基于数据挖掘分析极光激酶A在食管癌中的表达及意义

目的:探讨极光激酶A(AURKA)在食管癌组织中的表达与功能,并分析其对患者生存预后的影响。方法:基于GEPIA及Oncomine数据库检索AURKA在食管癌组织与正常组织中的表达差异;通过STRING网络在线数据库构建有关AURKA的蛋白相互作用(PPI)网络,并将数据导入Cytoscape软件后采用Cyto Hubba分析插件筛选出核心基因;在GEPIA数据库中,基于TCGA和GTEx数据集分析AURKA与核心基因表达的相关性;采用DAVID网络分析工具对核心基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析;基于R2基因分析可视化平台分析AURKA的表达与食管癌患者生存预后的关系。结果:GEPIA、Oncomine数据库分析显示,AURKA在食管癌组织中的表达较正常组织明显升高(P<0.05),但与患者肿瘤分期无关(P>0.05);AURKA与CDC20 (r=0.78)、PLK1 (r=0.83)等核心基因的表达呈显著正相关,其生物学功能主要富集于细胞分化、DNA损伤检测点、细胞增殖、负性调控细胞凋亡等;参与细胞周期调控、细胞衰老、P53以及Fox O等信号通路的调节;AURKA高表达组与低表达组患者相比预后较差,差异具有统计学意义(P<0.05),且核心基因CCNB1、BUB1B、NEK2高表达组患者的生存率也显著低于低表达组(P均<0.05)。结论:AURKA在食管癌组织中表达升高,且高表达组患者预后不良;AURKA与CCNB1、NEK2等核心基因共同参与了肿瘤发生相关的功能与通路,AURKA有望成为食管癌患者早期诊断、治疗及判断预后的候选分子靶标。     

血清和胸腔积液HE4、CD147、SCC-Ag、CEA在诊断非小细胞肺癌合并恶性胸腔积液中的价值

目的探讨血清和胸腔积液中人附睾蛋白4(HE4)、细胞外基质金属蛋白酶诱导因子(CD147)、鳞状上皮细胞癌抗原(SCC-Ag)、癌胚抗原(CEA)对应的指标联合, 在诊断非小细胞肺癌(NSCLC)合并恶性胸腔积液方面的价值。方法本研究为病例对照研究。采用非随机抽样的方法纳入2019年6月至2022年6月湖北民族大学附属民大医院的150例NSCLC合并恶性胸腔积液患者(恶性组)和50例良性胸腔积液患者(良性组)。比较2组血清和胸腔积液中HE4、CD147、SCC-Ag、CEA水平。采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清和胸腔积液中HE4、CD147、SCC-Ag、CEA对NSCLC患者合并恶性胸腔积液的诊断价值。采用Kappa检验比较病理诊断与血清和胸腔积液中HE4、CD147、SCC-Ag、CEA联合诊断NSCLC合并恶性胸腔积液的一致性, 以任一指标阳性为联合诊断阳性。结果恶性组男80例, 女70例, 年龄(69.24±8.67)岁, 吸烟70例。良性组男34例, 女16例, 年龄(68.54±8.34)岁, 吸烟18例。2组患者性别、年龄、吸烟情况比较差异均无统计学意义(均P&g...     

数据挖掘分析SLC7A11在食管癌中的表达及通过P53/ROS通路调节细胞铁死亡的意义

目的： 分析溶质运载蛋白7家族成员11（SLC7A11）在食管癌（ESCA）组织中的表达与功能，及对患者生存预后的影响。方法： 基于Oncomine及GEPIA数据库，检索SLC7A11在ESCA组织与正常食管组织中的表达差异；采用GeneMANIA数据库构建有关SLC7A11的蛋白互作网络（PPI），并进行功能注释分析其共同富集的生物学功能；通过KEGG Pathway数据库分析其参与的信号通路；利用R2基因分析可视化平台，绘制Kaplan-Meier函数曲线，分析SLC7A11的表达对患者生存预后的影响。结果： Oncomine及GEPIA数据分析显示，SLC7A11在ESCA组织中mRNA的表达水平较正常组织显著升高（P < 0.05），且高表达组患者生存预后较差，差异具有统计学意义（P < 0.05）；SLC7A11与SLC3A2、BSG、ASNS、PHGDH、TERT、CD44等20种蛋白相互作用，主要富集于氨基酸转运、修饰氨基酸的跨膜转运活性、白细胞游走、多肽抗原绑定等生物学功能；SLC7A11通过P53/ROS信号的活化介导细胞铁死亡信号通路（hsa04216）的调节。结论： SLC7A11在ESCA组织中表达升高，且高表达组患者预后不良；SLC7A11可能通过P53、ROS代谢通路参与细胞铁死亡，有望成为ESCA患者早期诊断、治疗及判断预后的分子靶标。     

基于数据挖掘分析极光激酶A在食管癌中的表达及意义

目的：探讨极光激酶A（AURKA）在食管癌组织中的表达与功能，并分析其对患者生存预后的影响。方法：基于GEPIA及Oncomine数据库检索AURKA在食管癌组织与正常组织中的表达差异；通过STRING网络在线数据库构建有关AURKA的蛋白相互作用（PPI）网络，并将数据导入Cytoscape软件后采用CytoHubba分析插件筛选出核心基因；在GEPIA数据库中，基于TCGA和GTEx数据集分析AURKA与核心基因表达的相关性；采用DAVID网络分析工具对核心基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析；基于R2基因分析可视化平台分析AURKA的表达与食管癌患者生存预后的关系。结果：GEPIA、Oncomine数据库分析显示，AURKA在食管癌组织中的表达较正常组织明显升高（P < 0.05），但与患者肿瘤分期无关（P > 0.05）；AURKA与CDC20（r=0.78）、PLK1（r=0.83）等核心基因的表达呈显著正相关，其生物学功能主要富集于细胞分化、DNA损伤检测点、细胞增殖、负性调控细胞凋亡等；参与细胞周期调控、细胞衰老、P53以及FoxO等信号通路的调节；AURKA高表达组与低表达组患者相比预后较差，差异具有统计学意义（P < 0.05），且核心基因CCNB1、BUB1B、NEK2高表达组患者的生存率也显著低于低表达组（P均 < 0.05）。结论：AURKA在食管癌组织中表达升高，且高表达组患者预后不良；AURKA与CCNB1、NEK2等核心基因共同参与了肿瘤发生相关的功能与通路，AURKA有望成为食管癌患者早期诊断、治疗及判断预后的候选分子靶标。     

数据挖掘分析SLC7A11在食管癌中的表达及通过P53/ROS通路调节细胞铁死亡的意义

目的： 分析溶质运载蛋白7家族成员11（SLC7A11）在食管癌（ESCA）组织中的表达与功能,及对患者生存预后的影响。方法： 基于Oncomine及GEPIA数据库,检索SLC7A11在ESCA组织与正常食管组织中的表达差异;采用GeneMANIA数据库构建有关SLC7A11的蛋白互作网络（PPI）,并进行功能注释分析其共同富集的生物学功能;通过KEGG Pathway数据库分析其参与的信号通路;利用R2基因分析可视化平台,绘制Kaplan-Meier函数曲线,分析SLC7A11的表达对患者生存预后的影响。结果： Oncomine及GEPIA数据分析显示,SLC7A11在ESCA组织中mRNA的表达水平较正常组织显著升高（P < 0.05）,且高表达组患者生存预后较差,差异具有统计学意义（P < 0.05）;SLC7A11与SLC3A2、BSG、ASNS、PHGDH、TERT、CD44等20种蛋白相互作用,主要富集于氨基酸转运、修饰氨基酸的跨膜转运活性、白细胞游走、多肽抗原绑定等生物学功能;SLC7A11通过P53/ROS信号的活化介导细胞铁死亡信号通路（hsa04216）的调节。结论： SLC7A11在ESCA组织中表达升高,且高表达组患者预后不良;SLC7A11可能通过P53、ROS代谢通路参与细胞铁死亡,有望成为ESCA患者早期诊断、治疗及判断预后的分子靶标。