行评价。结果: 共有610例mDPLC患者纳入训练集,260例mDPLC患者纳入验证集。Cox回归分析表明,年龄(59~76岁:HR=1.453,95%CI=1.007~2.096,P=0.046;≥77岁:HR=1.953,95%CI=1.303~2.926,P<0.001)、性别(女性:HR=0.669,95%CI=0.529~0.845,P=0.001)、病理类型(腺癌+鳞癌:HR=2.251,95%CI=1.583~3.200,P<0.001)、TNM 分期(Ⅲ:HR=1.611,95%CI=1.126~2.305,P=0.009;Ⅳ:HR=2.443,95%CI=1.713~3.486,P<0.001)、淋巴结转移(是:HR=1.653,95%CI=1.199 ~2.280,P=0.002)、手术(1次:HR=1.431,95%CI=1.110~1.844,P=0.006;0次:HR=1.845,95%CI=1.183~2.878,P=0.007)和化疗(是+否:HR=0.603,95%CI=0.433~0.842,P=0.003)是独立预后因素。训练集和验证集的C-指数分别为0.711(95%CI=0.696~0.726,P<0.05),0.677(95%CI=0.655~0.699,P<0.05)。训练集中ROC曲线的3年生存率和5年生存率AUC值分别为0.756(95%CI=0.713~0.800,P<0.05)和0.785(95%CI=0.732~0.838,P<0.05),验证集中ROC曲线的3年生存率和5年生存率AUC值分别是0.695(95%CI=0.621~0.769,P<0.05)和0.711(95%CI=0.618~0.804,P<0.05)。训练集中3年和5年的IDI值分别为9.0%(P<0.001)和11.9%(P<0.001),验证集中3年和5年的IDI值分别为6.6%(P<0.001)和7.8%(P<0.001)。根据独立预后因素建立的模型经验证可准确预测患者预后,并且效果优于TNM分期。结论: 本研究建立了一个mDPLC预后预测模型,内部验证表明该模型具有较好的效能,可为mDPLC患者提供准确和个性化的生存预测。 相似文献
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