基于生态位模型的人感染H7N9禽流感病毒潜在风险区预测分析

目的利用Maxent生态位模型研究H7N9传染病与环境因素的关系,并在此基础上预测禽流感疫情的潜在风险区域。方法共选择254例江苏省范围内经过临床确诊的H7N9病例作为样本,构建生态位模型,利用ROC曲线下面积(AUC)来验证构建的生态位模型的有效性;同时,利用变量刀切法(Jackknife)来评价各环境变量对H7N9暴发的贡献;在此基础上,利用构建的生态位模型来预测江苏省12月份H7N9传染病暴发的潜在风险区。结果在江苏省境内,温度、日照强度、降水量和NDVI是影响H7N9禽流感疫情暴发的最主要的环境因素;通过分析12月份的潜在风险区预测图可以发现,江苏省苏南地区,尤其是苏州、无锡、常州3市是H7N9疫情暴发的高风险区。结论当江苏省境内出现持续的低温、日照时间短、气温潮湿的天气时,应密切关注禽流感疫情暴发的可能性。     

流感口服疫苗研究进展

流感疫苗接种始于20世纪40年代,在人群中长期和广泛的接种数据表明流感疫苗接种是防控流感最有效的手段.传统疫苗的存在形式包含全病毒灭活疫苗、裂解疫苗和亚单位疫苗.它们存在的局限性主要包括:(1)依赖于鸡胚生产,耗时较长;(2)不良反应较大;(3)匹配性依赖:若疫苗株与流行株不相匹配,会造成免疫逃脱,严重影响人群免疫效果;(4)监测干扰:机体会产生针对于病毒内部蛋白(如NP)的特异性抗体,所以全病毒疫苗的使用会干扰临床监测和检疫及流行病学调查.     

江苏省2013年甲型H1N1(09pdm)流感病毒血凝素和神经氨酸酶分子特征分析

目的:分析江苏省2013年甲型H1N1(09pdm)流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)变异情况,分析其遗传进化特征?方法:按照流感样病例定义,收集江苏省各哨点医院流感样病例标本,阳性样本经病毒分离培养及亚型鉴定?选取2013年不同时间段?不同地区具有代表性的14株甲型H1N1(09pdm)阳性毒株,利用特异性引物扩增HA?NA基因,测序并分析其遗传进化特征?结果:14株分离毒株与疫苗株A/California/07/2009(H1N1)的HA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为97.6%~98.4%和96.5%~98.0%?NA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4%~98.9%和97.0%~98.5%?遗传进化分析表明,14株分离株HA和NA基因分属于不同的进化谱系?分子特征表现为HA氨基酸序列出现D114N?K300E?E516K的变异,NA分子特征表现为N44S位点变异?从2013年左右开始甲型H1N1(09pdm)流感基因多样性增加;通过FEL模型得到一个正向压力选择HA氨基酸位点310,一个正向压力选择NA氨基酸位点4,通过REL模型得到9个正向压力选择HA氨基酸位点179?180?239?301?303?310?311?312?313(含位点310),5个正向压力选择NA氨基酸位点4?23?52?287?374(含位点4)?HA蛋白具有9个潜在糖基化位点,7个位于HA1上,2个位于HA2上;NA蛋白共有9个潜在糖基化位点?14株分离毒株在NA蛋白酶活性中心及周围辅助位点上均未发现变异?结论:2013年江苏省甲型H1N1(09pdm)流感HA?NA基因变异加快,遗传多样性增加,未来的遗传进化值得进一步关注?     

2013年3月江苏省禽流感职业暴露人群H5N1抗体水平及影响因素分析

目的:调查H7N9流行初始江苏省职业暴露人群H5N1禽流感抗体水平及其影响因素?方法:分别使用香港株?广东株与安徽株抗原,用血清凝集抑制法(hemagglutination inhibition,HI)测定血清样本抗体滴度,计算几何平均滴度(geometric mean titer,GMT),统计分析影响抗体水平的因素?结果:检测职业暴露人群血清标本416份,性别与抗原株对职业暴露人群抗体滴度有显著影响?结论:江苏省职业暴露人群H5N1禽流感抗体滴度普遍较低?男性抗体滴度低于女性,广东株抗原与禽流感病毒现有流行株较为接近?     

慢病毒介导的H7N9禽流感病毒血凝素基因快速真核表达系统的建立

目的利用慢病毒载体构建新型H7N9禽流感病毒血凝素(HA)基因的快速真核表达体系,在人胚肾细胞(HEK293T)中表达并进行功能鉴定。方法提取H7N9禽流感病毒基因组RNA,采用反转录PCR技术扩增HA读码框全长基因,将HA基因连接pMD18-T载体构建pMD18-T-HA重组载体。设计含Kozak序列的引物从pMD18-T-HA质粒中扩增出平末端HA基因,采用Topo克隆构建表达载体pLenti-HA-V5。将表达载体转染HEK293T细胞,通过间接免疫荧光法(IFA)和Western blot法鉴定HA蛋白的表达,通过血凝实验鉴定重组蛋白的生物学活性。结果经反转录PCR获得1 683 bp的HA全长基因,完成真核表达载体的构建并表达出相对分子质量(Mr)为70 000的重组蛋白。IFA和Western blot法结果显示该蛋白与阳性血清具有良好的免疫反应,同时血凝实验证实其具有血凝活性。结论成功利用慢病毒载体建立了HA蛋白的快速真核表达系统,为研制H7N9病毒亚单位疫苗、中和表位研究、假病毒包装奠定基础。     

江苏省2019—2022年乙型流感病毒Victoria系HA基因特征分析

目的分析江苏省2019—2022年乙型流感病毒Victoria系流行特征, 了解其基因变异情况, 监测江苏省流感活动水平和流行趋势。方法通过"中国流感监测信息系统"收集的江苏省2019—2022年流感样病例监测数据, 选取16株乙型流感病毒Victoria系毒株进行全基因组测序, 利用MEGA 7软件构建进化树并进行HA基因序列特征分析。结果江苏省2019—2022年监测到的流感病毒中乙型流感病毒Victoria系占绝对优势。16株标本株中2019—2020年度的毒株在V1A.3早期分支, 而2021—2022年度的毒株则聚类在3a.2亚型分支。与疫苗株相比, 2019—2020及2020—2021年度的毒株发生了1个氨基酸位点的改变并增加了1个糖基化位点, 而2021—2022年度的毒株则存在多个位点变异, 其中H122Q、A127T、R133G、P144L、N150K、S194D及K200R位于抗原决定簇上。结论江苏省乙型流感病毒Victoria系在多处基因位点发生了变异, 提示对该亚型变异的持续监测至关重要, 可为疫苗的更新提供重要依据。     

江苏省2010-2014年流感流行特征分析

目的 分析江苏省2010-2014年间流感样病例的流行病学特征,揭示流感流行特点并制定防控策略。方法 依据《全国流行性感冒（甲型H1N1流感）监测工作方案》,采集流感哨点医院流感样病例（influenza-like illness,ILI）就诊数,对病例咽拭子进行流感病毒核酸检测和病毒分离,结果录入国家流感网络监测系统,利用Excel 2007和PASW 18.0对数据进行统计分析。结果 2010-2014年间共报告ILI病例123 330例,分离14 238株流感病毒,分离阳性率为11.54%。职业分布以托幼儿童及散居儿童为主。年龄分布以0～4岁组所占比例最大。结论 江苏省流感每年有两个高峰期,分别是1～3月和7～10月。2010-2012年,B型和季节性H3N2是主要流行亚型。2013-2014年,甲型H1N1和季节性H3N2成为主要流行株亚型。     

江苏省2009-2012年流感监测结果分析

目的掌握江苏省2009-2012年流感的流行特征,为今后的流感防制工作提供科学依据。方法对江苏省2009-2012年流感样病例（influenza-like illness,ILI）报告数据、病原学监测数据及流感/ILI暴发疫情报告情况进行分析。结果江苏省流感高发人群为14岁以下婴幼儿及儿童,2009-2012年每年病例人数分别占各年ILI数的71.64%、81.39%、83.70%和84.03%;流感全年出现冬季12月份和夏季8月份两个小流行高峰,近3年,发病水平呈下降趋势（Z=-247.91,P<0.001）;2009-2012年分离到流感阳性毒株数分别为1 615株、806株、555株和993株,毒株类型以B型和A（H3N2）型交替出现为主,偶尔伴有A（H1N1）等其他毒株散发;2009-2012年,江苏省共报告流感/ILI暴发疫情147起,其中84起发生在中小学校及托幼机构,占总疫情数的57.14%。结论2009年后江苏省虽然没有发生流感大流行,但流感监测工作仍然不能放松,特别是需要警惕新型流感毒株的出现,同时加强学校等聚集性场所暴发疫情监测。     

2014-2018年江苏省禽类外环境禽流感病毒监测结果分析

目的 对2014-2018年江苏省涉禽外环境标本禽流感病毒检测结果进行分析,了解禽流感病毒时空流行性特征,为江苏省禽流感防控工作提供依据.方法 选取2014-2018年江苏省13个市的5类场所,6类禽类市场外环境标本,采用荧光定量PCR方法对标本进行A型、H5亚型、H7亚型、H9亚型流感病毒检测,采用描述性流行病学方法...     

2020—2022年江苏省新型冠状病毒感染疫情期间流感的流行特征分析

通过分析2020—2022年江苏省新型冠状病毒感染疫情期间流感的流行特征发现, 2020—2022年江苏省共采集90 721份流感样病例样本, 其中核酸阳性样本6 732份, 3年平均阳性检出率为7.4%;年度阳性检出率呈现"U"型分布, 各年阳性检出率分别为4.4%、3.2%、14.7%, 差异具有统计学意义(χ²=12 126.00, P<0.001)。2020—2022年流感的季节性高峰时期, 病毒在人群中尚未充分流行时出现季节高峰的2次流感活动强度的大幅降低:第一次出现在2020年1—2月, 流感核酸阳性检出率从第3周的54.4%(317/583)降至第8周的2.1%(12/584), 差异有统计学意义(χ2=394.49,P<0.001);第二次出现在2022年的12月, 流感核酸阳性检出率从第49周的14.9%(90/605)降至第52周的1.9%(11/572), 差异有统计学意义(χ2=62.88,P<0.001)。2020—2022年江苏省流感疫情具有明显的季节性特征, 各月份流感病毒阳性病例分布差异具有统计学意义(χ2=858...