BRD7逆转录病毒稳定系的构建及其功能评价

目的探索BRD7（bromodomain．containingprotein7）是否具有抑癌基因的功能。方法根据NCBI提供的BRD7基因序列设计特异性引物扩增其编码区序列,经酶切、连接转化后进一步挑取单克隆菌落进行菌液PCR筛选及测序鉴定得到阳性重组质粒。共转293T细胞后收集浓缩病毒上清并感染U20S细胞,24h后用嘌呤霉素（puromycin）筛选稳定表达BI①7、的细胞株。结果菌落PCR扩增及DNA测序分析证明重组pMSCV-BRD7．GFP质粒克隆成功。GFP绿色荧光结果显示,绝大部分细胞成功整合了pMSCV-GFP或pMSCV-BRD7．GFP外源质粒;Westernblotting检测发现感染重组质粒pMSCV-BRD7．GFP的细胞株中BRD7蛋白的表达水平显著高于对照组。功能结果显示,过表达BRD7显著抑制U20S细胞的增殖,促进下游靶基因p21与MDM2的表达。结论本研究成功构建了针对BRD7基因的逆转录病毒稳定系,且初步证明了BRD7发挥抑癌基因的功能,为下一步深入研究其被调控的机制与功能奠定了基础。     

反转录病毒介导基质金属蛋白酶特异性组织抑制剂1基因转染骨髓间充质干细胞的成骨能力

背景：间充质干细胞成骨分化早期是成骨性细胞外基质细胞外间质的堆积,其主要成分均是基质金属蛋白酶特异性组织抑制剂1(tissue Inhibitor of Metalloproteinases 1,TIMP-1)作用的基质金属蛋白酶作用底物,通过增加TIMP-1的表达,是否可以抑制基质金属蛋白酶的活性,进而影响间充质干细胞的成骨分化能力？ 目的：观察反转录病毒介导TIMP-1基因转染骨髓间充质干细胞的成骨能力。 方法：设计In-Fusion引物扩增TIMP-1基因片段,与酶切后线性化的pBABE-Puro反转录病毒表达载体进行位点同源重组,构建TIMP-1基因反转录病毒表达载体,RT-PCR和测序验证,并使用GP-293细胞进行包装。通过密度梯度法分离人下颌骨来源骨髓间充质干细胞,流式细胞仪验证其表面标记。将TIMP-1反转录病毒包装液感染骨髓间充质干细胞并筛选稳定表达TIMP-1细胞株,RT-PCR和蛋白电泳验证其表达,并使用成骨诱导液诱导10 d,观察其对成骨能力的影响,RT-PCR验证其成骨相关基因的表达。 结果与结论：经测序证实,RT-PCR所获得的TIMP-1基因 cDNA 序列与NM_003254.2(624 bp)序列完全一致;通过表面标记鉴定证实成功分离了人骨髓间充质干细胞,并具良好的成骨、成脂能力;RT-PCR和Western Blot验证反转录病毒载体成功介导TIMP-1转染骨髓间充质干细胞,RT-PCR表明成骨诱导10 d时,TIMP-1基因感染组成骨增加,RUNX-2和COL1 mRNA表达增加。提示TIMP-1基因可通过反转录病毒成功转染人骨髓间充质干细胞,并能促进其成骨。     

反转录病毒介导基质金属蛋白酶特异性组织抑制剂1基因转染骨髓间充质干细胞的成骨能力

背景：间充质干细胞成骨分化早期是成骨性细胞外基质细胞外间质的堆积,其主要成分均是基质金属蛋白酶特异性组织抑制剂1（tissue Inhibitor of Metalloproteinases1,TIMP-1）作用的基质金属蛋白酶作用底物,通过增加TIMP-1的表达,是否可以抑制基质金属蛋白酶的活性,进而影响间充质干细胞的成骨分化能力？目的：观察反转录病毒介导TIMP-1基因转染骨髓间充质干细胞的成骨能力。方法：设计In-Fusion引物扩增TIMP-1基因片段,与酶切后线性化的pBABE-Puro反转录病毒表达载体进行位点同源重组,构建TIMP-1基因反转录病毒表达载体,RT-PCR和测序验证,并使用GP-293细胞进行包装。通过密度梯度法分离人下颌骨来源骨髓间充质干细胞,流式细胞仪验证其表面标记。将TIMP-1反转录病毒包装液感染骨髓间充质干细胞并筛选稳定表达TIMP-1细胞株,RT-PCR和蛋白电泳验证其表达,并使用成骨诱导液诱导10d,观察其对成骨能力的影响,RT-PCR验证其成骨相关基因的表达。结果与结论：经测序证实,RT-PCR所获得的TIMP-1基因cDNA序列与NM_003254.2（624bp）序列完全一致;通过表面标记鉴定证实成功分离了人骨髓间充质干细胞,并具良好的成骨、成脂能力;RT-PCR和Western Blot验证反转录病毒载体成功介导TIMP-1转染骨髓间充质干细胞,RT-PCR表明成骨诱导10d时,TIMP-1基因感染组成骨增加,RUNX-2和COL1mRNA表达增加。提示TIMP-1基因可通过反转录病毒成功转染人骨髓间充质干细胞,并能促进其成骨。     

反转录病毒介导基质金属蛋白酶特异性组织抑制剂1基因转染骨髓间充质干细胞的成骨能力

背景:间充质干细胞成骨分化早期是成骨性细胞外基质细胞外间质的堆积,其主要成分均是基质金属蛋白酶特异性组织抑制剂1（tissue Inhibitor of Metalloproteinases1,TIMP-1）作用的基质金属蛋白酶作用底物,通过增加TIMP-1的表达,是否可以抑制基质金属蛋白酶的活性,进而影响间充质干细胞的成骨分化能力?目的:观察反转录病毒介导TIMP-1基因转染骨髓间充质干细胞的成骨能力。方法:设计In-Fusion引物扩增TIMP-1基因片段,与酶切后线性化的pBABE-Puro反转录病毒表达载体进行位点同源重组,构建TIMP-1基因反转录病毒表达载体,RT-PCR和测序验证,并使用GP-293细胞进行包装。通过密度梯度法分离人下颌骨来源骨髓间充质干细胞,流式细胞仪验证其表面标记。将TIMP-1反转录病毒包装液感染骨髓间充质干细胞并筛选稳定表达TIMP-1细胞株,RT-PCR和蛋白电泳验证其表达,并使用成骨诱导液诱导10d,观察其对成骨能力的影响,RT-PCR验证其成骨相关基因的表达。结果与结论:经测序证实,RT-PCR所获得的TIMP-1基因cDNA序列与NM₀03254.2（624bp）序列完全一致;通过表面标记鉴定证实成功分离了人骨髓间充质干细胞,并具良好的成骨、成脂能力;RT-PCR和Western Blot验证反转录病毒载体成功介导TIMP-1转染骨髓间充质干细胞,RT-PCR表明成骨诱导10d时,TIMP-1基因感染组成骨增加,RUNX-2和COL1mRNA表达增加。提示TIMP-1基因可通过反转录病毒成功转染人骨髓间充质干细胞,并能促进其成骨。     

ARH3通过稳定MCM2-7表达促进神经胶质母细胞瘤增殖

目的 探讨ADP-核糖水解酶ARH3在神经胶质母细胞瘤内促进细胞增殖的机制。方法 通过GEPIA2和CPTAC数据库分析ARH3在胶质母细胞瘤中的mRNA及蛋白水平的表达量;设计两条siRNA并分别转入胶质母细胞瘤细胞系U87和LN229细胞内沉默ARH3的表达,利用Western Blot验证ARH3的敲低效率;克隆形成检测细胞增殖情况;流式细胞术检测不同时期的细胞比例;利用EdU实验检测细胞处于S期的比例;构建Flag标签的ARH3过表达载体并转染进入细胞,通过免疫共沉淀技术结合质谱分析ARH3的相互作用蛋白组并进行相关通路网络富集分析;通过细胞转染siRNA结合Western Blot验证ARH3对细胞周期相关蛋白稳定性的影响;采用细胞转染siRNA结合质谱技术分析ARH3沉默后胶质母细胞瘤细胞内部的信号通路网络变化。结果 GEPIA2和CPTAC数据库结果显示胶质母细胞瘤显著高表达ADP-核糖水解酶ARH3(P<0.05);在胶质母细胞瘤U87和LN229内敲低内源ARH3后,克隆形成数目减少（P<0.05）;流式结果显示内源性ARH3敲降细胞G1期比例增加（P&l...     

幽门螺杆菌尿素酶基因的克隆及表达

目的构建幽门螺杆菌尿素酶基因B亚单位（ureB）的原核表达质粒,诱导重组蛋白表达。方法以幽门螺杆菌基因组DNA为模板,PCR扩增尿素酶基因B亚单位,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳分离后连接克隆载体并测序,构建重组原核表达载体。结果成功扩增出1710bp的目的基因,测序结果证实与预期一致,该基因在大肠杆菌表达系统中得到表达。结论在大肠杆菌中成功表达幽门螺杆菌尿素酶基因B亚单位蛋白,为幽门螺杆菌疫苗的研发奠定了基础。     

BRD7逆转录病毒稳定系的构建及其功能评价

目的探索BRD7(bromodomain-containing protein7)是否具有抑癌基因的功能。方法根据NCBI提供的BRD7基因序列设计特异性引物扩增其编码区序列,经酶切、连接转化后进一步挑取单克隆菌落进行菌液PCR筛选及测序鉴定得到阳性重组质粒。共转293T细胞后收集浓缩病毒上清并感染U2OS细胞,24h后用嘌呤霉素(puromycin)筛选稳定表达BRD7的细胞株。结果菌落PCR扩增及DNA测序分析证明重组pMSCV-BRD7-GFP质粒克隆成功。GFP绿色荧光结果显示,绝大部分细胞成功整合了pMSCV-GFP或pMSCV-BRD7-GFP外源质粒;Western blotting检测发现感染重组质粒pMSCV-BRD7-GFP的细胞株中BRD7蛋白的表达水平显著高于对照组。功能结果显示,过表达BRD7显著抑制U2OS细胞的增殖,促进下游靶基因p21与MDM2的表达。结论本研究成功构建了针对BRD7基因的逆转录病毒稳定系,且初步证明了BRD7发挥抑癌基因的功能,为下一步深入研究其被调控的机制与功能奠定了基础。     

NUDT9通过稳定MCM3的蛋白表达促进恶性肿瘤增殖

目的 探讨ADP-核糖焦磷酸酶NUDT9促进肿瘤增殖的分子机制。方法 分析GEPIA2数据库中NUDT9在多种肿瘤中的表达水平;利用Western Blot免疫印迹法检测蛋白表达水平;通过克隆形成数量检测细胞增殖速度;使用流式细胞术检测细胞周期变化;EdU染色实验检测S期细胞比例;转染外源质粒SFB-NUDT9联合免疫共沉淀法和定量质谱技术鉴定NUDT9的相互作用蛋白;分别设计两条sgRNA和siRNA在肿瘤细胞中沉默NUDT9基因的表达,结合免疫印迹法检测NUDT9蛋白表达水平及其对细胞增殖相关蛋白表达水平的影响。结果 GEPIA2数据库显示NUDT9在多种肿瘤细胞中高表达;利用CRISPR和小干扰RNA技术均有效沉默NUDT9基因的表达;克隆形成、流式细胞术及EdU增殖实验均表明敲低NUDT9后抑制癌细胞的增殖及G1/S期转换;转染外源质粒SFB-NUDT9结合免疫沉淀法和定量质谱技术鉴定出与细胞增殖相关的NUDT9互作蛋白MCM2-7;通过转染siRNA沉默NUDT9再结合免疫印迹法,发现NUDT9的敲低影响MCM复合物中MCM3的蛋白表达水平;最后转染siRNA沉默MCM3基因...     

免疫沉淀——质谱联用揭示RCC2在乳腺癌MDA-MB-468细胞系中的新功能

目的 分析RCC2蛋白在乳腺癌MDA-MB-468细胞系中的互作蛋白组并揭示其功能调控网络。方法 运用酶切技术结合一代测序构建携带Flag标签RCC2蛋白过表达载体，慢病毒包装感染构建Flag-RCC2过表达的MDA-MB-468稳转细胞株。采用Flag抗体凝胶珠亲和沉淀，收集蛋白样品进行高敏感度质谱鉴定。生物信息蛋白组学分析互作蛋白组，包括GO注释，KEGG通路富集，构建蛋白互作网络（PPIN）。 结果 高可信度164个蛋白聚类分析显示，RCC2及其互作蛋白显著富于核糖体相关通路中，具有RNA与核蛋白体结合能力，揭示其参与蛋白翻译与成熟的过程。结论 成功鉴定RCC2互作蛋白组，揭示RCC2在乳腺癌细胞中发挥新的翻译调控功能。     

反转录病毒介导基质金属蛋白酶特异性组织抑制剂1基因转染骨髓间充质干细胞的成骨能力

背景：间充质干细胞成骨分化早期是成骨性细胞外基质细胞外间质的堆积,其主要成分均是基质金属蛋白酶特异性组织抑制剂1(tissue Inhibitor of Metalloproteinases 1,TIMP-1)作用的基质金属蛋白酶作用底物,通过增加TIMP-1的表达,是否可以抑制基质金属蛋白酶的活性,进而影响间充质干细胞的成骨分化能力？ 目的：观察反转录病毒介导TIMP-1基因转染骨髓间充质干细胞的成骨能力。 方法：设计In-Fusion引物扩增TIMP-1基因片段,与酶切后线性化的pBABE-Puro反转录病毒表达载体进行位点同源重组,构建TIMP-1基因反转录病毒表达载体,RT-PCR和测序验证,并使用GP-293细胞进行包装。通过密度梯度法分离人下颌骨来源骨髓间充质干细胞,流式细胞仪验证其表面标记。将TIMP-1反转录病毒包装液感染骨髓间充质干细胞并筛选稳定表达TIMP-1细胞株,RT-PCR和蛋白电泳验证其表达,并使用成骨诱导液诱导10 d,观察其对成骨能力的影响,RT-PCR验证其成骨相关基因的表达。 结果与结论：经测序证实,RT-PCR所获得的TIMP-1基因 cDNA 序列与NM_003254.2(624 bp)序列完全一致;通过表面标记鉴定证实成功分离了人骨髓间充质干细胞,并具良好的成骨、成脂能力;RT-PCR和Western Blot验证反转录病毒载体成功介导TIMP-1转染骨髓间充质干细胞,RT-PCR表明成骨诱导10 d时,TIMP-1基因感染组成骨增加,RUNX-2和COL1 mRNA表达增加。提示TIMP-1基因可通过反转录病毒成功转染人骨髓间充质干细胞,并能促进其成骨。