空间流行病学在寄生虫病传播风险研究中的应用

空间流行病学是研究人群疾病的空间分布及影响因素的一门科学,包括疾病制图、聚集性分析和相关因素分析。随着现代空间技术的发展,空间流行病学已广泛应用于寄生虫疾病研究中的可视化分析、热点分析和危险因素的识别与传播风险的预测等领域。本文对我国重点寄生虫病传播风险研究中应用的空间分布格局、空间插值和空间模型算法等方面进行了阐述。     

基于生态位模型的云南省血吸虫病传播风险探测研究

目的基于生态位模型预测云南省血吸虫病传播风险,识别高风险区分布,为制定监测与防控措施提供依据。方法收集2004-2015年云南省18个血吸虫病流行县以村为单位的血吸虫病疫情资料和气候、地理及社会经济等13个环境变量数据,采用BIOCLIM、DOMAIN和MaxEnt等3种生态位模型构建血吸虫病传播风险探测模型,并利用受试者工作特征曲线下面积(AUC)评价模型精度。选择最佳模型分析环境变量的重要性,并预测云南省血吸虫病传播风险分布情况。结果构建的3种生态位模型均能较好地预测云南省血吸虫病传播风险的分布,其中MaxEnt模型的预测准确度最高(AUC为0.96±0.01),其次为DOMAIN模型(AUC为0.93±0.04),再次为BIOCLIM模型(AUC为0.88±0.01),三者间差异有统计学意义(P<0.05)。采用MaxEnt模型分析结果显示,影响血吸虫病分布的最主要环境因子为年平均降水量(贡献值为1.52),其次为国内生产总值和人口密度(贡献值分别为1.06和1.03)。采用MaxEnt模型预测云南省血吸虫病传播风险分布结果显示,传播风险区占云南省面积的3.1%,主要集中在西北部地区,其中低风险区和中风险区占2.7%,高风险区面积占0.4%,主要分布在鹤庆县北部、洱源县东部、大理市中部、巍山彝族自治县东北部和弥渡县北部等地区。结论基于MaxEnt生态位模型预测血吸虫病传播风险分布是可行的。云南省血吸虫病传播风险仍存在,高风险区分布较为集中,需有针对性地开展监测和防控工作。     

基于无人机影像深度学习算法的血吸虫病家畜传染源智能识别研究

目的 建立一种基于无人机影像深度学习算法的智能识别模型,初步评价其用于血吸虫病家畜传染源耕牛远程识别和监测管理的效果。方法 以环鄱阳湖地区有螺洲滩作为研究区域,采用无人机航拍采集该区域影像数据集。对数据集进行增强处理,并使用数据标注工具VGG Image Annotator标记样本数据库中的耕牛,建立耕牛形态识别标签。基于Mask R-卷积神经网络（CNN）深度学习算法建立智能识别模型用于识别耕牛分布,采用准确率、精确率、召回率、F1得分和平均精确率等指标对模型识别耕牛效果进行评价。结果 共获取200幅无人机航拍原始影像,对影像数据增强处理后获得410幅影像,标记耕牛识别训练样本2 860个。构建的Mask R-CNN深度学习识别模型在迭代200轮后收敛,模型准确率为88.01%、精确率为92.33%、召回率为94.06%、F1得分为93.19%、平均精确率为92.27%,可有效检测和分割耕牛形态特征。结论 基于无人机影像深度学习算法构建的Mask R-CNN模型识别耕牛准确性较高,可用于血吸虫病家畜传染源远程智能识别、监测和管理。     

生态位模型及其在寄生虫病传播风险研究中的应用

生态位模型是利用物种分布数据和相关环境变量,根据一定的算法建模分析物种生态需求,以预测不同时空下物种的实际分布和潜在分布。生态位建模方法越来越多地应用于传染病传播风险的预测研究,然而对其准确合理地运用需建立在理解生态位建模基本原理和特点的基础上。本文基于寄生虫病传播风险研究的角度,从生态位概念出发介绍了生态位模型的理论基础、数据获取与变量选择、模型算法、模型性能的评价手段及其在寄生虫病传播风险研究中的应用。     

江西省输入性疟疾引起继发传播的风险评估

目的评估江西省由输入性疟疾病例引起本地继发传播的潜在风险及相关影响因素,为推动全省实现消除疟疾目标,调整监测重点地区和风险人群提供科学依据。方法采用德尔菲法(Delphi method)建立江西省输入性疟疾引起继发传播的风险评价指标体系,并确定指标权重。收集江西省2012-2015年100个县(市、区)疟疾疫情、传疟媒介和防控能力等数据资料,分别计算各县(市、区)疟疾传播潜能指数(TPI)、消除疟疾防控能力指数(ICI)和疟疾传播风险指数(MRI),并绘制江西省输入性疟疾引起继发传播的潜在风险地图。结果全省疟疾传播风险指数前10位的县(市、区)分别为临川区(2.131)、信州区(1.609)、九江县(1.404)、章贡区(1.365)、丰城市(1.225)、青山湖区(1.184)、于都县(1.171)、定南县(1.018)、浔阳区(1.015)和珠山区(1.006)。风险较高的地区主要分布在地级市所在辖区以及流动人口较多的县(市、区)。结论江西省存在因输入性疟疾引起继发传播的风险,且流动人口越多、防控能力越薄弱的地区,其风险也随之增加。     

全球背景下中国与津巴布韦血吸虫病疾病负担比较

目的 分析1990—2019年全球、中国和津巴布韦血吸虫病疾病负担变化趋势,为我国制定津巴布韦血吸虫病防控策略提供参考。方法 基于2019年全球疾病负担研究（Global Burden of Disease Study 2019,GBD 2019）数据库,比较1990、2019年全球、中国和津巴布韦年龄标化血吸虫病患病率、死亡率和伤残调整寿命年（DALY）率,采用Joinpoint回归分析对1990—2019年上述指标变化趋势进行分析。采用Pearson相关分析评价1990—2019年全球、中国和津巴布韦血吸虫病疾病负担与社会人口指数（SDI）间的相关性。结果 2019年,全球年龄标化血吸虫病患病率、死亡率、DALY率分别为1 804.95/10万、0.14/10万和20.92/10万,中国分别为707.09/10万、0.02/10万和5.06/10万,津巴布韦分别为2 218.90/10万、2.39/10万和90.09/10万。随年龄增长,2019年全球血吸虫病患病率、死亡率和DALY率均呈先上升后下降趋势;中国和津巴布韦血吸虫病患病率和DALY率呈先急剧上升、后波动下降趋势,死亡率...     

常德市钉螺种群生态隔离机制的初步探析

目的 探索湖南省常德市沅江流域山丘型钉螺和湖沼型钉螺间是否存在生态隔离及其形成机制。方法 选取常德市桃源县、石门县、临澧县和澧县为山丘型钉螺采样点,选择澧县、津市市、西湖管理区、汉寿县和鼎城区(1、2、3号点)为湖沼型钉螺采集点,采集钉螺样本后对其细胞色素C氧化酶1(cytochrome C oxidase 1,cox 1)基因进行扩增和测序。使用MEGA 11软件对钉螺遗传序列进行比对和裁剪,采用DNASP 5.10.01软件分析钉螺样本单倍型,使用MrBayes 3.2软件构建贝叶斯系统进化树。采用Arlequin 3.5.2.2软件进行分子方差分析(analysis of molecular variance,AMOVA),分析遗传分化来源,计算群体间遗传分化指数(F_ST);利用R软件adegenet工具包的Monmonier算法探寻11个钉螺种群之间的遗传隔离。将沅江河段“冬陆夏水”环境斑块按上下游分成两类,将上游和下游“冬陆夏水”区域转化为栅格数据后导入Fragstats 4软件,进行景观指标分析。基于数字高程模型提取沅江河段高程变化趋势,再用R软件实现...     

我国蜱媒传染病与气象因素的相关性及其防治措施的研究进展

蜱虫在吸食动物血液的同时可携带病原体传播多种人兽共患病。经蜱传播的疾病统称为蜱媒传染病。蜱媒传染病与气象因素,尤其是温度、相对湿度、降雨量、相对大气压和风速等存在一定的相关性。本文对蜱媒传染病与气象因素相关性研究及其防治措施的研究进展进行综述,以期建立蜱媒传染病的气象模型和早期的气象预报预警系统,用于预测疾病的发生和监测疾病的发展。     

2012-2014年云南省边境地区输入性疟疾病例流行特征分析

目的 目的 分析2012-2014年云南省边境地区20个县输入性疟疾疫情特征, 为云南省消除疟疾策略的调整提供依 据。方法 方法 收集2012-2014年云南省边境地区20个县的疟疾疫情资料, 采用Microsoft Excel 2010软件对数据进行整理 分析。结果 结果 2012-2014年云南省边境地区20个县共报告疟疾病例1 558例, 其中输入性疟疾病例占85.75% （1 336/ 1 558）, 本地感染病例占14.25% （222/1 558）。2012、 2013年和2014年输入病例分别占当年报告病例总数的80.00% （544/ 680）、 89.10% （425/477） 和91.52% （367/401）。报告的1 336例输入性疟疾病例以间日疟为主, 共1 045例, 占78.22%; 恶性 疟284例, 占21.26%; 三日疟3例、 混合感染3例、 未分型1例; 报告死亡病例2例。感染来源地以缅甸为主 （1 277例）, 占 输入性病例总数的95.58%。发病人群主要为出国务工的20～40岁男性青壮年 （802例, 占60.03%）, 以4-6月发病最多 （679例, 占50.82%）。输入性病例主要分布在腾冲 （459例）、 瑞丽 （366例）、 盈江 （191例） 和芒市 （78例）。结论 结论 云南省 边境地区输入性疟疾疫情较为严重, 因此, 在消除疟疾及消除后阶段, 需建立并维持良好的监测体系, 确保能及时快速地 对输入性疟疾疫情进行响应。     

血吸虫病传播控制阶段湖沼型流行区传播风险时空分布特征研究

目的 了解湖北省江陵县血吸虫病疫情的时空分布特征,识别风险区域,为湖沼型流行区在传播控制阶段防治血吸虫病提供科学依据。 方法 收集2009-2013年江陵县的血吸虫病疫情资料,结合空间位置信息构建数据库,进行空间分析。 结果 江陵县血吸虫病居民感染率由2009年的2.15%下降至2013年的0.63%,疫情降至历史最低水平。空间分析结果显示居民血吸虫感染率在空间分布上具有聚集性,在不同年份全局空间自相关指标Moran’s I值具有统计学意义。SaTScan和FleXScan两种时空扫描分析方法分别探测出18个和35个聚集区域。结论 湖北省江陵县2009-2013年血吸虫病居民感染率呈逐年稳中下降趋势,疫情存在空间聚集性,可根据血吸虫病疫情空间分布特征因地制宜采取防控策略和措施。