基因组时代卒中遗传学研究的文献计量学及可视化分析

目的 对人类基因组工作草图公布以来卒中遗传学、基因组学领域已发表的论文进行文献计量学研究,分析该领域的研究现状、热点及发展趋势。方法 以一代测序（2000—2007年）、全基因组分型芯片（2008—2015年）和二代测序（2016年至今）为代表性技术,将2000年至今划分为3个阶段。在WebofScience核心合集检索脑血管病领域发表的遗传学、基因组学方面的英文文献,对文献的发表时间、地区、研究机构等信息进行汇总,使用VOSviewer 1.6.18进行统计分析并对结果进行可视化。使用H指数评估论文产出数量与论文水平。结果 共纳入8833篇英文文献。美国是卒中遗传学、基因组学领域文献的最主要贡献者,发文量高达3291篇,H指数为182,发文量和H指数在所有国家/地区中均居首位。中国发文1765篇,H指数为66,分别排名第2位和第10位。国际卒中遗传学联盟是该研究领域的重要参与者,联盟和主要负责人的发文量居所有作者的前20名。卒中遗传学、基因组学的研究热点从早期的关联分析和荟萃分析,逐步过渡到近几年兴起的孟德尔随机化研究。结论 在卒中遗传学、基因组学领域,我国虽然起步较晚,但在发文总量...     

基于文献计量学分析缺血性脑血管病预后的基因组学研究

目的 分析2017—2022年缺血性脑血管病（ischemiccerebrovasculardisease,ICVD）预后的基因组学研究现状、研究热点及前沿领域。方法 在WebofScience核心合集（SCI-EXPANDED）中检索2017年1月1日—2022年10月1日ICVD预后的基因组学相关文献。使用CiteSpace软件分析文献中发文国家、机构、作者间的合作网络;参考文献、参考文献第一作者、期刊的共被引网络;参考文献的聚类结果;关键词的共现网络及其聚类结果,并使用可视化图谱呈现结果。结果 共纳入353篇文献。中国发文144篇,居全球首位,但仅与5个国家建立了合作关系。首都医科大学是发文最多的机构,共20篇。国际卒中遗传学联盟成员在发文量前10位的作者中占据6位,是发文的主力军并形成了主要的合作团簇。研究方法多使用全基因组关联分析和孟德尔随机化。近年来的研究热点是探究卒中预后与其他复杂疾病的共同遗传通路、影响抗血小板药物疗效的遗传变异,以及炎症机制在预后中的影响。结论 ICVD预后的基因组学研究热度逐年上升,已形成多个研究热点,主要探索相关潜在机制来推动新药研发。     

面向临床研究的基因测序项目的设计原则、管理流程与质量控制标准

目的 开发并搭建适用于临床研究的基因测序项目管理和数据质量控制流程,为基于队列的组学分析、疾病机制探索、药物靶标开发等提供技术保障.方法 基于生物医学研究中小样本的测序流程,参考国际大规模测序队列,形成面向临床研究的基因测序项目框架.从样本处理、测序数据生成、生物信息学分析、项目的质量保证、数据安全与生物样本安全等多个...     

锌指同源框3基因多态性与不同亚型缺血性卒中结局的特异性关联研究

目的 分析中国卒中人群中锌指同源框3（zinc finger homeobox 3，ZFHX3）基因单核苷酸变异（single nucleotide variant，SNV）位点对卒中结局的影响。 方法 本研究基于全国多中心前瞻性中国国家卒中登记研究Ⅲ，连续纳入2015年8月-2018年3月首 次发生急性缺血性卒中或TIA的患者，收集人口学信息、病史和卒中结局等相关临床资料。卒中结局 包括随访1年内卒中复发（缺血性卒中或出血性卒中）、联合血管事件（卒中、心肌梗死及血管性死亡 事件）及不良功能结局（mRS＞2分）。采用竞争性等位基因特异性PCR技术对3个SNV位点（rs7193343、 rs879324、rs12932445）进行基因分型。对于研究过程中的计量资料和计数资料，分别采用线性回归 或逻辑回归进行关联分析；对于卒中结局，分别采用Cox或逻辑回归进行关联分析。 结果 最终纳入7674例患者，平均年龄61.7±11.5岁，其中女性2438例（31.77%）。关联分析结果 显示，处于高度连锁不平衡状态（相关系数R 2=0.88）的rs879324和rs12932445位点与心房颤动、入 院时NIHSS评分及卒中亚型有关联。在不同卒中亚型中，3个SNV位点均与1年联合血管事件相关，在 校正年龄、性别及心房颤动协变量后关联性仍然显著。在心源性栓塞型卒中患者中，rs7193343位点 的T等位基因与卒中复发、联合血管事件的发生有关联（校正HR 1.92，95%CI 1.21～3.05；校正HR 1.95，95%CI 1.26～3.01）；rs879324位点的A等位基因和rs12932445位点的C等位基因与联合血管事 件有关联（校正HR 1.58，95%CI 1.10～2.27；校正HR 1.66，95%CI 1.16～2.38）。在原因未明型卒中患 者中，rs7193343位点的T等位基因与卒中复发和联合血管事件的发生有关联（校正HR 1.34，95%CI 1.09～1.64；校正HR 1.36，95%CI 1.11～1.66）。校正相关因素后未发现3个SNV位点与不良功能结局之 间存在关联。 结论 ZFHX3基因上的变异位点与特定卒中亚型的卒中复发及联合血管事件的发生风险存在关联， 但未发现与不良功能结局有关。     

既往卒中病史对缺血性脑血管病患者卒中结局的影响研究

目的 探讨中国人群中首发和复发缺血性脑血管病患者的临床特征和卒中结局差异。 方法 本研究基于全国多中心前瞻性中国国家卒中登记研究Ⅲ（the third China national stroke regi stry,CNSR-Ⅲ）,连续纳入2015年8月-2018年3月急性缺血性卒中或TIA患者,收集人口学信息、血 管危险因素、既往用药史及病因分型系统（causative classification system,CCS）等临床资料,记录随 访3个月和1年时卒中结局。卒中结局包括卒中复发（缺血性卒中或出血性卒中）、联合血管事件（卒中、 心肌梗死及血管性死亡事件）、脑血管病源性死亡及不良功能结局（mRS＞2分）。依据患者既往是否 有卒中病史分为有卒中病史组和无卒中病史组,比较两组的临床特征及卒中结局差异,并分析卒中病 史与卒中结局间的关系。 结果 最终纳入15 166例患者,平均年龄62.2±11.3岁,其中女性4802例（31.7%）;有卒中病史患者 3355例,无卒中病史患者11 811例。有卒中病史组患者年龄,冠心病、高血压、脂代谢紊乱、糖尿病、心 房颤动比例,既往用药史比例、入院NIHSS评分、住院期间降糖和降压治疗比例均高于无卒中病史组, 目前吸烟和重度饮酒比例、入院时LDL-C水平及住院期间抗血小板治疗比例低于无卒中病史组,差 异均有统计学意义。两组CCS分型的分布差异有统计学意义,其中有卒中病史组大动脉粥样硬化型和 心源性栓塞型卒中比例高于无卒中病史组。多因素分析结果显示,卒中病史是随访3个月不良功能结 局（校正OR 1.25,95%CI 1.09～1.44,P =0.002）,随访1年卒中复发（校正HR 1.44,95%CI 1.25～1.67, P＜0.001）、联合血管事件（校正HR 1.43,95%CI 1.24～1.64,P＜0.001）、脑血管病源性死亡（校正 HR 1.42,95%CI 1.12～1.80,P =0.004）、不良功能结局（校正OR 1.63,95%CI 1.42～1.88,P＜0.001）的 危险因素。 结论 有无卒中病史的缺血性卒中患者的临床特征及随访结局差异较大,尽管患者进行卒中二级 预防治疗,卒中病史仍然是患者1年卒中复发、联合血管事件、脑血管病源性死亡及不良功能结局的 危险因素。     

脑血管病基因组学数据分析流程建设

目的 建立并优化适合于脑血管病基因组学数据分析的生物信息流程,促进脑血管病多组学和精 准医学研究的开展。      

基于单细胞转录组的围产期卒中性别差异原因探究

目的 通过对人脑胚胎发育中期的血管组成细胞进行分析,探索围产期卒中性别差异的可能原因。方法 对公开发表的性别相关全基因组关联分析（genome-wide association study,GWAS）结果和血管单细胞转录组进行联合分析,确定性别差异相关的细胞类型。通过基因差异表达分析和功能富集分析,确定性别对细胞功能的影响,分析围产期卒中性别差异产生的潜在原因。结果 经过判定,在胚胎发育中期血管单细胞转录组数据集的7例样本中,有4例男性和3例女性。典型的周细胞（P=0.018）和处于分裂状态的壁细胞（P=0.011）的表达谱与生物学性别的GWAS关联基因显著相关,而平滑肌细胞、成纤维细胞和全部5种内皮细胞类型与性别GWAS关联基因无明显相关性。总计345个基因在男性周细胞中显著高表达、619个基因在女性周细胞中显著高表达,这些差异表达基因分别富集在独特的生物学通路中,也同时富集在细胞能量代谢相关通路中。结论 周细胞具有很强的性别差异性,可能是围产期卒中性别差异产生的原因。     

CRP基因rs3093068位点多态性与缺血性卒中危险因素及卒中结局的相关性研究

目的 探索CRP基因rs3093068位点多态性与缺血性卒中相关危险因素和卒中结局的相关性.方法 本研究基于中国国家卒中登记Ⅲ(China national stroke registry-Ⅲ,CNSR-Ⅲ)队列中的遗传亚组数据库,连续纳入2015年8月-2018年3月首次发生缺血性卒中或TIA的患者,收集人口学信息、...