阿尔茨海默病差异表达基因的生物信息学分析

目的：应用生物信息学方法分析阿尔茨海默病(Alzheimer,s disease,AD)不同病情程度的差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs）,在分子水平上探讨AD的发病制,为研究AD提供新思路。方法：从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)下载基因芯片数据集GSE28146,使用在线分析工具GEO2R分别筛选AD轻度组、中度组和重度组与正常对照组比较的DEGs。运用DAVID 数据库对筛选出的DEGs进行基因本体（gene ontology,GO）富集分析和京都基因与基因百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路分析,通过STRING数据库构建蛋白相互作用网络,并采用Cytoscape软件筛选关键基因。结果：AD轻度组、中度组和重度组分别筛选出881、896和1142个DEGs。GO功能富集显示：轻度组与凋亡相关过程的激活、调节免疫反应、蛋白质磷酸化等生物过程密切相关,中度组与炎症反应、凋亡调节、钙离子的释放等生物过程密切相关,重度组与NF-κB的激活、蛋白质磷酸化和去磷酸化、细胞外基质的降解等生物过程密切相关。KEGG分析显示：轻度组主要富集到p53和TGF-β等信号通路,中度组主要富集到癌症途径、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、细胞黏附分子等信号通路,重度组主要富集到细胞周期、Hippo信号通路、神经活性配体-受体相互作用等信号通路。蛋白互作网路分析各组富集程度最高的前5个关键基因：轻度组为GART、EHMT2、KRAS、ESR1、CD44;中度组为CBLB、HERC1、UBE2G1、UBE2M、HECW2;重度组为UBE2C、SOCS3、FBXW7、UBE3B、UBA6。结论：采用生物信息学方法分析不同病情程度的AD,所富集的信号通路和筛选出的关键基因可能在AD发生发展过程中起重要作用,为进一步深入研究AD提供了依据和思路。     

基因捕获技术在肝癌侵袭和迁移相关基因筛选中的应用

目的：用基因捕获技术在肝癌细胞SMMC7721细胞中寻找与肝癌侵袭和迁移相关的基因。方法：首先,将pU21质粒转染到肝癌细胞SMMC7721细胞,用G418筛选出单克隆稳定细胞系;其次,采用Transwell小室实验和划痕实验,检测这些单克隆细胞侵袭和迁移能力的变化;最后,用5’-Full RACE实验、T克隆及基因测序检测这些细胞系中被pU21质粒捕获的基因。结果：成功获得了约300株稳定转染pU21质粒的单克隆细胞系,得到了约30株侵袭和迁移能力增强的细胞株和约40株侵袭和迁移能力减弱的细胞株。通过5’-Full RACE实验、T克隆及基因测序检测,证明了在A554细胞系中,被pU21质粒捕获的基因是long inter-genic non-protein coding RNA 52（LINC00052）。结论：应用基因捕获技术筛选肝癌侵袭和迁移相关基因是可行的。     

201例交通事故导致膝关节损伤的法医学分析

目的 探讨交通事故导致膝关节损伤的特点,为其法医学鉴定提供客观依据. 方法 对2006 -2008年间经重庆法医验伤所鉴定的201例交通事故导致的膝关节损伤案例进行回顾性研究. 结果 根据膝关节的损伤类型,将本组案例分为骨损伤组、软组织损伤组及骨合并软组织损伤组.通过对各组膝关节功能情况的分析发现:对于负重情况,其正常率以及不能负重率,骨损伤组以及骨合并软组织损伤组均与软组织损伤组差异有统计学意义(P＜0.05). 结论 将患者的负重情况、行走功能以及步态情况纳入鉴定过程,会使交通事故导致膝关节损伤的法医学鉴定更为合理.     

中国老年人代谢综合征患病率META分析

目的 通过Meta分析描述我国老年人代谢综合征（Metabolic syndrome，MS）患病率水平，为老年人MS的防控提供科学依据。方法 系统检索2005—2021 年在中国期刊全文数据库（CNKI）、万方数据资源系统（Wanfang database）、维普数据库（VIP）及PubMed、Embase、Cochrane library中收录的有关中国老年人MS患病率研究的文献。采用美国卫生保健质量和研究机构（Agency for Healthcare Research and Quality, AHRQ）编制的横断面研究质量评价量表对入选文献进行文献质量评价。采用Stata 16.0软件进行数据合并估算患病率，并对性别、地区差异、发表时间、年龄因素进行亚组分析，采用Egger检验判断发表偏倚，通过排除其中任意一篇文献对合并效应值的影响来进行敏感性分析。结果 共纳入21篇研究文献，共77190名老年人，中国老年人MS的合并患病率为23.9%（95%CI:21.8%~26.1%）；亚组分析显示，老年男性的合并患病率为21.6%（95%CI:19.5%~23.8%），老年女性的合并患病率为26.1%（95%CI:23.6%~28.6%），老年女性的MS的合并患病率明显高于男性（P=0.008）；而以地域，年龄以及发表年度作为亚组划分，各组老年人MS的合并患病率无明显差异。结论 近20年来，我国老年人MS患病率无明显变化，应注重对老年女性MS的预防。     

基于1H-NMR技术的SD大鼠弥漫性轴索损伤血浆代谢组学研究

目的：采用核磁共振氢谱（1H-NMR）结合模式识别的方法研究SD大鼠弥漫性轴索损伤（diffuse axonal injury,DAI）后血浆代谢的变化,探讨1H-NMR在DAI中应用的可行性,并筛选出DAI的早期差异代谢物。方法：采用改良的Marmarou A法建立SD大鼠DAI模型,分为打击致伤组（n=6）,假手术组（n=6,给予打击致伤组相同的打击前准备,但不予以打击）,于致伤后1 d抽取心血,分离出血浆。应用1H-NMR结合模式识别技术对大鼠血浆进行代谢组学分析,筛选差异代谢物。结果：通过对打击致伤组与假手术组血浆代谢组差异代谢物的相关性分析及独立样本t检验,筛选出相关系数丨r丨＞0.6且P＜0.05的差异代谢物。结果显示,与假手术组相比,打击致伤组血浆中丙酮酸（Pyruvate）（r=-0.831,P=0.019）、赖氨酸（Lysine）（r=-0.773,P=0.030）、谷氨酸（Glutamate）（r=-0.772,P=0.042）、谷氨酰胺（Glutamine）（r=-0.772,P=0.042）、异丁酸（Isobutyrate）（r=-0.631,P=0.045）、甘油（Glycerol）（r=-0.844,P=0.032）明显升高,丙二酸二乙酯（Malonate）（r=0.699,P=0.038）、L2（r=0.786,P=0.047）、L3（r=0.666,P=0.031）、L4（r=0.715,P=0.022）、L10（r=0.663,P=0.025）、β-葡萄糖（β-Glucose）（r=0.800,P=0.030）、α-葡萄糖（α-Glucose）（r=0.808,P=0.015）明显降低。结论：基于1H-NMR结合模式的方法对DAI后血浆的代谢组学分析是可行的,所筛选出的13种差异代谢物及其表达变化,不仅为进一步探索DAI的病理生理机制提供了新的研究基础;同时,对于临床DAI的早期诊断、治疗及法医学鉴定提供了重要的方法和依据。     

SD大鼠急性乙二醇中毒的法医病理学研究

目的：探讨急性乙二醇（ethylene glycol,EG）中毒的病理学变化,为急性EG中毒的法医病理学鉴定提供客观诊断依据。方法：将30只SD大鼠随机分为空白对照组和急性EG中毒组,急性EG中毒组用12 ml/kg的EG行灌胃处理。取各组动物的心脏、肝脏和肾脏等组织标本,行HE染色。并用透视电子显微镜（transmission electron microscopy,TEM）观察各组动物的肾脏和肝脏。结果：急性EG中毒组的各组织样本均有不同程度的损害,以肾脏损害最为严重,并可见淡蓝色草酸钙结晶。TEM下可见急性EG中毒组的肾小管上皮细胞和肝脏细胞的细胞质及管腔内有圆形、椭圆形高密度电子颗粒（草酸钙结晶）沉积。结论：各组织器官草酸钙结晶沉积和以肾脏损害为主的靶组织器官病理变化或可作为急性EG中毒的法医学鉴定的病理诊断依据。     

基于气相色谱-质谱联用技术的甲状腺功能亢进性心脏病大鼠心脏组织代谢组学分析

目的 通过气相色谱-质谱(GC-MS)联用技术探究甲状腺功能亢进性心脏病(HHD)大鼠心肌组织代谢物变化,筛选相关代谢通路,阐明HHD可能的发病机制。方法 将20只SD大鼠随机分为对照组和HHD组,给予相应药物干预后,采集大鼠心脏组织进行GC-MS分析,结合多变量、单变量统计分析及数据库检索,筛选出HHD可能的潜在生物标志物,利用MetaboAnalyst 5.0软件对筛选出的潜在生物标志物进行代谢通路分析。结果 相对于对照组,HHD组共筛选鉴定出57种差异代谢物作为潜在生物标志物,这些潜在生物标志物参与了39条代谢通路,其中丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢,β-丙氨酸代谢,牛磺酸和亚牛磺酸代谢,甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢,戊糖和葡萄糖醛酸相互转化,氨酰-tRNA生物合成其6条代谢通路变化明显。结论 HHD心脏组织中氨基酸、糖类、脂类和核苷酸等代谢水平发生明显变化;上述6条代谢通路异常可能是HHD潜在发病机制。