结直肠癌中FAM135B基因的表达及功能的生物信息学分析

目的通过生物信息学分析研究结直肠癌与正常结肠粘膜间基因表达的差异,找出关键的差异表达基因,从而预测参与结直肠癌发生发展中的关键基因。方法从GEO表达谱数据库中下载表达谱基因芯片数据GSE50760(包括18例结直肠癌样本及配对的正常结肠粘膜组织)。利用Morpheus在线软件对基因芯片GSE50760的数据进行分析,获得在结直肠癌与正常结肠粘膜组织中差异表达的基因,并构建聚类分析热图。利用human protein atlas在线数据库获得差异表达基因在结直肠癌与正常结肠粘膜组织中的免疫组化表达水平。并进一步利用human protein atlas数据库的数据对差异表达基因在结直肠癌患者中的表达高低进行生存分析。结果通过分析GSE50760获得前100个差异表达的基因。利用human protein atlas在线数据库对这100个差异表达基因的免疫组织表达水平进行分析发现,FAM135B基因在结直肠癌组织中的表达比正常结肠粘膜中的表达明显下调。生存分析也提示当FAM135B基因高表达时,结直肠癌患者的预后相对较好。结论 FAM135B可能是结直肠癌中潜在的抑癌基因,其表达下调在结直肠癌的发生发展过程发挥重要作用,并可能成为判断结直肠癌患者预后的重要的生物学指标。     

原发性肝细胞肝癌中PinX1的表达及其临床意义

【摘要】 目的 探讨Pin2/TRF1结合蛋白X1(PinX1)在原发性肝细胞肝癌中的表达及其临床意义。方法〓收集我院43例原发性肝细胞肝癌患者的癌和癌旁正常组织以及病例资料,通过实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)检测PinX1 的mRNA表达水平,并分析表达差异与临床病理特征及患者预后的关系,卡方检验分析率的差异,应用Kaplan-Meier法进行生存分析,Cox风险比例回归模型筛选预后影响因素。结果〓在43对癌和癌旁正常组织标本中,29例(67.4%)肝癌组织中的PinX1 mRNA呈低表达,而相应的癌旁组织只有14例(32.6%)呈低表达,差异具有统计学意义(P<0.05);PinX1 mRNA表达水平与患者年龄具有相关性,生存分析和Cox单因素、多因素风险比例回归模型表明癌组织中PinX1 mRNA低表达是肝癌患者总生存期的独立预后因子(HR=5.057,P=0.005;HR=3.761,P=0.006)。结论〓PinX1可能是原发性肝细胞肝癌中潜在的抑癌基因,其表达下调在肝癌的发生发展过程发挥重要作用,并可能成为判断肝癌患者预后的重要的生物学指标。     

热休克蛋白90AB1在肝细胞癌中的表达及初步验证

目的:探讨热休克蛋白90ABl(heat shock protein 90 kDa alpha,class B member 1,Hsp90AB1)在肝细胞癌中的表达意义.方法:使用免疫组织化学染色方法检测肝细胞癌组织芯片中Hsp90AB1的表达.运用生物信息学技术分析肝细胞癌相关基因芯片GSE54238;在数据库GE...