组蛋白赖氨酸去甲基化酶家族在膀胱癌中的表达模式及其潜在作用：基于多组学分析

目的 探讨 19 个组蛋白赖氨酸去甲基化酶（KDMs）在膀胱癌多组学中的表达模式与潜在作用。方法 本研究使用UALCAN和GSCALite分析来自TCGA的膀胱癌样本的KDMs的转录表达和甲基化水平、体细胞变异多组学高通量测序数据。使用Kaplan Meier-Plotter和Assistant for clinical bioinformatics探讨KDMs的表达对BLCA样本的预后影响。利用Timer和GSCALite分析KDMs在膀胱癌中的免疫浸润和药物敏感性。结果 分析结果首先揭示了KDMs在膀胱癌多组学中的表达特征,并不是所有KDMs都具有一致的表达模式。转录组数据分析显示KDM1A/1B/2B/4A/4B/5B/5C的表达上调（P<0.05）,而KDM3B/6B/7C的表达下调。甲基化水平差异分析显示KDM1A/3B/4A/4B/4C/5A/5B/5C/7B的甲基化水平下调,而KDM7C甲基化水平上调（P<0.05）。相关性分析显示,14个KDMs家族成员的转录水平与甲基化水平呈负相关,其中KDM1A最显著。突变分析显示,KDM6A非同义突变频率最高,突变种类最多,且与其它KDMs 的非同义突变具有互补性。生存分析显示,KDM3A/4C/5D/6A/7B对BLCA患者总生存率具有保护性作用,而KDM3B/5B/5C对BLCA患者无复发生存率具有危险性影响。综合预后模型证实KDM4C/6A/7B具有膀胱癌预后生物标志物的潜在作用,其表达与BLCA患者免疫浸润呈正相关。药物敏感性分析显示,KDM2B/3B/4B/4C/5A与大多数抗癌药物呈负相关,而KDM2B/4B与6种抗癌药物呈正相关（P<0.05）。结论 本研究系统性地揭示了KDMs基因家族在膀胱癌中的高突变互补性、过表达与低甲基化负相关性的特征,并与膀胱癌预后、免疫浸润和药物敏感性密切相关。     

miRNA介导的病毒-人相互作用研究进展

微小RNA（microRNA,miRNA）是一类内源性,长度约为22核苷酸的单链RNA分子,可通过5′端的种子区与靶标转录本mRNA的3′UTR配对,导致靶mRNA的降解或翻译抑制。越来越多的研究发现,miRNA在介导病毒-人相互作用过程中发挥着重要的作用,作用模式包括病毒miRNA靶向人及自身的转录本、人miRNA靶向病毒及自身的转录本、病毒的miRNA介导人miRNA调控的网络、RNA干扰（RNAi）相关和干扰素相关的宿主对病毒的抑制及反抑制。miRNA介导的病毒-人相互作用的研究对于全面理解病毒-宿主相互作用的机制、开发抗病毒的药物具有重要意义。     

miRNA靶基因计算分析新方法及其应用研究

目的 miRNA通过抑制靶标发挥作用,对于miRNA的功能研究,依赖于它们所调控的靶标,预测炎症相关miRNA及其靶基因。方法将基因组分析结果和miRNA靶标预测结果融合。结果通过两种方法所产生数据的叠加,可以挑选出候选的关键miRNA和关键靶基因作为进一步实验研究的线索。结论将基因组分析与靶标预测相结合可以有效地减少假阳性预测结果,缩小实验验证的范围。     

结合基因组分析预测炎症相关miRNA及其靶标

目的：预测炎症相关miRNA及其靶基因。方法：将基因组分析结果和miRNA靶标预测结果融合。结果：通过两种方法所产生数据的叠加,可以挑选出候选的关键miRNA和关键靶基因作为进一步实验研究的线索。结论：将基因组分析与靶标预测相结合可以有效减少假阳性预测结果,缩小实验验证的范围。