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目的通过古细菌水通道蛋白AqpM的分子动力学模拟,为其结构及功能研究奠定基础。方法将AqpM四聚体嵌入在二硬脂酰基磷脂酰乙醇胺(POPE)脂质双分子层,并加入水模型(TIP3P),使之模拟水通道蛋白与脂质和水分子在真实环境中的相互作用。结果模拟过程中RMSD值在最后2.35ns的变化较小,表明蛋白和脂质达到最终结构的平衡。结论成功进行了AqpM脂质平衡系统的分子动力学模拟,并对AqpM通道的结构作了进一步研究,这对了解水通道蛋白结构及其功能具有重要意义。 相似文献
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目的以核糖体第二核糖体内部转录间隔区(ITS2)作为分子标记,对粉尘螨、屋尘螨、腐食酪螨和热带无爪螨进行系统发育树分析。方法 PCR扩增种常见储藏物螨种的ITS2基因并测序,进行序列比对分析;从GenBank下载8条螨虫的ITS2序列,用MEGA 2.1软件构建分子系统树,进行系统进化分析。结果分析4种螨的ITS2序列长度为316~487bp,种内基因遗传距离为0.003 823~0.052 599,种间遗传距离为0.187 440~0.534 699。以长食酪螨(Tyrophagus longior)为外类群构建系统发育树,进行系统发育分析,屋尘螨与粉尘螨亲缘关系较近,腐食酪螨及热带无爪螨分别位于发育树的基部和中部,系统发育树结果与根据形态分类对应。结论依据ITS2基因片段序列及系统发育树可对常见螨种鉴定,ITS2基因片段可作为螨种鉴定的分子标记。 相似文献
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目的获得粉尘螨变应原第6组分(Der f 6)的编码基因并了解其序列多态性。方法根据GenBank(AF125187)公布的Der f 6的CDS区序列设计引物,使用PrimeSTAR?HS DNA进行PCR扩增,将目的基因片段与pMD19-T simple连接,进行序列测定和多态性分析。结果获得粉尘螨Der f 6编码基因,大小为839bp。对5个Der f 6克隆质粒测序并与参考序列GenBank No.AF 125187和GenBank No.EU085359比对,出现突变的cDNA序列合计36处,cDNA克隆中序列存在27处突变至少达到3个;推导的氨基酸序列有15处与上述27个位点一致。结论获得粉尘螨Der f 6编码基因并证明其序列具有多态性,为相关研究奠定了基础。 相似文献
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