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目的 通过生物信息学方法分析非梗阻性无精子症(NOA)和正常男性睾丸间质细胞中的差异表达基因及其核心基因。方法 采用生物信息学方法整合GEO(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)中的GSE149512数据集,选取无生精障碍的人群为正常组,NOA患者为NOA组。运用R软件(版本4.02)中的Seurat包(版本4.0)整合分析GSE149512的数集,并采用非线性降维UMAP的方法进行细胞聚类分析;通过Find All Markers函数,获取细胞聚类的Marker基因,并查询Human Cell Landscape(HCL)数据库进行细胞注释,并绘制差异表达基因的可视化热图;运用Cytoscape软件(3.6.1版)的ClueGO和CluePedia插件对差异基因的进行GO功能富集和KEGG通路分析;通过String数据库(http://string-db.org),构建差异基因的PPI网络;运用CytoHubba插件中的5种运算方法(Degree、DMNC、EPC、MCC、MNC)识别PPI网络中的核心基因并绘制韦恩图。结果 整合GSE149512数据集,... 相似文献
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