贵州与中国大陆其它地区空肠弯曲菌MLST特征的比较分析

目的 了解贵州省鸡源空肠弯曲菌的分子流行特征,阐明各地菌株间的亲缘关系和进化特征。方法 在贵州省随机抽取7个大型养鸡场,共采集210份鸡的新鲜粪便样本,分离培养出38株空肠弯曲菌,采用多位点序列分型对分离株的序列型及克隆复合体进行构成和聚类分析,与PubMLST数据库中来自国内的分离株分子特征进行比较。结果 贵州省38株鸡源空肠弯曲菌分为23种ST型和8个克隆复合体,其中9种是目前中国大陆地区已有的ST型,2个等位基因和8种序列型为新发现的。ST型构成比前四位分别是ST - 45、ST - 161、ST - 354、ST - 4 324,与数据库中已有的6株贵州来源菌株相比,不存在共同的ST型。优势克隆复合体（CC - 45、CC - 354、CC - 52）与数据库中鸡源分离株的前三位克隆复合体没有重叠。菌株遗传进化树显示,本研究中属于优势克隆复合体的18株菌与国内部分人源、猪源、野生鸟源、鹅源分离株有较近的遗传距离。结论 贵州省鸡源空肠弯曲菌具有高度遗传多样性,在一定程度上表现出地域流行特征。序列型与国内华东地区的分离株有较高的交叉性,部分分离株与国内人、野生鸟、鹅等来源分离株遗传距离近,应加强对不同地区、不同宿主来源空肠弯曲菌的动态监测。     

贵州省即食米面制品食源性致病菌污染及病原特征分析

目的 了解贵州省即食米面制品中食源性致病菌污染状况和病原学特征,为细菌性食源性疾病的防治提供参考依据。方法 2014—2019年在贵州省的88个县（市、区）采集即食米面制品1128份,依据食品安全国家标准（GB4789）进行五种食源性致病菌的检测;采用荧光定量PCR法和ELISA法分别检测金黄色葡萄球菌肠毒素基因及蛋白,普通PCR法检测蜡样芽胞杆菌毒力基因。结果 1128份即食米面制品有130份样品检出食源性致病菌,检出率为11.52%,分别是蜡样芽胞杆菌7.71%,金黄色葡萄球菌3.10%,沙门氏菌0.27%,单核细胞增生李斯特氏菌0.44%,未检出致泻大肠埃希氏菌。分离的35株金黄色葡萄球菌有65.71%携带肠毒素基因,54.29%呈肠毒素蛋白阳性。87株蜡样芽胞杆菌都至少携带两种以上毒力基因,同时携带hblACD及nheABC的有29.88%。结论 贵州省即食米面制品存在多种食源性致病菌污染,蜡样芽胞杆菌和金黄色葡萄球菌污染率较高且携带多种毒力基因,存在较大食源性疾病风险,监管部门应加强对即食米面制品的加工制作管理。     

贵州省2013—2016年B型流感病毒流行特征分析

目的了解贵州省B型流感病毒的流行特征和规律,为其预防与控制提供依据。方法采用描述性方法对贵州省2013年4月1日—2016年3月31日B型流感病毒RT PCR检测结果进行统计。结果贵州省2013—2016年3个监测年度B型流感病毒RT PCR检测阳性1 904份,其中By系1 215份、Bv系642份,2013年4月—2014年3月、2014年4月—2015年3月2个监测年度B型流感的优势流行株都是By系,而2015年4月—2016年3月是Bv和By系共同流行,流行季节主要在冬春季;B型流感病毒男性检出所占比率较高,占56.83%;15岁以下低年龄组人群B型流感病毒检出数最高（70.80%）,而Bv系在0~岁年龄组最高（42.37%）,By系在5~岁年龄组最高（35.56%）;混合感染病原组合构成主要以By+Bv为主,占67.65%,与B型有关的混合感染数占95.59%。结论贵州省B型流感病毒存在By和Bv两种系别的流行,流行季节为冬春季,男性感染病例多于女性,发病以15岁以下人群为主,加强低年龄群体流感疫苗的接种和监测具有重要意义。     

贵州省百日咳频发地区605份健康人血清百日咳抗体水平检测

目的了解贵州省百日咳病例频发地区健康人群抗体水平,评估真实发病水平和疾病风险,为其预防和控制提供依据。方法 2016年12月在贵州省钟山区和威宁县2个百日咳频发地区,采用分层抽样和随机抽样的方法采集健康人群的静脉血清3~5ml;通过酶联免疫吸附实验(ELISA)定量测定血清中百日咳鲍特菌总IgG含量;采用Microsoft Excel软件整理测定结果,通过SPSS 18.0,选用方差分析和卡方检验等统计方法进行数据分析。结果共检测钟山区和威宁县健康人群血清605份,百日咳鲍特菌总IgG阳性率为10.41%,其浓度几何均值为10.46IU/ml;男女性别间百日咳鲍特菌总IgG抗体阳性率(10.55%,10.00%)和抗体浓度(9.91IU/ml,10.95IU/ml)均无统计学差异(=0.049,P=0.893;F=2.957,P=0.355);4剂次无细胞百白破疫苗(DTa P)免疫人群与3剂次DTa P疫苗免疫人群间的百日咳鲍特菌总IgG浓度分别为2.96IU/ml、2.76IU/ml,二者间百日咳鲍特菌总IgG浓度差异无统计学意义(F=6.757,P=0.694);0-3岁人群百日咳鲍特菌总IgG浓度随接种时间推移而下降,末次接种疫苗后5个月内为3.61IU/ml,2-3年后降至2.19IU/ml(F=2.731,P=0.035);受百日咳感染影响,青少年和成人百日咳鲍特菌总IgG浓度有较明显的峰值,抗体水平随年龄增长呈波动性上升。结论贵州省百日咳频发的钟山区和威宁县健康人群血清中百日咳鲍特菌总IgG水平较低,可能存在接受疫苗免疫的人群仍然感染百日咳的现象,需进一步加强监测,优化免疫策略。     

2014-2016年贵州省百日咳报告病例流行病学特征分析北大核心

目的了解2014-2016年贵州省百日咳报告病例的流行病学特征,为制定贵州省百日咳预防控制策略提供依据。方法利用中国疾病预防控制信息系统收集2014-2016年贵州省百日咳报告病例数据,利用贵州省免疫规划信息管理系统和现场调查收集百日咳报告病例的无细胞百白破联合疫苗（DTa P）免疫史,采用描述流行病学方法分析数据。结果 2014-2016年贵州省报告百日咳病例136例（0.13/10万）,2014年、2015年和2016年分别报告32例（0.09/10万）、42例（0.12/10万）和62例（0.18/10万）。0岁婴儿报告发病率最高（6.18/10万）。7-8月发病数占33.09%。年均报告发病率最高的市（州）为六盘水（0.29/10万）、毕节（0.21/10万）和遵义（0.20/10万）。本省和外省报告病例分别占47.79%、52.21%。0剂、1剂、2剂、3剂、4剂DTa P免疫史的病例数分别占48.28%（56/116）、13.79%（16/116）、13.79%（16/116）、18.97%（22/116）、5.17%（6/116）。结论 2014-2016年贵州省百日咳报告发病率呈持续上升趋势;需提高百日咳病例临床诊断和监测报告能力,完善含百日咳成分疫苗免疫策略。     

贵州省百日咳监测点医务人员百日咳防治知识知晓情况的基线调查分析

目的了解贵州省百日咳监测点医务人员对百日咳防治知识的知晓情况。方法采用自行设计的调查问卷,在百日咳监测点专题项目培训前开展调查,调查结果使用Excel 2003进行统计分析。结果现场调查49人,发放问卷49份,收回有效问卷48份,对百日咳主要传染源、主要传播模式、接种疫苗免疫持久性和潜伏期的知晓率分别是95.83%、70.83%、79.17%和58.33%。对4种百日咳的主要临床表现(持续咳嗽2周及以上,阵发性、痉挛性咳嗽,咳嗽伴高调吸气尾音,没有其他明显诱因的咳嗽后呕吐)知晓3项及以下的占47.92%,知晓4项的占52.08%。对5项百日咳诊断依据(流行病学、临床表现、细菌培养、血常规检测和核酸检测)知晓4项及以下的占60.42%,知晓5项的占39.58%。未正确选择治疗百日咳的抗生素的占18.75%,不知晓预防药物的占47.92%。百日咳相关知识主要来源于教科书和行业标准的分别占79.17%和25.00%。95.83%的医务人员认为有必要规范开展百日咳监测。结论贵州省百日咳监测点医务人员对百日咳防治知识的知晓率不高,贵州省亟需制定百日咳监测方案并规范实施。     

贵州省鸡源弯曲菌的流行现状及抗生素敏感谱研究

目的 了解贵州省鸡源弯曲菌的流行现状和耐药特征,为兽医和人医临床上抗生素的合理使用提供参考。方法 随机从贵州省东、西、南、北、中5个片区中的养殖场和农贸市场采集359份新鲜粪便样本进行分离培养、生化及MALDI-TOF MS鉴定。采用琼脂稀释法检测分离株对7类11种不同抗生素的耐药性,通过PCR方法检测耐药基因的携带情况。结果 弯曲菌总体检出率为43.5%,包括68株(43.6%)空肠弯曲菌和88株(56.4%)结肠弯曲菌;对其中84株弯曲菌进行药敏实验和耐药基因检测,结果显示分离株对11种抗菌药物产生了38种耐药谱,空肠弯曲菌和结肠弯曲菌的优势谱型都为NAL-CIP-TET;81.0%的弯曲菌呈多重耐药,其中结肠弯曲菌的多重耐药率(91.7%)高于空肠弯曲菌(54.2%);红霉素、阿奇霉素、泰利霉素、克林霉素、庆大霉素和链霉素耐药株的耐药表型与耐药基因携带相关;交叉耐药显示,红霉素与阿奇霉素呈高度相关(|r|=0.79>0.7),庆大霉素与链霉素呈中度相关(|r|=0.46>0.4),萘啶酸与环丙沙星(|r|=0.36<0.4)、氯霉素与氟苯尼考呈弱相关(|r|=0.04<0.4)。结论 贵州省鸡源弯曲菌存在区域性流行特征和耐药差异,多重耐药现象严重,存在通过食物链传播给人的风险。     

2010 - 2016年度贵州省流感流行特征监测分析

了解贵州省2010 - 2016年流感流行特征,为流感防控提供科学依据。方法 采用流行病学描述性方法对2010年4月1日 - 2016年3月31日流感样病例(简称ILI)监测情况、病原学检测结果和流感病毒分离情况进行分析。结果 2010 - 2016年6个流感监测年度贵州省门急诊病例就诊总数在逐年增多,ILI比例平均为6.18%。0～15岁小年龄组ILI%明显高于其他年龄组人群,占91.20%。ILI病例共采集60 829份,检出阳性7 817份,阳性率平均为12.85%,流行株主要为季H3、新甲H1N1、Yamagata系和Victoria系;6个监测年度,优势流感病毒分别为A型流感、B型流感、季H3+新甲H1N1流感、新甲H1N1+Yamagata系流感、季H3流感、季H3+Victoria系+Yamagata系流感;共分离到1 652株流感病毒,季H3和By最多;0岁～年龄组分离到毒株670株,5岁～年龄组433株。结论 贵州省2010 - 2016年流感监测年度ILI比例较高,ILI病例以0～15岁小年龄群体为主;随年度优势流感呈单独流行或多种共同流行特点;各年龄组毒株分离情况与ILI年龄分布整体上一致,流感病毒的分离情况也能反映流感的流行情况。加强ILI病例病原学监测和小年龄人群疫情监测具有重要意义。     

肠杆菌及临近种属的多位点序列分析

目的 为建立适宜的分子分型方法,以弥补16S rDNA在肠杆菌种属聚类分析上的不足,为后续类似菌株鉴定提供参考。方法 以肠杆菌属内各个种的模式菌株为研究对象,选择16S rDNA及rpoB、infB、gyrB和atpD基因序列,采用CLUSTALX软件和BioEdit软件进行序列比对和拼接;16S rDNA的相似性通过EzBioCloud数据库在线比对,拼接后的序列经MegAlign软件分析相似性;采用MEGA 7.0软件对序列多态性及系统发育关系进行分析。结果 肠杆菌属部分种间的16S rDNA序列高度相似(>99%),且与Lelliottia、Klebsiella及Kosakonia等属的部分种也有98%以上的相似性,其系统发育树的聚类分析显示属内成员并没有完全聚于一簇;16S rDNA序列的变异位点占比为6.44%(74/1149),rpoB、infB、gyrB和atpD基因串联后的变异位点占比为14.44%(380/2630)。结论 在16S rDNA高度同源的部分种属间,多位点序列分析较清晰地将肠杆菌属与其临近种属区分开,更能真实、准确地反映其生物分类学地位。     

贵州省2014-2017年H7N9禽流感病毒HA和NA基因特征分析

目的 分析2014－2017年贵州省H7N9禽流感病毒HA和NA基因的分子特征和感染风险。方法 对2014－2017年贵州省获取的18例确诊人感染H7N9病例和6份环境样本分离的H7N9病毒株的HA和NA基因进行扩增,运用生物信息学软件解析其变异和遗传进化。结果 2014－2015年贵州省2株毒株与WHO推荐的A/Shanghai/2/2013和A/Anhui/1/2013疫苗株HA和NA基因的同源性最高,分别为98.8%～99.2%和99.2%;2016年2株和2017年14株与A/Hunan/02650/2016疫苗株同源性最高,分别为98.2%～99.3%和97.6%～98.8%;2017年其余6株与A/Guangdong/17SF003/2016疫苗株同源性最高,为99.1%～99.4%和98.9%～99.3%。所有毒株均属于长江三角洲分支,但主要聚集为3个次分支。2017年贵州省西部有6株毒株（含2例人感染病例毒株）裂解位点存在插入突变为PEVPKRKRTAR↓GLF,具备高致病性禽流感病毒的分子特征;受体结合关键位点存在A134V、G186V和Q226L突变,NA蛋白颈区“QISNT”均缺失,毒株A/Guizhou-Danzhai/18980/2017发生耐药突变R294K,9株毒株NA蛋白糖基化位点发生NCS42NCT突变。结论 2014－2017年贵州省H7N9禽流感病毒HA和NA基因存在遗传差异,关键位点的变异增强了病毒对人体的易感性和毒力,部分毒株发生耐药突变,其感染与致病风险增加。