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1.
乙型流行性感冒病毒的基因快速检测 总被引:1,自引:2,他引:1
〔目的〕建立乙型流行性感冒病毒的核酸快速诊断技术。〔方法〕采用RT -PCR方法对乙型流感病毒的HA基因进行检测 ,我们对乙型流感病毒的HA基因保守区域设计相关引物 ,进行扩增 ,并作了特异性与灵敏度比较。〔结果〕该引物只能扩增乙型流感病毒的特异性片段 ,而对其它型别的流感病毒以及麻疹、风疹、腮腺炎病毒无交叉反应。检测的灵敏度一次PCR可达 1TCID50 ,二次PCR反应可达 0 .1TCID50 。〔结论〕采用该方法从临床患者含漱液标本中的检出率 ,比采用MDCK细胞分离的阳性率更高 ,可达到迅速、正确地诊断乙型流感的实用目的。 相似文献
2.
TaqMan荧光定量RT-PCR快速检测登革1、2型病毒 总被引:1,自引:0,他引:1
目的 建立特异、灵敏、快速的荧光定量RT—PCR方法用于检测登革1、2型病毒核酸,并初步应用于登革热的临床标本检测。方法 根据GenBank登录的登革热毒株序列。应用生物学软件进行序列比对,分别在登革病毒1型的NS5基因和2型的C基因的保守区设计特异性引物和TaqMan探针。对荧光定量RT—PCR反应条件进行优化,验证该方法的特异性、灵敏度和稳定性。同时对疑似登革热病例血清标本进行检测。结果 该方法对登革1、2型病毒的检测有高度的特异性,与登革病毒的4个血清型之间以及流行性乙型脑炎病毒、肾综合征出血热病毒等均无交叉反应,检测的灵敏度均达0.1TCID50,可从疑似登革热病例血清标本中直接检测登革病毒核酸,从病毒核酸提取至完成检测仅需3h左右。结论 本研究建立的TaqMan荧光定量RT—PCR是一种快速检测登革1、2型病毒特异、敏感的方法,适用于临床早期诊断。 相似文献
3.
浙江省局部地区2002~2003年流行的无菌性脑膜脑炎的病原学检测与分析 总被引:9,自引:0,他引:9
浙江省局部地区 2 0 0 2~ 2 0 0 3年多次出现无菌性脑膜脑炎的流行。为对疫情进行病原学检测与分析 ,采集了临床标本 ,采用HEp 2、RD、Vero等细胞分离病毒 ,并用肠道病毒通用引物进行特异性逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)扩增。结果显示 :5 1份脑脊液标本中分离出埃可病毒 30型 (ECHO3 0 ) 5株 ,柯萨奇病毒B组 5型 (Coxsack ievirusB5,Cox B5) 1株 ;6 8份粪便标本中分离出ECHO3 0 34株 ,Cox B51株。RT PCR的结果与上述病毒分离结果相一致。此外 ,对采集的 1 5例患者的急性期、恢复期双份血清测定了特异性中和抗体 ,其中 1 3例患者抗体呈≥ 4倍增长。证实引起浙江省局部地区 2 0 0 2~ 2 0 0 3年无菌性脑膜脑炎的主要病原为ECHO3 0 。 相似文献
4.
5.
6.
浙江省乙型流感病毒HA1基因分析 总被引:4,自引:0,他引:4
目的:了解浙江省近几年乙型流感病毒的基因变异情况和WHO推荐流感疫苗株对浙江省人体的保护情况。方法:采集浙江省类流感样本进行流感病毒的分离和鉴定,并对分离到的乙型流感病毒进行核酸的提取,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒基因后进行病毒血凝素HA1基因核苷酸序列测定,用DNAMAN和BioEdit生物软件对测序结果进行分析处理,并与WHO推荐疫苗株基因进行比对。结果:分离到Yamagata系和Victoria系两个进化系的乙型流感病毒,两系毒株均未发现核苷酸的丢失和插入,糖基化位点没有太大改变。毒株之间核苷酸的同源性为95.25%,氨基酸的同源性为95.28%。Yamagata系毒株HA1区域核苷酸序列长度为1038 bp,推导的氨基酸序列长度为346个,氨基酸变异替换数在6-8之间;Victoria系毒株HA1区域的核苷酸序列长度为1041 bp,推导的氨基酸序列长度为347个,氨基酸变异替换数在2-8之间,相比Yamagata系毒株在163位上都多1个天冬酰胺(N)。基因进化树上可见明显的Yamagata系和Victoria系两个分支。结论:浙江省人群交替流行着Yamagata系和Victoria系两个抗原性不同的进化系的乙型流感病毒,病毒的基因发生了变异,抗原已发生漂移。2001、2006两年WHO推荐乙型流感疫苗株与我省当年流行株为不同谱系毒株,预防保护效果不够理想,其余年份为同一谱系毒株,预防保护效果较好。 相似文献
7.
浙江省近几年甲3亚型流行性感冒病毒神经氨酸酶基因分析 总被引:1,自引:0,他引:1
目的通过浙江省1998~2005年甲3亚型流行性感冒(流感)病毒的神经氨酸酶(NA)基因的序列比较,阐明近几年NA基因的变异与流感流行的关系。方法对浙江省1998~2005年流感流行期间分离的甲3亚型流感代表性毒株,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒NA基因,进行核苷酸序列测定,并用Bio-Edit软件作分析处理。结果浙江省近几年流感流行期间分离到甲3亚型流感病毒代表株13株,其NA基因核苷酸长度均为1 338bp,由此推导的氨基酸数为446个。1998~2005年甲3亚型流感病毒在NA基因区发生可遗传的氨基酸变异达22个,其中1998~1999年、1999~2002年变异最大,均达到9个氨基酸的差异;2003年后病毒的变异趋向平稳,这与NA基因系统进化树的结果相一致。此外,近几年来世界卫生组织推荐的甲3亚型流感疫苗株与当年的流感流行株之间存在一定的差异,而在2003年后的甲3亚型流感疫苗株与当年的流感流行株之间的符合程度较好。结论近年来浙江省甲3亚型流感病毒的NA区域与血凝素区域相似,均发生了较大的抗原性漂移,提示1999~2005年发生的2次流感流行是由于当年的甲3亚型流感分离株变异影响到病毒的抗原性所导致的。 相似文献
8.
目的 建立适用甲3型流行性感冒(流感)病毒核酸检测的环介导逆转录等温扩增(RT-LAMP)方法,为基层实验室流感快速诊断服务.方法 对甲3型流感病毒设计两对环介导特异性引物与一个环引物,采用环介导RT-LAMP技术对甲3型流感病毒核酸进行等温扩增,并对反应体系进行优化.结果 采用RT-LAMP技术检测甲3型流感病毒核酸,敏感度可达0.01TCID50/反应,与荧光定量逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)的敏感度相一致,且对H1和H5亚型流感病毒、乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒、麻疹病毒、风疹病毒、流行性腮腺炎病毒、副流感病毒与腺病毒无交叉反应,具有良好的特异性.采用该方法检测58份临床样本,病毒分离的阳性率为37.9%,而荧光定量RT-PCR与RT-LAMP的阳性率分别为53.45%和51.72%,敏感度明显高于通常的细胞病毒分离.结论 甲3型流感病毒环介导RT-LAMP检测方法,不仅快速特异、敏感性强,而且简便价廉,适于基层实验室使用. 相似文献
9.
温州市瓯海区健康人群免疫针对性疾病免疫水平监测分析 总被引:2,自引:0,他引:2
目的了解温州市瓯海区常住和流动人群免疫针对性疾病免疫水平,评价免疫规划工作的成效,为制定免疫策略提供依据。方法采取分层整群随机抽样法,在3个调查点的常住和流动人群中随机调查〈1岁、1~2岁、3~4岁、5~6岁、7~14岁、15~19岁、≥20岁7个年龄组各15~20人,共719人。结果抗-HBs和HBsAg阳性率分别为68.71%、3.20%。麻疹H1抗体阳性率为87.90%,几何平均滴度(GMT)为1:9.007。白喉抗毒素阳性率为61.75%,几何平均浓度(GMC)为0.0627IU/ml。破伤风抗毒素阳性率为67.45%,GMC为0.7611IU/ml。百日咳凝集抗体保护率30.60%,GMT为1:67.04。乙脑IgG抗体阳性率为57.58%。甲肝IgG抗体阳性率为30.60%。结论麻疹抗体人群中和乙肝抗体在小年龄组人群中达到一定水平,已形成有效的免疫屏障。流动人群抗体水平普遍比常住人群低。另外白喉、百日咳、破伤风、乙脑、甲肝等人群抗体水平比较低,存在疾病流行的潜在危险。 相似文献
10.
4种核酸提取方法在流行性感冒病毒核酸检测中的比较 总被引:1,自引:0,他引:1
目的:比较常见的4种核酸抽提方法,比较其对流行性感冒(流感)病毒检测的敏感性差异,为实验室应用和结果的评价提供依据。方法:对已确定效价的甲1型流感病毒,作10^-2~10^-5系列稀释,选用Roche公司Hish Pure Viral RNA Kit、QIAGEN公司的Rneasy mini Kit、国产Z生物公司RNA提取试剂盒和Invitrogen公司Trizol试剂等4种核酸提取方法提取上述标本核酸模板,采用罗氏公司的RT-PCR试剂盒,用实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)对其进行评价。结果:在对不同病毒拷贝数流感病毒的检测中,4种核酸提取方法以Roche公司High Pure Viral RNA Kit提取效率最高,以此提取效率作为100%,则QIAGEN Rneasy mini Kit、Invitrogen Trizol和国产Z生物公司RNA提取试剂盒的平均提取效率依次为89.71%、75.30%、68.00%。经方差分析及t检验,4种方法之间存在显著性差异(P均〈0.05)。对临床标本的检测,也获得相似结果。结论:各试剂之间提取核酸的效率存在差异,应该选择性价比较好的方法进行临床标本的实验室RNA提取。 相似文献