云南壮族、傣族、哈尼族20个常染色体STR基因座遗传多态性

目的对云南壮族、傣族和哈尼族共计272例无关个体20个常染色体STR基因座进行遗传多态性研究,分别计算3个民族的群体遗传学参数,建立云南壮族、傣族和哈尼族的群体遗传学基础数据,为法医物证亲权鉴定和个体识别提供科学可靠的依据。方法采用Chelex-100法提取样本DNA,Power Plex?21 System试剂盒进行扩增,ABI 3130自动遗传分析仪对PCR复合扩增产物进行分析,用ABI的GeneMapper ID v3.2软件进行STR基因分型分析,用Modified-Powerstates软件进行法医学遗传学参数统计分析以及Hardy-Weinberg平衡检验。结果壮族群体153个样本中共检出195个等位基因,510个基因型,等位基因频率分布在0.003 3～0.554 3之间;傣族群体73个样本中共检出180个等位基因,392个基因型,等位基因频率分布0.006 8～0.554 8之间;哈尼族群体46个样本中共检出172个等位基因,362个基因型,等位基因频率分布在0.0109～0.554 3之间。除傣族群体Penta E和D6S1043外,3个群体其余基因座的基因型分布均符... 更多     

OPRM1基因DNA甲基化在物质依赖中的研究进展

物质依赖是指个体强烈地或不可自制地反复渴求滥用某种药物.尽管心理上知道经常、多次服用这种物质会给自己带来不良后果, 但仍然无法控制自己的行为.常使用的物质包括酒、海洛因、摇头丸、K粉、冰毒、大麻等.物质成瘾的调控模式由社会、环境、生物学等因素相互交织构成.其中生物学因素主要通过药物作用于中枢神经系统, 产生强大的奖赏效应.OPRM1是大多数物质依赖产生躯体依赖、戒断症状等成瘾行为的物质基础之一.研究表明OPRM1启动子高甲基化可以增加酒精依赖综合征和其他物质依赖的患病风险.就OPRM1基因的DNA甲基化与物质依赖的关联性作一综述.     

DNA甲基化的焦磷酸测序通过率

目的 研究不同的PCR产物投入量 (2.5μL, 5μL和10μL) , 对焦磷酸测序通过率的影响.方法从20例酒依赖患者和20例健康对照全血样本中提取DNA.按各样本的DNA用量200 ng进行亚硫酸盐转化, 经PCR扩增后, 按PCR产物不同投入量 (2.5μL, 5.0μL和10.0μL) , 对目的基因序列进行焦磷酸测序.结果 比较各组平均峰高值和焦磷酸测序通过率, 5μL体系的平均峰高以及焦磷酸测序通过率均高于2.5μL体系;10.0μL体系高于5μL体系, 10μL体系为最佳.3组平均峰高和焦磷酸测序通过率, 差异有统计学意义 (P<0.05) .结论 在DNA量统一为200 ng进行亚硫酸盐转化的前提下, 所得PCR产物投入量以10μL为最佳, 焦磷酸测序通过率最高, 达100%.     

云南白族民家支系18个常染色体STR位点的遗传多态性

  目的  调查云南白族民家支系2 323个健康无亲缘关系个体18个STR基因座的遗传多态性,计算群体遗传学参数,建立云南白族民家支系群体的遗传学基础数据,为司法鉴定工作中的亲子鉴定和个体识别提供可靠的科学依据。  方法  收集2323份云南白族民家支系人群无关个体样本,采用DNATyperTM19试剂盒,进行直接PCR复合扩增,用AB 3130XL自动遗传分析仪进行毛细管电泳分离,用GeneMapper ID-X 1.5软件对分离的STR进行分型。使用Modified-Powerstats软件统计等位基因频率,进行Hardy-Weinberg平衡（HWE）检验,计算匹配概率等法医学参数。使用Arlequin软件计算Fst和P值。使用Phylip软件计算Nei’s遗传距离。使用SPSS软件进行多维尺度（MDS）分析。应用Mega软件构建相邻连接（NJ）系统发育树。  结果  18个STR基因座中共观察到230个等位基因和1073种基因型。除D13S317基因座不符合Hardy-Weinberg平衡（P = 0.0008）外,其余基因座等位基因频率和基因型频率均符合Hardy-Weinberg平衡（P>0.05/18 = 0.0028）。18个STR基因座的累积个人识别能力（CDP）达0.999999999,累积非父排除概率（CPE）达0.99999994055。Fst值、Nei's遗传距离以及NJ系统发育树的结果均提示,白族民家支系与云南布朗族和云南佤族相距较远,而与大理白族和怒江白族相距较近。  结论  上述18个STR基因座在云南白族民家支系群体中具有高度多态性,可用于司法鉴定和群体遗传结构研究。     

云南苗族人群20个常染色体STR基因座遗传多态性

目的研究云南苗族群体中20个常染色体基因座的遗传多态性,建立云南苗族群体的遗传学基础数据,为法医学应用提供基础数据。方法采用Chelex-100法提取样本DNA,使用Power PlexR21 System试剂盒对747例云南苗族无关个体20个常染色体基因座(D3S1358、D1S1656、D13S317、Penta E、D16S539、D18S51、D2S1338、CSF1PO、Penta D、TH01、v WA、D21S11、D7S820、D5S818、TPOX、D8S1179、D12S391、D19S433、FGA、D6S1043)进行复合扩增,用AB 3130自动遗传分析仪进行毛细管电泳,用Genemapper ID v3.2软件进行STR基因分型分析,用Modified-Powerstates软件进行法医学遗传学参数统计分析以及Hardy-Weinberg平衡检验。结果共检测出240种等位基因和883种基因型.经检验,除D16S539、TPOX外,各基因座分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P> 0.05)。累积非父排除概率(CPE)为0.999 999 918... 更多     

云南彝族人群19个常染色体STR基因座的遗传多态性

目的 研究云南彝族215个健康无关个体19个常染色体STR基因座的遗传多态性, 计算群体遗传学参数, 建立云南彝族群体的遗传学基础数据, 为法医物证亲权鉴定和个体识别提供科学依据。方法 采用Chelex-100法提取样本DNA, Power PlexR21 System试剂盒进行扩增, ABI 3130XL自动遗传分析仪对PCR复合扩增产物进行分析, 用ABI的Gene Mapper v3.2软件进行STR基因分型分析, 用Modified-Powerstates软件进行法医学遗传学参数统计分析以及Hardy-Weinberg平衡检验。结果 共检出203个等位基因和666种基因型。除D1S1656、D5S818、D12S391外, 基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡规律 (P> 0.05) , 累积非父排除率 (CPE) 为0.999 999 907, 累积个人识别能力 (TDP) 为0.999 999 999 999 999 999 999 9。结论 19个常染色体基因座在云南彝族人群中具有较高的多态性和较好的个体识别能力, 能够为法医学个体识别和亲权鉴定提供科学的遗传学基础数据。