广西新诊断HIV/AIDS患者HIV-1整合酶区基因突变及整合酶抑制剂耐药分析

目的 了解广西新诊断HIV-1感染者整合酶抑制剂（integrase stand transfer inhibitors,INSTIs）耐药率、HIV-1整合酶区耐药相关多态性位点的突变率及影响因素。方法 使用课题组2019年10月—2020年3月收集的广西新诊断HIV/AIDS患者血液样本，提取HIV-1整合酶区RNA、巢式PCR扩增整合酶基因并测序。利用斯坦福HIV耐药数据库确定患者HIV-1整合酶区耐药突变位点并计算患者耐药率。通过序列比对分析HIV-1整合酶区耐药相关多态性突变位点，使用多因素logistic回归分析HIV-1整合酶区耐药相关多态性位点发生突变的影响因素。结果 320例HIV-1患者的HIV-1整合酶区序列中，以CRF01＿AE亚型（39.4%）为主，耐药率为2.19%，主要耐药突变位点为E92K(0.62%),次要耐药突变位点主要为E157Q(1.25%)。发生频率较高的HIV-1整合酶区耐药相关多态性位点有L74V(0.94%)、E138D(1.25%)和G163E(3.13%)。多因素logistic回归分析显示：HIV-1整合酶区耐药相关多态性突变的影响...     

2012—2022年广西HIV-1独特重组型毒株近似全长基因序列特征分析

目的：研究广西HIV-1独特重组型毒株（URFs）的基因重组特点，为广西HIV-1疫情防控提供科学依据。方法：对1例pol区基因序列初步判断为URF的HIV-1感染者的血液样本进行RNA提取、巢式PCR扩增全长基因并测序，从PubMed等数据库检索2012—2022年发表的有关广西URFs近似全长基因组的文章及对应的序列，构建系统进化树，并进行重组模式、断点分析和耐药突变位点分析。结果：测序获得1例长度约8.9 kb的URF，该URF是以CRF08＿BC为骨架插入CRF01＿AE片段构成的二代重组毒株。将该URF与数据库中检索到的12例广西URFs共同分析，发现广西URFs主要来源于性传播途径感染者和静脉吸毒感染者。所有URFs均包含CRF01＿AE片段，以01＿AE/07＿BC重组比例最高（69.2%,9/13）,1例URF含有主要耐药位点。结论：广西已鉴定的URFs数量较少，以01＿AE/07＿BC重组为主，应加强对URFs的监测和鉴定，以全面了解广西HIV-1重组毒株的特点。