应用于结核性胸膜炎分子生物学检测的胸腔积液核酸提取方法初步比较分析北大核心CSCD

目的筛选鉴定有助于结核性胸膜炎分子生物学检测的胸腔积液核酸提取方法。方法收集18例结核性胸膜炎患者胸腔积液样本,分别采用6种方法提取核酸,应用微滴数字PCR技术分析样本中结核分枝杆菌特异性核酸IS6110和IS1081数量,以此评估不同胸腔积液核酸提取方法的优劣。结果对于胸腔积液原液或胸腔积液离心上清,采用柱法和磁珠法提取的核酸样本中靶标数量无明显差别。对于胸腔积液离心沉渣,采用物理破碎法提取的核酸样本中IS6110和IS1081数量显著高于化学破碎法(IS6110,Z=-3.408,P=0.001;IS1081,Z=-3.297,P=0.001)。相比于小体积(0.7 mL)胸腔积液原液直接提取,大体积(4 mL)胸腔积液离心的上清和沉渣(物理破碎)中提取的核酸样本含有更多的靶标数量(分别IS6110,Z=-3.237,P=0.001,IS1081,Z=-2.667,P=0.008;IS6110,Z=-3.157,P=0.002,IS1081,Z=-2.250,P=0.024)。结论大体积胸腔积液离心上清游离核酸提取法和离心沉渣物理破碎核酸提取法能够富集更多的结核分枝杆菌核酸,是较好的用于结核性胸膜炎分子生物学检测的核酸制备方法。     

活动性结核病患者外周血单个核细胞中结核分枝杆菌抗原特异性多能CD4+和CD8+T淋巴细胞的特征研究

目的 研究活动性结核病患者外周血单个核细胞中结核分枝杆菌抗原特异性多能T淋巴细胞细胞因子的分泌特征.方法 利用γ干扰素释放试验和多色流式细胞术分析了13例活动性结核病患者、11例肺部感染性/肿瘤疾病患者以及14例健康对照者外周血中结核分枝杆菌抗原特异性(ESAT-6和CFP-10)CD4+Th1和CD8+Tc淋巴细胞表达细胞因子IFN-γ、TNF-α和IL-2的情况.结果 与肺部感染性/肿瘤疾病组和健康对照组相比:(1)活动性结核病组具有较低比例的分泌TNF-α+的CD4+Th1细胞、较高比例的分泌IFN-γ+和IFN-γ+TNF-α+IL-2+的CD4+Th1细胞;(2)活动性结核病组具有较高比例的分泌IFN-γ+TNF-α+IL-2+的CD8+Tc细胞.结论 实验结果提示活动性结核病患者中表达IFN-γ+TNF-α+IL-2+的多能CD4+Th1及CD8+Tc细胞,可能在区别活动性结核病与肺部感染性/肿瘤疾病方面具有一定的临床参考价值.     

结核病人外周血T辅助细胞含量分析

目的分析结核病患者Th细胞含量变化与结核分枝杆菌感染的关系。方法抽取肺结核患者、肺外结核患者、肺癌患者和健康人2ml肝素钠抗凝静脉血,按说明书进行胞内和膜表面分子染色,染色的细胞经流式细胞仪分析分泌IL-17、IFN-γ、IL-4阳性的T细胞和CTLA-4、PD-1阳性的T细胞。结果肺结核、肺外结核和肺癌组Th17细胞含量高于健康组、Th2细胞含量低于健康组、Th1细胞含量呈下降趋势,但与健康组比较差异无统计学意义。因此,肺结核、肺外结核组Th1细胞含量与Th17细胞含量比值及Th2细胞含量与Th17细胞含量比值低于健康组。肺外结核组CTLA-4阳性的CD3+T细胞(CTLA-4+CD3+T含量)含量高于肺结核组、肺癌组和健康组,肺结核和肺癌组PD-1阳性的CD4+T细胞(PD-1+CD4+T细胞)含量高于健康组。肺结核组,CTLA-4+CD3+T含量与Th1细胞含量呈负相关(r=-0.48,P=0.014);肺外结核组,PD-1+CD4+T细胞含量与Th17细胞含量呈正相关(r=0.68,P=0.015)。结论活动性结核病患者Th17细胞含量升高。     

结核分枝杆菌乙酰转移酶fadA3对宿主蛋白乙酰化修饰及其体内存活影响的研究

目的:探讨结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)乙酰转移酶fadA3对宿主蛋白乙酰化修饰、基因表达和MTB在体内存活的影响。方法:从首都医科大学附属北京胸科医院/北京市结核病胸部肿瘤研究所分子生物学实验室选取MTB标准株(H37Rv),利用CRISPR-cas系统辅助的非同源性末端接合技术(CRISPR-NHEJ)构建H37Rv-fadA3基因敲除株(ΔfadA3),利用微孔板法分别检测H37Rv和ΔfadA3在7H9液体培养基中的吸光度值(A值)和细菌活性,绘制生长曲线图和最低抑菌浓度表。运用免疫印迹和转录组学测序分析H37Rv和ΔfadA3感染巨噬细胞(巨噬细胞系THP-1分化得到)后蛋白质乙酰化修饰变化及基因表达的差异情况;采用菌落计数和苏木精-伊红染色法分析H37Rv和ΔfadA3在C57BL/6J小鼠肺组织和巨噬细胞中的存活及病理变化。结果:fadA3经敲除1116 bp片段后成功获得ΔfadA3敲除株。H37Rv和ΔfadA3在培养第3、6、9和12天的A₆₀₀值(分别为0.245±0.005和0.232±0.01...     

耐异烟肼和链霉素的结核分枝杆菌临床分离株与敏感株差异蛋白表达研究

目的 鉴定结核分枝杆菌对异烟肼和链霉素耐药相关的潜在蛋白。 方法 以药物敏感株（01105）和标准株H37Rv为对照,核素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)结合Nano液相色谱-串联质谱分析仪（LC-MS-MS）技术和生物信息学,鉴定并相对定量结核分枝杆菌对异烟肼与链霉素耐药的临床分离株02166菌体蛋白。 结果02166菌株分别与01105菌株和H37Rv菌株比较差异表达蛋白为153个和130个,02166菌株与01105菌株和H37Rv比较差异表达蛋白均为86个(共同差异表达蛋白)。差异表达蛋白理论相对分子质量和等电点分布广泛,相对分子质量从7.63~326.22,等电点从3.74~12.48,其主要参与中间代谢、呼吸作用和脂类代谢。共同差异表达蛋白：9个核糖体蛋白（Rv0056、Rv0651、Rv0652、Rv0701、Rv0719、Rv1630、Rv2785c、Rv2909c和Rv3458c）在02166菌株中表达下调;5个蛋白（Rv0234c、Rv2466c、Rv2626c、Rv2986c和Rv3118）在02166菌株中呈显著差异表达,其中琥珀酸半醛脱氢酶（Rv0234c）和假定未知蛋白（Rv2466c）在02166菌株中表达上调倍数>1.2,DNA结合蛋白HU同系物hupB（Rv2986c）、假定未知蛋白(Rv2626c和Rv3118)在02166菌株中表达下调倍数<0.5。 结论iTRAQ发现了耐异烟肼和链霉素的结核分枝杆菌临床分离株差异表达蛋白,为进一步探讨结核分枝杆菌异烟肼或链霉素耐药机制奠定了基础。     

WYE-354调控小鼠同种异体皮肤移植抗排斥反应中的mTOR信号传导通路

目的探讨mTOR激酶ATP竞争抑制剂WYE-354对小鼠同种异体皮肤移植抗排斥反应的作用及机制。方法以C57BL/6为受者,BALB/c为供者建立同种异体皮肤移植模型,C57BL/6小鼠行同种同体皮肤移植为自体移植组。移植-2d给药,共21d,阳性对照组为同种异体皮肤移植,雷帕霉素组口服给药0.2ml、剂量1mg/(kg.d),WYE-354药物组腹腔注射0.2ml:低剂量1mg/(kg.d)、中剂量1.5mg/(kg.d)、高剂量50mg/(kg.d)。术后3、7、11、21d时,应用免疫印记法留样检测每组脾细胞4E-BP1磷酸化水平,11d行皮肤移植物组织病理染色。结果阳性对照组皮肤移植物存活时间明显少于雷帕霉素组、WYE-354低、中、高剂量组,差异有统计学意义(P<0.01);雷帕霉素组皮肤移植物存活时间明显少于WYE-354中、高剂量组,差异有统计学意义(P<0.01)。雷帕霉素组及WYE-354低剂量组皮肤移植物局部淋巴细胞浸润较阳性对照组减少,WYE-354中、高剂量组皮肤移植物局部淋巴细胞浸润较阳性对照组、雷帕霉素组、WYE-354低剂量组均减少。雷帕霉素组、WYE-354低、中、高剂量组均可下调脾细胞中4E-BP1蛋白的磷酸化水平,以WYE-354中、高剂量组作用最为明显。结论 WYE-354可以抑制mTOR信号转导通路相关蛋白磷酸化水平的调控,并阻滞其细胞周期,减少淋巴细胞向皮肤移植物浸润、显著延长小鼠皮肤移植物存活时间。     

γ-干扰素诱导蛋白-10mRNA检测技术对结核病辅助诊断的价值

目的:评估以γ-干扰素诱导蛋白-10(interferon gamma-induced protein 10,IP-10)为靶标的检测技术(IP-10.TB)在结核病辅助诊断中的价值,并对比分析该检测技术与全血γ-干扰素释放试验(Quantiferon-TB Gold InTube, QFT-GIT)检测技术的一致性。方法:于2021年11月至2022年7月,在首都医科大学附属北京胸科医院连续性、前瞻性纳入疑似结核病患者作为研究对象,最终纳入158例。根据研究对象的临床表现、常规生化检测、结核病病原学检测、影像学检测和(或)病理学检测结果,将其分为确诊结核病组(88例)、临床诊断结核病组(29例)和非结核病组(41例)。所有研究对象同时行外周血IP-10.TB检测和QFT-GIT检测,采用受试者工作特征曲线分析两种检测技术的诊断价值,两种检测技术的一致性分析采用Kappa检验。结果:158例研究对象中,IP-10.TB检测不确定结果7例(4.4%),QFT-GIT检测不确定结果5例(3.2%),两者比较差异无统计学意义(χ²=0.346,P=0.556)。在146...     

宿主蛋白质乙酰化修饰在结核病发生发展中的作用

病原微生物诱导宿主蛋白质翻译后修饰与疾病的预防、发生和治疗密切相关。结核分枝杆菌作为胞内病原菌, 其诱导宿主蛋白质翻译后修饰是结核病发生发展和转归的重要因素之一。近年来, 研究发现结核分枝杆菌感染诱导宿主蛋白质乙酰化修饰在调控宿主抗结核免疫功能中发挥重要作用, 显著影响结核病的发生发展。本文通过对结合分枝杆菌调控宿主蛋白质乙酰化修饰的作用及机制研究进展进行综述, 为进一步探究靶向宿主蛋白质乙酰化修饰的结核病免疫治疗靶点和策略提供理论参考。     

结核分枝杆菌对CD4 +T细胞白细胞介素6受体3′非翻译区甲基化的作用及机制研究

目的:研究DNA甲基化在结核分枝杆菌（MTB）裂解物诱导CD4 +T细胞白细胞介素6受体（IL-6R）表达下调中的作用及机制。 方法:本研究属于前瞻性研究。收集并分选2019—2020年深圳市第三人民医院10名健康人（对照组）和10例结核病患者（TB组）外周血单个核细胞（PBMC）中CD4 ...