基于网络药理学和分子对接的通络化浊丸治疗高脂血症作用机制研究

目的:对通络化浊丸治疗高脂血症的作用机制进行网络药理学分析。方法:通络化浊丸的活性成分和靶点从TCMSP数据库中获取。借助GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD、PharmGkb数据库检索高脂血症的疾病靶点。利用STRING数据库、Cytoscape软件建立交集靶点的蛋白相互作用(PPI)网络和“药物-活性成分-靶点”网络,依据节点度值筛选出核心靶点。对核心靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析,运用AutoDock Vina软件对活性成分与核心靶点进行模拟分子对接。结果:通过对100个有效组分、68个潜在靶点的筛选,确定通络化浊丸治疗高脂血症的6种活性成分(槲皮素、芦荟大黄素、人参皂苷Rh2、丹参酮、山柰酚和隐丹参酮)和10个核心靶点(VEGFA、IL1B、MMP9、EGFR、CCL2、EGF、ICAM1、IL6、SERPINE1、TNF)。分子对接结果表明,6种关键活性成分与10个核心靶点的结合活性均优于内源性配体,说明活性成分对核心靶点有良好的选择性和稳定性。结论:从分子层面阐明通络化浊丸防治高脂血症的多组分、多靶点、多途径协同作用特点,其机制主要包括抗炎症反应、...     

基于生物信息学探讨肝癌相关细胞焦亡基因及潜在中药预测

目的 探究肝癌患者的细胞焦亡基因与预后的相关性以及细胞焦亡差异基因的相关性,并预测调控差异表达基因的中药,通过分析中药的性味归经、药物分类探讨治疗肝癌患者细胞焦亡的中医理论,为中医药现代化提供新思路。方法下载TCGA数据库中肝癌患者的转录组数据,以关键词“pyroptosis”搜索GenCards数据库,获取细胞焦亡相关基因并筛选、分析其在肝癌的表达量、共表达情况,并进行预后分析、基因本体论（gene ontology,GO）功能富集分析、DO（diease ontology）疾病分析;再通过CTD数据库查找对基因有调控作用的化学成分。最后应用COREMINE数据库查找相关中药,并统计高频中药的性味归经、药物分类。结果 共筛选出16个与预后相关的细胞焦亡基因,其中11个基因有较多相关的中药,其中高频中药为茶树根、郁金、人参、丁香、干姜等;药性以寒、温为主;药味以苦、甘为主;归经以肝、肺经居多;以补虚药、清热药、化痰止咳平喘药、解表药、理气药和活血化瘀药为主。结论 通过生物信息学技术分析得出肝癌相关细胞焦亡基因及对应的高频中药,为治疗肝癌的中药新药开发及中医药理论的微观挖掘提供思路。     

整合生物信息学鉴定与分析急性心肌梗死的特征基因及潜在中药预测（英文）

采用Gene Expression Omnibus (GEO)数据集联合机器学习研究急性心肌梗死(acute myocardial infarction, AMI)的差异基因,并预测具有调控作用的潜在成分及中药。从GEO数据库下载AMI的人类全基因组数据集(GSE66360和GSE61145),以GSE66360作为测试集,通过R语言的normalize Between Arrays包进行校正后,再调用limma包获取差异基因(DEGs),对DEGs作Gene Ontology (GO)、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)、Disease Ontology (DO)富集分析;采用SVM及随机森林树法筛选特征基因,利用GSE61145数据集对得出的特征基因进行验证;通过CTD数据库找到AMI特征基因所对应的中药成分,利用Coremine数据库映射中药成分所对应的中药,并依据《中药大辞典》、《中华本草》、《中国药典》等对所得中药的频次、四气、五味、归经进行汇总。通过对GSE66360数据集进行分析,得到317个差异基因,其中306个...     

基于生物信息学及分子对接研究温阳振衰颗粒治疗慢性心力衰竭的潜在分子机制

目的 利用生物信息学方法及分子对接技术预测温阳振衰颗粒治疗慢性心力衰竭(chronic heart failure,CHF)的活性成分、作用靶点及相关生物学途径.方法 利用TCMSP、BATMAN-TCM数据库筛选温阳振衰颗粒的活性成分及药物潜在靶点,应用GeneCards、PharmGkb、TTD、DrugBank平...     

基于“肝肺同调”探讨湖湘刘氏推拿手法治疗小儿反复呼吸道感染合并抽动症

总结湖湘刘氏推拿手法从“肝肺同调”论治小儿反复呼吸道感染合并抽动症的学术观点。小儿反复呼吸道感染合并抽动症与五脏相关,重点在于肝、肺二脏,结合现今小儿营养过剩,临床多以实证居多等特点,提出从“肝肺同调”论治小儿反复呼吸道感染合并抽动症。临床应用中打破以往“心肝有余,肺脾肾常不足”的认识,将其归结为“金实乘木”“木郁金虚”“木金两虚”,并提出风邪内外为患是本病发生之主线,由此提出三期论治：早期多取泻金平木,清化痰热而兼顾祛风;中期舒木培金,条燮肝气而兼以补肺;后期木金同补,木充金实而佐以祛风。     

巨噬细胞激活与极化在心肌纤维化的作用及中医药干预

心肌纤维化（MF）是多种心脏疾病的常见病理表现,由于心肌细胞的不可再生性,MF的发生代表心肌出现不可逆性的损伤。以往的研究认为,成纤维细胞介导的胶原沉积是心肌纤维化的主要机制。最新的研究发现,心脏本身存在免疫调控机制,巨噬细胞激活/极化在MF中占有重要地位。随着中医药研究的不断深入,学者们发现中药可通过调控肾素-血管紧张素-醛固酮系统（RAAS）系统、调节炎症进程、修复细胞外基质、管理氧化应激、维护自噬平衡等方面干预MF,而这一过程与巨噬细胞的激活及M1/M2型极化密切相关。在整个MF过程中,巨噬细胞活化是有益的,但不可过度,否则将变为有害。在MF早期,适当的M1型巨噬细胞极化有利于激活免疫,清除有害物质;在MF中后期,适当的M2型巨噬细胞极化有利于重塑受损的心肌。若巨噬细胞活化过度/不足,或M1/M2型巨噬细胞极化的平衡被打破,则效应由挽救变为破坏。具有调控巨噬细胞活化/极化的中药多具有益气养阴,理气活血的功效,但也不乏清热燥湿解毒之品。因此,MF的发生可能为气阴不足、湿热蕴毒、气滞血瘀所致。通过总结巨噬细胞激活/极化在MF中涉及的生物学过程,阐述中医药从不同角度调控巨噬细胞激活及M1/M2型极化改善MF的研究进展,以期为中医药治疗MF提供借鉴。     

基于生物信息学分析肝癌差异基因及潜在的中药干预

目的 探究肝癌患者的差异基因表达量与预后的相关性,以及差异基因在多种癌症的调控作用,并寻找潜在的治疗靶点以及对应中药,为临床中药的使用、中医药组方及加减用药提供依据.方法 从TCGA数据库下载肿瘤患者的转录组数据以及相应临床数据,使用R语言的edgeR包分析得出差异表达基因,并筛选、分析关键基因在泛癌的表达量及共表达情...     

基于生物信息学及分子对接研究天牛止眩胶囊治疗原发性高血压的潜在活性成分及分子机制

目的 利用生物信息学及分子对接,探讨天牛止眩胶囊治疗原发性高血压（essential hypertension,EH）的潜在活性成分及分子机制。方法 利用中药系统药理学数据库和分析平台、BATMAN-TCM平台筛选天牛止眩胶囊的活性成分及药物靶点,使用GeneCards、PharmGkb、TTD、DrugBank检索EH的疾病相关靶点,采用Cytoscape3.8.0软件构建“药物–成分–靶点”网络图,应用STRING平台进行蛋白质–蛋白质相互作用分析,使用R软件包进行基因本体论（gene ontology,GO）与京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）富集分析,运用AutoDockTools及AutoDock Vina进行分子对接验证,使用PyMol软件进行可视化分析。结果 共筛选出天牛止眩胶囊有效成分53种,涉及相关靶点基因422个。筛选出关键活性化合物217个,拓扑分析得出核心靶点蛋白AKT1、MAPK8、NFKB1、FOS、MAPK1、JUN等10个,GO及KEGG富集分析结果提示天牛止眩胶囊干预EH主要涉及细胞对外的刺激、对活性氧的反应、氧化应激反应等多种生物学途径与涉及脂质和动脉粥样硬化、流体剪切应力和动脉粥样硬化等相关通路。分子对接结果显示FOS与槲皮素及山柰酚结合力最强。结论 天牛止眩胶囊中的槲皮素、山柰酚等多种关键活性成分可作用于FOS、JUN、AKT等多个核心靶点蛋白,发挥调控血压、降低心脑血管并发症危险等级、保护靶器官的作用。     

基于网络药理学研究马归液干预膀胱癌的机制及验证

目的 探究自拟方马归液干预膀胱癌的分子生物学机制。方法 使用TCMSP及BATMAN-TCM数据库获得马归液组成的有效成分和作用靶点;使用GEO数据库获得肿瘤及正常样品数据集,运用RobustRankAggreg法多芯片联合分析膀胱癌差异表达基因;Cytoscape软件构建药物-成分-交集靶点网络图;对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;分子对接技术验证靶点与成分之间结合的可靠性;GEPIA数据库验证靶点的表达情况。结果 获得马归液有效成分38种,差异基因770个,药物与疾病交集靶点26个,槲皮素、山柰酚等药物关键成分,E2F2、CCNB1和TOP2A等关键靶点;主要涉及的生物学过程有细胞再生、金属离子反应和细胞通讯等;关联细胞衰老、细胞周期、脂质代谢等信号通路。结论 马归液通过靶向E2F2、CCNB1、JUN、TOP2A和MMP1等靶点,经由多个生物学过程及多条通路协同作用,发挥干预膀胱癌的作用。     

基于中医虚劳病分析心源性恶液质的辨治

结合虚劳病理论,探析心源性恶液质的中医辨治。根据虚劳病的处理原则,运用“形气神同调、病证症同治”的思维方法治疗心源性恶液质,以期为心源性恶液质的中医辨治提供参考和思路。调形注重保护心肌结构,促进形体恢复;调气重在调整生理功能,恢复脏腑气化;调神重在调畅情志,安神解郁除烦;诊疗全程注重顾护心阳,建议以参附龙牡汤为基本方,病证结合,随症加减。