BUB1基因在胃癌组织中高表达： 基于Oncomine数据库及生物信息学方法

目的 探讨细胞周期有丝分裂纺锤体检测点丝/苏氨酸激酶（BUB1）基因在胃癌（STAD）中的表达及临床价值。方法 分别运用Oncomine、GEPIA、BioGPS和Kaplan-Meier Plotter等数据库分析BUB1基因在胃癌组织和正常胃组织的表达差异,并且分析BUB1表达水平与胃癌患者生存预后之间的关系;利用癌症细胞系全科百科全书（CCLE）分析BUB1分别在胃癌组织T细胞和B细胞中的表达,利用String数据库绘制BUB1相关蛋白网络图及基因本体（GO）功能注释,并对京都基因和基因组百科全书（KEGG）相关通路进行分析。采用肿瘤免疫评估资源（TIMER）数据库分析BUB1在免疫浸润物中的表达及对胃癌患者生存预后的影响。为进一步验证Oncomine数据库基因芯片的结果,我们选择成都医学院第一附属医院2018年3月~2019年7月收治的胃癌患者30例,经外科手术获得胃腺癌组织30份,同时获取的癌旁正常组织30份作为对照组,通过PCR和免疫组化技术对Oncomine数据库中BUB1基因表达的数据进行验证。结果 Oncomine、GEPIA、BioGPS分析显示：与正常胃组织相比,BUB1在胃癌组织中呈现高表达（P<0.05）。通过Kaplan-Meier生存分析发现,BUB1基因高表达的胃癌患者无进展生存期（HR=0.52,95%CI=0.41~0.67,P<0.05）、总生存期（HR=0.67,95%CI=0.55~0.82,P<0.05）均有所延长。通过string数据收集到与BUB1相关 蛋白主要富集于13类细胞学组分、4类分子功能和12类生物学过程,并参与了4条信号通路。TIMER数据库分析显示在免疫微环境中高表达BUB1 mRNA的CD4+T细胞和巨噬细胞对胃癌患者5年生存预后较好。实时定量PCR结果提示胃癌组织样本 BUB1的表达水平（4.345±0.421）明显高于配对的癌旁正常胃粘膜组织（1.583±0.122）（t=34.63,P<0.05）;免疫组化结果提示胃癌组织BUB1染色成阳性。结论 胃癌组织中BUB1基因呈现高表达,BUB1可能具有减少肿瘤免疫抑制作用可协助评估胃癌患者的预后情况。     

局部使用曲安奈德联合常规介入方法治疗良性中央气道狭窄疗效及安全性的Meta分析

目的 系统评价纤支镜下局部使用曲安奈德联合常规介入方法治疗良性气道狭窄的疗效及安全性.方法 根据中英文检索词计算机全面检索PubMed、Cochrane Library、 EMbase、Web of science、万方、维普、中国知网,检索时限设置为建库至2019年8月,收集所有关于纤支镜下局部使用曲安奈德联合常规介...     

miR-127-3p对气道瘢痕成纤维细胞的增殖和Ⅰ、Ⅲ型胶原蛋白、α-平滑肌肌动蛋白分泌的影响

目的:研究miR-127-3p对气道瘢痕成纤维细胞增殖和Ⅰ、Ⅲ型胶原蛋白、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)分泌的影响。方法:组织样本均来源于2018年1月至2020年1月成都医学院第一附属医院呼吸与危重症医学科就诊的良性气道瘢痕狭窄的患者8例。对气道瘢痕组织标本应用基因芯片筛选出和正常气道黏膜组织差异表达的miRNA,...     

丝裂霉素C对良性气道狭窄干预效果的荟萃分析

目的系统评价丝裂霉素C治疗良性气道狭窄疗效及安全性。方法计算机检索PubMed、EMbase、Webofscience、万方、中国学术期刊全文数据库,检索时限设置为建库至2019年9月,检索关于丝裂霉素C治疗良性气道狭窄的临床随机对照试验。由2位研究者按照纳入和排除标准独立对文献进行筛选,并加以资料提取及方法学质量评价,采用Stata10.0软件进行数据分析。结果共纳入13篇随机对照研究文献,包括440例气道良性狭窄患者。meta分析结果显示:治疗组总体客观有效率高于对照组(RR=1.23,95%CI:1.08~139,P<0.05)。根据人种的不同,对该研究进行亚组分析,结果显示:在亚洲人群中,治疗组客观有效率高于对照组(RR=1.22,95%CI:1.04~144,P<0.05);在高加索人群中,治疗组客观有效率也高于对照组(RR=1.24,95%CI:101~1.51,P<005)。同时,治疗组经丝裂霉素治疗后气道直径(SMD=047,95%CI:0.20~0.75,P<0.05)及气促评分(SMD=0.47,95%CI:0.13~082,P<0.05)均优于对照组;治疗组6个月内介入治疗次数也低于对照组(SMD=-2.30,95%CI:-2.88^-1.72,P<0.05)。2组不良反应发生率差异无统计学意义(RR=1.21,95%CI:0.58~250,P>0.05),可对症缓解。结论在单纯气道介入治疗基础上加以丝裂霉素C可改善患者气促症状,减少气道介入治疗的频次,且不良反应少,患者总体耐受较好,具有一定的临床应用价值。     

POLE2在肺腺癌组织中表达及其生物信息学分析

目的 利用肿瘤相关数据库探讨DNA聚合酶εB亚基(POLE2)基因在肺腺癌中的表达及其对生存预后的影响.方法 使用GEPIA数据库和Oncomine数据库分析不同肺腺癌数据集中POLE2 mRNA的表达情况,利用Kaplan-Meier Plotter进行POLE2表达水平与肺腺癌病人总生存期的相关性分析.利用cBio...     

基于生物信息学方法分析雌激素受体相关基因在女性结核病患者中的表达及意义

目的　探索女性结核病患者雌激素受体相关联的基因并进行实验验证。方法　下载GSE114911、GSE54992、GSE83456 3个数据集的基因表达谱。使用R软件探索来自女性的结核组织样本与正常组织样本之间的差异基因。在线数据库DAVID用于差异基因的富集分析。使用相互作用基因/蛋白质检索的搜索工具和Cytoscape软件对雌激素受体基因和差异基因进行网络构建。取我院女性肺结核患者肺结核组织和正常肺组织标本，运用实时定量PCR、Western blot检测关键基因在肺结核组织和正常肺组织中的表达水平。结果　3个数据集的交集显示了24个差异基因。使用GO功能注释将24个差异基因分为生物学过程、分子功能和细胞组分3个类别。随后进行了KEGG分析，总共有10个差异基因和雌激素受体密切相关。其中，CCL20、CXCR3与雌激素受体关联最为密切的基因。运用实时定量PCR发现，肺结核组织样本中的CCL20 mRNA表达水平为2.56±0.34，低于配对的正常肺组织的7.88±0.51（t=-2.375，P=0.003），CXCR3 mRNA表达水平为8.35±1.76，高于配对的正常肺组织的1.24±0.34（t=1.384，P=0.008）；Western blot验证结果与实时定量PCR结果趋势一致。结论　本研究通过多个数据库对CCL20、CXCR3进行生物信息学分析，发现雌激素受体相关基因可能在女性结核病中发挥作用，为结核病的分子机制提供新的见解。     

电磁导航支气管镜引导冷冻肺活检对肺外周结节的诊断价值

目的评价电磁导航引导冷冻肺活检对外周型肺孤立型小结节(SPN)的诊断价值。方法回顾性分析2016年1月1日-2018年7月8日于该院用不同方法行经支气管肺组织活检的76例外周型SPN(直径≤3.0 cm)患者的临床资料,根据活检方法的不同分为电磁导航引导冷冻肺活检(ENBCB)组和电磁导航引导活检钳肺活检(ENBLB)组,比较两种活检方法的标本大小、诊断率、操作时间及并发症,最后诊断结果通过外科手术切除病灶行病理检查或者随访2年至临床治愈确诊。结果 ENBCB组和ENBLB组的病灶平均直径分别为(21.0±8.0)和(22.0±8.0)mm。两组病灶大小比较,差异无统计学意义(t=0.68,P=0.590)。ENBCB组及ENBLB组活检标本大小分别为(10.5±4.2)和(2.9±1.3)mm~2,差异有统计学意义(t=-14.56,P 0.05);ENBCB组和ENBLB组的诊断率分别为89.2%(33/37)和69.2%(27/39),ENBCB组诊断率高于ENBLB组(χ~2=4.55,P=0.033)。亚组分析:病灶直径为2.0～3.0 cm时两组诊断率差异无统计学意义(χ~2=0.00,P=1.000);病灶直径2.0 cm时,ENBCB组诊断率高于ENBLB组(χ~2=4.88,P=0.027)。ENBCB组与ENBLB组的操作时间分别为(64.7±14.2)和(36.4±12.8)min,两组差异有统计学意义(t=-18.78,P=0.002);并发症方面,两组均未发生严重大出血和气胸,轻到中度出血的病例ENBCB组为40.5%(15/37),ENBLB组为17.9%(7/39),差异有统计学意义(χ~2=4.71,P=0.030)。结论与ENBLB相比,ENBCB操作时间相对较长,但在获得标本大小及提高外周型SPN的诊断率方面具有优势,安全性良好。