转录因子YY1在肝细胞癌中的表达和功能研究

目的探讨转录因子YY1在肝细胞癌进展中的作用并揭示其发挥功能的潜在分子机制。方法生物信息学分析TCGA、GEO及ICGC公共数据库中肝癌组织中YY1的表达及其与临床病理特征及预后的关系。并在本院收集的肝癌石蜡切片行免疫组化实验验证。采用CCK-8、Edu染色及克隆形成实验探讨YY1对肝癌细胞增殖能力的影响,采用Transwell实验探讨YY1对肝癌细胞迁移及侵袭能力的影响。通过基因集富集分析、基因共表达分析和蛋白质互作网络分析探讨YY1发挥功能的潜在分子机制。结果分析TCGA-LIHC、GSE14520、GSE25097及ICGC-LIRI-JP肝细胞癌转录组数据,结果显示YY1在肝癌组织中的表达显著高于癌旁组织,高表达YY1预示更短的总体生存;YY1表达与患者的肿瘤体积、肿瘤分期及肿瘤病理学分级正相关。免疫组化验证实验中证实肝癌组织YY1显著高于癌旁组织;体外细胞实验结果显示,敲降YY1表达后,肝癌细胞的增殖、迁移及侵袭能力显著降低,而过表达YY1后,肝癌细胞的增殖、迁移及侵袭能力则显著增加。基因集富集分析发现高表达YY1的患者中与肿瘤进展相关信号通路高度富集,共表达基因及蛋白质互作网络分析发现,YY1与FKBP3、RBBP7、H2AFV、H2AFZ、ACTL6A、PAXIP1、NCOA6、SUZ12等8个共表达基因存在高度可信的相互作用网络。结论YY1在肝细胞癌中高表达,与不良预后相关。发挥癌基因作用,可能与其促肝癌细胞增殖、迁移及侵袭能力有关;YY1在肝细胞癌中的表达能指示总体生存,可作为潜在的肝癌生物标志物及药物治疗靶点。     

不同肺转移潜能的大鼠肝癌细胞外泌体对巨噬细胞转录组的影响

目的 比较不同肺转移潜能的大鼠肝癌细胞来源外泌体对巨噬细胞转录组的影响.方法 通过转录组测序技术,比较经两株不同肺转移潜能的大鼠肝癌细胞(WB1和WN1)来源外泌体处理的巨噬细胞的转录组差异,筛选差异基因并使用KEGG分析、GO分析和蛋白互作网络分析,探索癌细胞来源外泌体影响巨噬细胞功能促进肺转移的潜在机制.结果 对比...