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摘要:目的 采用网络药理学的方法探究灯银脑通胶囊(DYNT)治疗脑卒中的有效成分群及关键靶点预测。方法
基于中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药研究综合数据库(TCMID)和 TCM-Mesh,收集 DYNT的化学
成分,并通过 DrugBank、毒性与基因比较数据库(CTD)、STITCH、BindingDB和SwissTarget等数据库预测 DYNT各化
学成分的靶点数据。在 DisGeNET、PharmGKB和 CTD 数据库中检索脑卒中相关靶点,取疾病靶点和 DYNT 成分相关
靶点交集作为 DYNT作用脑卒中的潜在靶点。通过 STRING 数据库建立蛋白质相互作用(PPI)网络,使用 MCODE
cluster识别 DYNT的核心靶点。运用 CTD数据库对 DYNT治疗脑卒中相关靶点及调控脑卒中相关通路进行 GO 富集
分析和 KEGG信号通路富集分析。利用 MCC 和 Stress两种算法识别网络中排名前十的关键靶点,取两者交集作为
DYNT治疗脑卒中的关键靶点。结果 从 DYNT中共收集到133个化学成分,涉及靶点588个,化学成分中木犀草素、
山奈酚和芹菜素等59个成分参与了对脑卒中的调控。DYNT 治疗脑卒中的靶点共有 153个,涉及通路 12个,基于
MCC和Stress两种算法发现 DYNT治疗脑卒中的8个关键靶点。结论 DYNT 中的各化学成分可能通过 PI3K-Akt、
HIF-1和 Toll样受体等12条信号通路发挥对脑卒中的调控作用,AKT1、MAPK3、TP53、IL6、VEGFA、TNF、INS和
ALB可能为 DYNT治疗脑卒中的8个关键靶点。 相似文献
2.
目的检测人巨细胞病毒(HCMV)编码的微小核糖核酸miR-UL112-3p(hcmv-miR-UL112-3p)在口腔扁平苔藓患者血浆中的水平,探讨其潜在的临床价值。方法收集74例口腔扁平苔藓患者血液样本,包括13例全血标本和61例血浆标本;同时收集年龄、性别匹配的健康人全血标本12例和血浆样本51例。用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法测定全血标本中外周血白细胞HCMV DNA滴度;ELISA法测定血浆中抗HCMV Ig G和Ig M抗体含量;用基于TaqMan探针的qRT-PCR技术分别在初筛人群(患者21例,对照18例)和验证人群(患者40例,对照33例)中测定血浆样本中hcmv-miR-UL112-3p水平。结果口腔扁平苔藓患者外周血白细胞中HCMV DNA滴度显著高于健康人对照组[(17 319±15 311)copies/m L vs(2 672±2 368)copies/m L,t=3.273,P0.01]。两组间血浆抗HCMV Ig G(100%vs 93.65%)和Ig M抗体阳性率(0 vs 0)差异无统计学意义。初筛人群中hcmv-miR-UL112-3p在患者组中的水平[3.531(1.969,4.691)]显著高于健康人对照组[0.450(0.303,0.722)](U=2.0,P0.01);验证人群中患者组hcmv-miR-UL112-3p水平[1.348(0.964,2.593)]显著高于对照组[1.039(0.803,1.549)](U=441.0,P0.05)。多元logistic回归显示,hcmv-miR-UL112-3p与口腔扁平苔癣疾病相关(OR=6.00,P0.01)。结论hcmv-miR-UL112-3p在口腔扁平苔藓患者血浆中显著升高,可能是口腔扁平苔藓疾病潜在的血清学指标,值得进一步深入研究。 相似文献
3.
目的:研究铜死亡相关基因(cuproposis-related genes, CRGs)在肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma, ccRCC)中的表达情况,构建预后模型并探讨其临床意义。方法:从TCGA数据库中获得522例ccRCC患者的转录组数据和临床病理数据。将患者随机分为训练集(262例)和验证集1(260例),并将总体患者作为验证集2(522例)。在训练集中采用差异性分析确定肿瘤组织和癌旁组织差异性表达的CRGs,使用LASSO-Cox回归分析构建ccRCC的CRGs预后模型(OSCRG)。根据OSCRG将患者分为低危组和高危组,使用Kaplan-Meier生存分析研究OSCRG与总体生存期(overall survival, OS)的关系。使用单因素和多因素Cox回归分析构建包含OSCRG和临床病理参数的列线图预测OS,并在验证集中验证该列线图的准确性。最后使用KEGG和GO基因富集分析探索差异性表达的CRGs的生物学功能。结果:在训练集中有9个差异性表达的CRGs,并且均与OS相关。LASSO-Cox回归分析确定了3个CRGs并构建O... 相似文献
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目的 探讨新型甲基丙烯酸酐化明胶(gelatin methacryloyl,GelMA)/骨髓间充质干细胞(bone marrow mesenchymal stem cells,BMSCs)复合水凝胶应用于大鼠颅骨缺损区的成骨性能,为骨再生生物材料的应用提供实验依据。方法 本研究经南京大学动物伦理委员会批准。通过组合光引发剂苯基(2,4,6-三甲基苯甲酰基)磷酸锂[lthium phenyl(2,4,6-trimethylbenzoyl)phosphinate,LAP]、GelMA、BMSCs构建光固化复合生物水凝胶GelMA/BMSCs,扫描电子显微镜(scanning electron microscope,SEM)和能量色散X射线光谱仪(energy dispersive X-ray spectroscopy,EDX)检测GelMA凝胶表面微观形态及元素构成,电子万能试验机测试凝胶压缩强度。将GelMA/BMSCs水凝胶在体外培养1、2、5 d后,通过CCK-8检测水凝胶包封的BMSCs细胞增殖活性,利用共聚焦显微成像技术观察其存活情况和细胞形态;在大鼠颅骨制备5 mm临界骨缺模... 相似文献
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目的 评价计算机辅助设计与制造(computer aided design and computer aided manufacturing,CAD/CAM)新型纳米复合陶瓷Lava Ultimate髓超嵌体和长石质瓷Vita TriLuxe髓超嵌体修复根管治疗后牙体缺损的临床效果。方法 选取2017年1—12月于南京市口腔医院牙体牙髓病科就诊的58例患者根管治疗后缺损磨牙60颗,随机均分为两组,其中观察组30颗,采用Lava Ultimate髓超嵌体修复;对照组30颗,采用Vita TriLuxe髓超嵌体修复。根据改良美国公共卫生署(United States Public Health Service,USPHS)标准,比较两组临床修复效果。结果 60颗修复体均效果良好,无修复体脱落,仅在对照组发现1例修复体折裂情况;观察组在边缘密合性、完整性、继发龋和牙龈炎症方面与对照组比较,差异无统计学意义(P > 0.05);但观察组的对颌牙磨耗情况轻于对照组,差异有统计学意义(P < 0.05)。结论 Vita TriLuxe髓超嵌体和Lava Ultimate髓超嵌体皆可用于修复根管治疗后的牙体缺损,新型纳米复合陶瓷Lava Ultimate相较于长石质瓷Vita TriLuxe更能减少对颌牙的磨耗,值得临床推广应用。 相似文献
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目的 评估根管内留存的镍钛器械分离片段对根管治疗预后的影响。方法 选取2011年1月至2013年3月南京大学医学院附属口腔医院牙体牙髓病科进行根管治疗发生镍钛器械分离且未取出患者40例,分析器械分离牙位、分离片段长度、分离片段位置、患牙临床诊断对根管治疗预后的影响。结果 根管治愈率为80.0%,器械分离发生牙位与根管治疗预后无明显关系。牙髓炎组治愈率为84.6%,根尖周炎组治愈率为71.4%,差异无统计学意义(P>0.05)。结论 根管内留存镍钛器械分离片段对根管治疗预后无明显影响。 相似文献
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目的探讨肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)患者血清外泌体微小核糖核酸-181a-3p(microRNA-181a-3p, miR-181a-3p)的表达变化,及其作为非侵入性辅助诊断RCC标志的临床价值。
方法收集2016年6月至2017年6月期间,南京总医院泌尿外科收治的未经治疗的79例RCC患者和75名年龄、性别匹配的健康体检者血清标本,分离血清外泌体并提取RNA。用实时荧光定量聚合酶链反应(quantitative real-time polymerase chai reaction,qRT-PCR)检测两组miR-181a-3p水平的2-△Ct相对定量含量,并采用多种统计方法分析外泌体miR-181a-3p诊断RCC的效能。
结果qRT-PCR检测RCC患者血清外泌体miR-181a-3p的表达水平为0.264(0.095~0.782),较健康对照组[0.068(0.032~0.130)]明显上调(U=1022,P<0.001);同时,血清外泌体miR-181a-3p水平在早期(I/II期)RCC患者[0.202(0.105~0.543)]中也显著升高(U=699,P<0.001)。血清外泌体miR-181a-3p的受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)区分RCC与健康对照者的曲线下面积(AUC)为0.828(95%CI:0.765~0.890),敏感度为72.2%,特异度为72.0%;诊断I/II期RCC患者的AUC为0.837(95%CI:0.771~0.902),敏感度和特异度分别为75.4%和72.0%。经逻辑回归分析,血清外泌体miR-181a-3p是RCC的独立危险因素(OR=6.662,95%CI:3.294~13.474,P<0.001)。
结论RCC患者尤其早期患者血清外泌体miR-181a-3p显著升高,其可作为非侵入性辅助诊断RCC的新型分子标志。 相似文献
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目的: 检测miR 222 3p在肾细胞癌组织中的表达,探讨其参与肾细胞癌发生发展的分子机制。方法: 运用qRT PCR检测15对肾细胞癌组织和对应癌旁组织miR 222 3p的表达水平。生物信息学预测miR 222 3p的靶基因,荧光素酶报告实验验证其靶向调控作用。运用免疫组化和蛋白质印迹技术检测癌组织中靶基因蛋白表达水平。进一步通过脂质体瞬时转染技术实现肾细胞癌细胞株769 P中miR 222 3p过表达,采用流式细胞术检测miR 222 3p对细胞凋亡的影响。结果: qRT PCR结果显示,miR 222 3p在肾细胞癌组织的表达水平显著高于癌旁组织(P<0.01)。生物信息学预测显示,抗凋亡蛋白Bim是miR 222 3p潜在的靶基因。荧光素酶报告实验证实,过表达miR 222 3p可抑制含有Bim 3’ UTR的荧光素酶报告基因的荧光素酶活性,但对Bim 3’ UTR突变体的荧光素酶活性没有影响。免疫组化结果显示,肾细胞癌组织中Bim蛋白免疫组化阳性反应程度明显低于相应的癌旁组织(P<0.01);蛋白质印迹结果进一步证实Bim蛋白在肾细胞癌组织中的表达较癌旁组织明显下调(P<0.01)。进一步在769 P细胞中瞬时过表达miR 222 3p后,发现Bim蛋白水平明显下调(P<0.01),但Bim mRNA水平无明显变化。流式细胞术检测结果显示,过表达miR 222 3p可显著抑制769 P细胞的凋亡(P<0.01)。 结论: miR 222 3p可通过靶向作用于抑癌基因Bim表达抑制肾癌细胞的凋亡,在肾癌的发生发展中起重要作用,miR 222 3p/Bim轴为肾细胞癌治疗提供新的途径。 相似文献