珠海市不同时期新型冠状病毒基因组测序及溯源分析

目的 对珠海市4例不同时期新型冠状肺炎确证病例的呼吸道标本进行三代测序,获得新型冠状病毒全基因组序列,分析基因组突变及分子溯源情况。方法 采用nanopore 三代高通量测序技术对呼吸道标本中的新型冠状病毒基因组测序,基于artic流程组装病毒基因组序列,运用生物信息学软件分析病毒全基因组序列与参考序列的一致性与进化情况。结果 4份样本均可获得28 298~29 819 bp长度的基因组序列数,基因组覆盖度94.6%~99.7%,共检出46个碱基位点突变、涉及27处氨基酸变异,非同义突变占比58.7%(27/46),非同义突变中以ORF1ab 基因占比最高44.44%(12/27)。系统发育树显示,4份样本分属于B(Zhuhai/ZQ202001/2020)、B.1.36(Zhuhai/YZQ202011/2020)、B.1.1.63(Zhuhai/ZHG9671/2020和Zhuhai/P0717001/2020)进化分支,Zhuhai/ZQ202001/2020与武汉早期输入密切相关,Zhuhai/YZQ202011/2020、Zhuhai/P0717001/2020、Zhuhai/ZHG9671/2020与同时期香港新冠肺炎病例基因组序列相似性最高,与其流行病学调查结果一致。结论 4例珠海市新型冠状肺炎确证病例均为输入病例,不存在本地感染,核苷酸位点变异存在多态性。三代测序技术可有效用于原始样本中新型冠状病毒基因组序列的溯源分析,在地市级疾控应用前景较好。     

珠海市海产品中致病性弧菌的污染现状

目的了解珠海市海产品中致病性弧菌的污染现状,为疾病的预防与控制提供科学的依据.方法于2012年1~12月共采集市售海产品240份,对副溶血性弧菌、创伤弧菌、霍乱弧菌进行检测、分析.结果副溶血性弧菌检出率为19.2%,创伤弧菌检出率为15.8%,霍乱弧菌检出率为0%,5~9月份检出率最高,霍乱弧菌未检出.不同种类的海产品中,贝壳类的检出率最高,其副溶血性弧菌和创伤弧菌的检出率分别高达40%和43.3%,农贸市场和酒店的污染情况无明显差别.结论疾病控制及卫生监督部门应加强市售海产品的卫生监督,合理引导市民的饮食习惯,不生吃或进食未经煮熟的海产品,预防食物中毒的发生.     

一例14型人感染猪链球菌病例流行病学调查

2018年9月广东省珠海市报告1例14型人感染猪链球菌病例，病例及1名共同暴露者均出现脑膜炎、关节炎、永久性耳聋等临床表现，发病前1周均无病（死）猪接触史，但每天进食猪肉，经调查病例可能经口腔黏膜破损导致感染。     

气-质谱联用法快速测定工作场所空气中多组分农药中毒

目的建立工作场所空气中有机磷农药、有机氯农药、氨基甲酸酯农药、拟除虫菊酯类农药共42种组分的快速测定方法。方法采用固体吸附剂采集空气中多种混合农药毒物，用1：1丙酮-正己烷解吸后以DB-35ms为分离柱、气相色谱-质谱仪联用分析测定。结果所有组分彼此完全分离，能同时予以定性确认；42种有机农药在一定浓度范围内线性关系良好，相关系数R≥0．99；最低检出限远低于职业化学中毒现场剂量水平。8种代表性农药组分解吸效率为86．3％～98．5％。结论本方法具有高选择性、灵敏度和准确度，完全满足工作场所空气中多种农药中毒的快速定性定量测定。     

食源性致病菌96微孔板芯片在一起食物中毒检测中的应用

目的利用微孔板芯片技术对一起食物中毒进行检测,评价其在食物中毒事件中的应用效果。方法用食源性致病菌96微孔板芯片对一起食物中毒样品进行检测,同时采用传统的病原分离方法和细菌生化鉴定仪对分离菌株进行鉴定。结果食源性致病菌96微孔板芯片对食物中毒样品的检测结果与病原分离培养结果完全一致。结论食源性致病菌96微孔板芯片具有快速、准确、自动化和高通量等特点,作为应对食物中毒等突发公共卫生事件的快速检测具有重要意义。     

珠海市乙型肝炎病毒和丁型肝炎病毒混合感染调查及分子特征研究

目的 了解广东省珠海市乙型肝炎病毒（Hepatitis B virus, HBV）和丁型肝炎病毒（Hepatitis Delta virus, HDV）混合感染现状,及HBV基因型和S基因表达的关系。方法 收集广东省珠海市2017年9月至2019年2月HBV感染者血清样本558份,同时采用ELISA法和荧光PCR法检测HDV抗体和核酸,用PCR扩增和测序法获得HBV部分S基因序列,用MEGA 6.0软件构建进化树对HBV基因定型,并分析S蛋白功能区表达。结果 从558份HBV感染者血清样本中检出2份HDV病例,HDV感染率0.36%;HBV优势基因型为C型和B型,2份HBV/HDV混合感染样HBV基因型为C型,与HBV单独感染样位于同一进化簇,并在第146位和第194~201位氨基酸处保守。结论 广东省珠海市HBV感染者中HDV感染处于低水平;2例HBV/HDV混合感染样HBV基因型为C型,为珠海市优势基因型,HBV S蛋白未发现氨基酸变异。     

2019年珠海市登革病毒传播影响因素分析

目的 根据2019年珠海市登革病毒（DENV）的流行病学数据统计分析、DENV包膜蛋白（E）基因序列测定、登革抗体水平回顾分析及蚊媒密度监测,分析珠海市登革病毒传播的影响因素。方法 收集2019年登革热流行病学资料开展统计学分析;采集登革热临床诊断病例的血清标本,提取RNA,用RT - PCR方法检测,阳性标本针对E基因测序分型,构建进化树分析样品来源;采集2017—2019年珠海市200份/年的健康人群血清进行登革热抗体IgG检测;开展珠海市2019年蚊媒监测。结果 珠海2019年DENV流行的血清型主要为DENV - 1型,全部属于基因Ⅰ亚型,并分布在3个不同的分支上,分别与2017年越南、2015年柬埔寨,2014年马来西亚、新加坡,2014、2012年斯里兰卡等流行株高度同源;少数感染DENV - 2与DENV - 3病例均为输入病例,核酸序列与分别输入国的流行株序列高度同源;登革病毒IgG抗体阳性率逐年提高（2017年的1.5%到2019年12%）;2019年全市BI指数月平均值处在1.4～3.6之间。结论 目前珠海市登革病毒流行方式属于输入性引起的本地暴发流行,鉴于珠海登革疫情预警机制和蚊媒密度监测等工作推断,我市未来几年大范围暴发本地登革热疫情几率不高。     

分光光度法测定尿中硫氰酸盐的异烟酸-吡唑酮

目的 建立异烟酸-吡唑酮法测定氰化物(CN-)在尿中的代谢产物硫氰酸盐的分析方法.方法 尿样在pH≈7.0的溶液中.氯胺T把CN-转成氯化氰,与烟酸-吡唑酮生成蓝色染料,比色定量.结果 线性范围0～2.5g/L的确定系数(r2)=0.999,加标量0.2、0.5、2.0μg,回收率95.1%～105.0%,测量精密度相对标准偏差(RSD)=0.69%～3.04%,检出限0.5 mg/L.结论 该法准确度、精密度良好,可用于尿中硫氰酸盐的测定.     

气相色谱法测定油炸及高温热加工食品中的丙烯酰胺

目的：建立了油炸及高温热加工食品中丙烯酰胺的气相色谱分析方法。方法：样品加入甲基丙烯酰胺内标用水提取、Carrez试剂除蛋白质、正己烷抽提脱脂,样液经Oasis HLB固相萃取小柱净化,乙酸乙酯反萃取,提取液浓缩后,用配有火焰热离子检测器（FTD）的气相色谱仪测定,以甲基丙烯酰胺为内标定量。结果：方法的最低检出浓度为4.7μg/kg（S/N=3）,在0.10-10.0μg/ml浓度范围内,线性关系良好,相关系数r=0.99925,不同食品基质的不同加标水平（100-1 000μg/kg）,回收率在96.6%-100.3%,相对标准偏差（RSD）为1.90%-4.01%。结论：该方法具有灵敏度高、样品提取简单、定量准确可靠等特点,适用于食品中丙烯酰胺的测定。     

工作场所空气中挥发性有机物的GC/MS检测技术研究

目的:建立工作场所空气中54种挥发性有机物的GC/MS快速测定方法.方法:采用活性碳管采集车间空气中挥发性有机毒物,用二硫化碳解吸后以DB-VRX为分离柱、气相色谱-质谱仪联用检测分析.结果:所有组分彼此完全分离,能同时予以定性确认和定量分析;54种挥发性有机物空气在一定浓度范围内线性关系良好,相关系数r≥0.99;最低检出限远低于职业化学中毒现场剂量水平,目标组分解吸效率在76%～102%.结论:本方法准确度高、操作简便、灵敏快速,适用于工作场所空气中挥发性有机物中毒的快速定性定量测定.