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目的 探究20种常见氨基酸在结直肠癌(CRC)患者的尿液特征;寻找CRC诊断的生物学标志物。方法 纳入100名健康对照者和113名CRC患者(Ⅰ期27例,Ⅱ期28例,Ⅲ期34例,Ⅳ期24例),基于超高效液相色谱串联质谱法对尿液中的20种常见氨基酸应用多反应监测技术进行靶向定量分析,应用统计学方法分析CRC患者与健康对照氨基酸含量差异,并构建CRC诊断模型。结果 CRC患者尿液中16种氨基酸含量与健康对照差异有统计学意义,Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ和Ⅳ期各自有9种,15种,14种,17种氨基酸含量与健康对照差异有统计学意义。由异亮氨酸,天冬酰胺,脯氨酸,组氨酸,酪氨酸,苯丙氨酸6种氨基酸构建的生物标志物组合用于CRC诊断的AUC值在发现组/验证组分别为0.857/0.851,在Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ和Ⅳ期CRC的AUC值分别为0.847,0.843,0.897,0.896。结论 尿液中20种氨基酸含量变化可以用于CRC诊断,为CRC的早期诊断提供了新的研究思路。 相似文献
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以质谱为基础的定量蛋白质组学分析技术的发展,大大加快了肿瘤标志分子的研究进程。细胞培养稳定同位素标记技术,已成为目前定量蛋白质组学的主要策略之一,它将不同来源或不同状态的细胞分别培养于含轻/重型稳定同位素标记必需氨基酸的培养基中,经过若干次细胞倍增后,稳定同位素按照序列特异的方式,完全掺入到新合成的蛋白质中。通过比较标记前后同一肽段的质谱峰值变化,可以实现对蛋白质的精确定量。它具有样本需求量少、简单、直接、高效及定量准确等特点,不仅可以定性和定量地分析差异表达蛋白质,而且可以分析蛋白质翻译后修饰和蛋白质相互作用,已逐渐成为研究差异蛋白质组的重要工具之一,在肿瘤分子标志研究中发挥重要作用。 相似文献
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目的:探讨食管鳞癌组织clusterin表达和单纯手术治疗前后外周血clusterin含量变化与食管鳞癌临床参数的相关性.方法:RT-PCR分析5对食管鳞癌及其远端切缘食管上皮中clusterin基mRNA表达水平;ELISA分析41例单纯手术治疗食管鳞癌患者治疗前后的血清clusterin蛋白表达水平及其与临床特征的相关性.结果:与正常食管上皮相比食管鳞癌组织中clusterin基因表达显著下降或缺失.食管鳞癌患者术前血清中clusterin含量明显低于术后血清含量(3.23 mg/Lvs 25.71 mg/L,P<0.0001).食管鳞癌患者术前血清clusterin含量与肿瘤大小相关(P<0.01),而与年龄、性别、分化程度、肿瘤分期、淋巴结转移.以及总蛋白、白蛋白、血糖、血脂和总胆红素浓度无关(r=-0.1334,-0.1602,0.2413,0.0389,-0.2882,均p>0.05).结论:clusterin基因在食管鳞癌组织中表达明显下调或缺失,血清clusterin含量明显降低,提示在食管鳞状细胞癌中clusterin基因可能具有潜在的抑癌基因作用,动态检测外周血clusterin含量有助于判断食管癌进展. 相似文献
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[目的]自20世纪90年代开始,人们利用杂合性缺失(loss of heterozygosity,LOH)技术寻找引起食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)癌变的肿瘤抑制基因.但除了TP53 、CDKN2A等以外,目前很多高频LOH区域的抑癌基因仍未发现.随着近年来生物学信息公共数据库的建设发展,有必要重新筛选分析ESCC中的潜在抑癌基因.[方法]利用Pubmed检索1991~2012年间的食管癌LOH文章,整理信息,综合考虑LOH频率和文献重复鉴定次数后,利用Circos软件绘制并确认了ESCC中高度可信LOH热点区域.对每一区域,利用人类基因组数据库、肿瘤抑制基因数据库和人类蛋白质图集数据库分析其中的候选抑癌基因.[结果]基于85篇针对ESCC的LOH相关文献,共确定10个ESCC高度可信LOH热点区域,主要累及3p、5q、9p、13q、17p、17q等染色体臂.基于3个公共数据库的分析,在每个区域中均确定了一个以上的候选抑癌基因,其中很多基因从未在ESCC中受到关注.[结论]综合考虑文献中对LOH区域的可重复鉴定性可避免原始文献质量和样本选择偏倚等的干扰.利用公共数据库深入挖掘ESCC中的候选抑癌基因,为后续选择合适的靶基因开展深入的表达和功能分析提供了理论依据. 相似文献
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结直肠癌(CRC)的发生发展是一个多步骤、多阶段演进的复杂过程,近30年来,随着现代科学技术的飞跃发展,人们发现除了经典的"腺瘤——癌序贯"模型外,还有15%的病例通过"锯齿状"通路癌变。结直肠癌具有高度的异质性,微卫星不稳定、染色体不稳定、CpG岛甲基化等遗传学和表观遗传学特征可以以各种组合形式共存于肿瘤细胞中。因此随着个体化精准医学的发展,对结直肠癌精准分子分型的需求也日益迫切。本文将就结直肠癌的基因和蛋白分子分型体系及其临床意义展开探讨。 相似文献
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目的:探讨食管鳞癌细胞和组织中STMN1的表达与食管鳞癌病理分级的关系.方法:一维(1-D)Western blot分析8种食管鳞癌细胞的STMN1表达,二维(2-D)Western blot分析KYSE180食管鳞癌细胞中STMN1的表达与修饰状态.免疫组织化学分析食管鳞癌组织及其配对样本食管上皮STMN1表达和定位,以及卡方检验统计分析食管癌组织STMN1表达与临床分级的关系.结果:STMN1在人食管鳞癌细胞WHCO1、ECO156、KYSE510、KYSE180、KYSE170、KYSE150、KYSE140和KYSE30中广泛表达.2-D Western blot结果表明STMN1在食管癌细胞KYSE180中呈现为一个具有较强信号的蛋白点和另一个具有较弱信号的,等电点偏碱性的蛋白点,提示STMN1可能存在特定修饰状态.Western blot结果显示,与正常食管上皮相比,食管癌组织中STMN1表达升高(69.2%,9/13).食管癌组织芯片免疫组织化学分析结果显示STMN1在72%(13/18)肿瘤组织中高表达较STMN1在17.6%(3/17)癌旁食管上皮表达具有统计学意义(P<0.05),但与组织病理分级无关(P=0.646).结论:STMN1蛋白在食管鳞癌细胞和组织表达上调并伴随部分修饰,提示在食管鳞癌组织中STMN1具有癌基因的作用,参与食管癌变进程. 相似文献