18S rRNA基因序列分析在临床常见酵母样真菌鉴定中的应用

目的 应用18S rRNA基因序列分析技术对临床分离的常见酵母样真菌进行种的分类鉴定,且与传统方法比较,分析基因序列分析法鉴定临床常见酵母样真菌的可行性.方法 收集北京同仁医院微生物室菌库酵母样真菌115株,提取的DNA用18S rRNA通用引物进行PCR扩增,扩增产物直接测序,测序结果提交GenBank通过核酸序列比对对微生物种属进行鉴定,同时进行真菌显色培养基鉴定、Vitek 32 YBC鉴定,比较3种不同方法鉴定酵母样真菌的种鉴定准确率,阐明应用基因序列分析法鉴定临床酵母样真菌的可行性.结果 18S rRNA基因序列分析法与表型鉴定法相比较,有13株酵母样真菌鉴定结果存在差异:显色培养基仅鉴定出102株,与基因序列分析鉴定的符合率为89.2%(91/102),Vitek 32 YBC鉴定结果与基因序列分析鉴定的符合率为91.3%(105/115);显色培养基、Vitek 32 YBC和18S rRNA基因序列分析鉴定到种的比例分别为88.7%(102/115)、100%(115/115)、100%(115/115).结论 18S rRNA基因序列分析法呵对常见酵母样真菌进行准确分类.     

18S rRNA基因序列分析在临床常见酵母样真菌鉴定中的应用

目的 应用18S rRNA基因序列分析技术对临床分离的常见酵母样真菌进行种的分类鉴定,且与传统方法比较,分析基因序列分析法鉴定临床常见酵母样真菌的可行性.方法 收集北京同仁医院微生物室菌库酵母样真菌115株,提取的DNA用18S rRNA通用引物进行PCR扩增,扩增产物直接测序,测序结果提交GenBank通过核酸序列比对对微生物种属进行鉴定,同时进行真菌显色培养基鉴定、Vitek 32 YBC鉴定,比较3种不同方法鉴定酵母样真菌的种鉴定准确率,阐明应用基因序列分析法鉴定临床酵母样真菌的可行性.结果 18S rRNA基因序列分析法与表型鉴定法相比较,有13株酵母样真菌鉴定结果存在差异:显色培养基仅鉴定出102株,与基因序列分析鉴定的符合率为89.2%(91/102),Vitek 32 YBC鉴定结果与基因序列分析鉴定的符合率为91.3%(105/115);显色培养基、Vitek 32 YBC和18S rRNA基因序列分析鉴定到种的比例分别为88.7%(102/115)、100%(115/115)、100%(115/115).结论 18S rRNA基因序列分析法呵对常见酵母样真菌进行准确分类.     

SYBR green Ⅰ实时荧光PCR结合熔解曲线检测HBV B和C基因型的研究

国内外研究表明HBV基因型与病毒的感染途径、基因突变、疾病进程、抗病毒药物疗效有一定的关系[1-3]引,了解HBV基因型分布,追溯感染源对判断预后、监测抗病毒用药疗效、选择个体化治疗方案等具有重要应用价值.目前根据全基因序列同源性>92%或S区基因序列同源性≥96%,HBV分为A～H 8个基因型,在亚洲主要是A～F[4],国内主要基因型为B和C型.     

耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌对84消毒液抗性的试验研究

摘要 目的 研究临床分离出的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌（CRKP）对84消毒液的抗性,为做好医院环境消毒提供参考。方法 通过基因测定和最小杀菌浓度测定方法,对某医院临床分离的CRKP抗消毒剂基因携带情况和84消毒液抗性进行观察。结果 从临床分离的77株CRKP检出84消毒液抗性株为8株,阳性率为10.4%;从70株普通肺炎克雷伯菌中检出84消毒液抗性株为3株,阳性率为4.3%。84消毒液抗性菌株中抗消毒剂基因qacEΔ1-sul1阳性率为54.5%,非抗性菌株中该基因阳性率为10.5%。结论 部分CRKP已对84消毒液产生了轻度的抗性。抗消毒剂基因qacEΔ1-sul1与84消毒液的抗性之间存在一定的相关性。     

ITS序列鉴定真菌性鼻窦炎病原的方法评价

目的 建立ITS(包括ITSI-5.8 rRNA-ITS2)测序鉴定真菌性鼻窦炎病原的方法.方法 收集北京同仁医院2006-2008年,经临床与CT诊断为真菌性鼻窦炎,并行鼻内镜手术切除的组织标本270份.所有标本分别进行组织病理检查、压片直接镜检、真菌培养鉴定和核糖体RNA转录间隔区测序分析,通过方法比较,评价序列分析直接鉴定病原真菌的可行性,同时分析真菌性鼻窦炎病原学特征.结果 在270份标本中,组织病理阳性率为80.0%(216/270),压片阳性率为80.0%(216/270),真菌培养阳性率为53.0%(143/270),ITS测序阳性率为63.0%(170/270).经培养得到22个种,6个属.ITS测序鉴定32个种.培养与ITS序列种水平符合率为76.1%(102/143).结论 ITS测序可成为真菌鉴定的辅助工具.     

宿主生物标志物在社区获得性肺炎诊断、治疗和预后中的作用

社区获得性肺炎是威胁人类健康的重要疾病,单靠病原学诊断存在诸多问题。基于宿主对病原侵袭产生的生物标志物,可以实时反映病情进展、预测可能的病原微生物、指导临床用药及预后判断。该文从宿主生物标志物的动态改变和宿主转录组学、社区获得性肺炎临床评分系统方面,探讨宿主标志物对诊断和管理社区获得性肺炎的价值。     

肺炎克雷伯菌对消毒剂抗性的研究

当前,细菌对消毒剂的抗性问题越来越受到关注,国内外对消毒剂抗性也作了大量的研究。该文介绍消毒剂抗性的概念以及消毒剂抗性的产生机制,探讨消毒剂抗性的研究方法,重点回顾对肺炎克雷伯菌的消毒剂抗性方面的研究成果,并进行简要分析,指出目前消毒剂研究领域存在的问题,对今后该领域研究发展的方向给出建议。     

细菌核酸分类鉴定技术的研究进展

如果考虑到微生物物种的复杂性和生理生态学特点,目前使用的表型分类方法并非最有效。2 0 0 2年《自然遗传学》杂志发表一项调查报告认为,在未来5～10年中,对人类健康做出贡献的最关键生物技术是传染病的分子诊断技术。核酸分类法是对物种核酸分析得到的遗传相关性( geneticrelatedness)分类,这种分类是以决定生物表型特征的遗传物质———核酸作为比较准绳,所以它是一种客观和可信度较高的分类方法。作者结合多年研究工作,重点阐述发展迅速、应用广泛、可在临床实验室实现、对未知微生物进行基因鉴定的基础技术。一、以DNA指纹图谱为基础…     

一种快速检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌方法的评价

目的评价胶体金法检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)和耐甲氧西林凝固酶阴性葡萄球菌(MRCNS)临床应用价值。方法采用头孢西丁纸片扩散法、PCR扩增mecA基因和胶体金法对临床分离的150株金黄色葡萄球菌(100株MRSA和50株MSSA)、68株溶血葡萄球菌(58株MRSH和10株MSSH)、135株表皮葡萄球菌(97株MRSE和38株MSSE)进行检测并作比较。结果 MRSA、MSSA、MRSE、MSSE、MSSH三种方法检测结果一致。58株MRSH中6株胶体金法检测阴性。结论胶体金法可作为MRSA简便而准确的检测方法,同时也可分析MRCNS。     

慢性鼻窦炎患者与健康人群鼻腔菌群分析

目的调查慢性鼻窦炎患者鼻道主要细菌的种类。方法选取2018年1月至12月收治入院的慢性鼻窦炎患者137例,健康成人111例。在鼻内镜引导下用鼻拭子采集鼻分泌物标本,行普通细菌培养、厌氧细菌培养和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析。结果健康成人组中需氧菌以凝固酶阴性葡萄球菌(44.7%)和棒状杆菌(38.5%)为主,少数人群有金黄色葡萄球菌(7.7%)、铜绿假单胞菌(2.3%)和革兰阴性杆菌(1.9%);单一细菌定植比例为12.6%,2种细菌定植比例为73.9%,3种细菌定植比例13.5%。患者中需氧细菌以金黄色葡萄球菌(24.0%)、流感嗜血杆菌(6.2%)、克雷伯菌属(6.8%)为主的肠杆菌科细菌和铜绿假单胞菌(4.3%)为主;厌氧菌的检出率明显高于健康人群;单一细菌感染占36.5%,2种细菌感染占48.9%,3种细菌感染占14.6%。金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、流感嗜血杆菌、铜绿假单胞菌单一或合并厌氧菌感染时临床症状较重,容易形成细菌耐药,治疗周期长。两组间致病菌金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌、克雷伯菌为主的肠杆菌科细菌的检出率差异有统计学意义(P0.05)。结论慢性鼻窦炎患者和健康成人鼻道的细菌类型有明显区别,临床应根据培养结果规范使用治疗药物。