不同来源H9N2亚型禽流感病毒血凝素蛋白生物学分析

目的对不同来源的H9N2亚型禽流感病毒血凝素蛋白进行生物信息学比较分析,以找出重要的生物信息学数据。方法从Genebank的基因数据库中获取18株H9N2亚型禽流感病毒H9血凝素蛋白的核苷酸和氨基酸序列,运用Clustal X,Bioedit等国际通用软件进行氨基酸和核苷酸的序列比对,计算核苷酸及氨基酸的同源性。在线软件Antheprot分析二级结构。结果 H9型血凝素蛋白编码框架长约1683bp,编码含560个氨基酸的多肽。18株H9N2亚型禽流感病毒血凝素基因同源率为90.6%~99.8%,血凝素蛋白的氨基酸同源率为93.0%~99.4%,多肽序列中有84个变异位点,变异率为15.03%。血凝素蛋白A1和A2裂解序列为位于aa333-aa341的PSRSSR↓GLF序列;其中1株出现A334T变异,另一株则出现R335G变异。H9血凝素蛋白富含潜在α螺旋(25%~27%),β折叠(29%~32%),β转角(25%~27%)及无规则卷曲(17%~19%)等结构;H9型血凝素蛋白受体结合位点是由R100、W161、T163、N191、198(A/V/T)、L202、Y203位氨基酸残基折叠构成。结论 H9N2亚型禽流感病毒血凝素蛋白重要功能结构域的序列和空间结构相对保守稳定。     

抗中性粒细胞胞浆抗体检测对系统性血管炎的临床价值

目的探讨抗中性粒细胞胞浆抗体(ANCA)检测对系统性血管炎的临床意义。方法应用间接免疫荧光法(IIF)检测13 866例患者血清ANCA,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测抗髓过氧化物酶(MPO)抗体和抗蛋白酶3(PR3)抗体。结果 13 866例患者共检出ANCA阳性318例,阳性率为2.29%。其中男性患者检出135例(2.07%)、女性患者检出183例(2.50%),2个组差异无统计学意义(χ~2=2.650,P0.05)。不同年龄组患者间ANCA阳性率差异有统计学意义(χ~2=28.978,P0.01),且男、女性患者各自不同年龄组间ANCA阳性率差异亦有统计学意义(χ~2=54.550,P0.01;χ~2=17.800,P0.01)。p-ANCA和c-ANCA2种荧光核型及靶抗原分布差异有统计学意义(χ~2=86.524,P0.01)。结论 ANCA的检测对血管炎及自身免疫性疾病的诊断和治疗极为重要,临床工作者应注重ANCA在系统性血管炎及自身免疫性疾病中的检测。     

H5N1甲型流感病毒H5血凝素蛋白的分子特征分析

通过比较不同来源的H5N1甲型流感病毒H5血凝素蛋白生物信息学,分析H5N1甲型流感病毒H5血凝素蛋白的分子特征。方法 从Gene Bank基因数据库中获取15株H5N1甲型流感病毒H5血凝素蛋白的核苷酸和氨基酸序列,采用在线软件SignalP4.1预测信号肽,运用Clustal X,Bioedit等国际通用软件进行氨基酸和核苷酸的序列比对,计算核苷酸及氨基酸的同源性。在线软件Antheprot分析二级结构。结果 15株H5血凝素蛋白编码框架长约1707bp(8株)/1704bp(7株),编码含568个/567个氨基酸组成的多肽。H5血凝素氨基酸同源性为86.7%~99.2%,核苷酸同源性为85.6%~99.5%,H5血凝素蛋白富含潜在α螺旋(29%~35%)、β折叠(22%~25%)和卷曲结构(22%~25%)等二级结构。H5血凝素蛋白aa1-aa16区域为潜在信号肽,血凝素蛋白A1和A2裂解序列为aa323-aa333之间的RERRRKKR↓GLF序列,切割位点位于R330和G331之间;H5血凝素蛋白A1亚单位存在4个高变区,分别是aa115-aa140(52.0%)、aa151-aa170(57.9%)、aa183-aa200(64.7%)和aa263-aa280(47.4%)。但参与二硫键形成的10个半胱氨酸位点均未发生变异;构成受体结合域的E186、K212、S217-K218、G221-Q222-S223-G224等位点较保守;构成T细胞和B细胞表位aa141-155、aa206-223和aa302-316等区域较保守。结论 H5N1甲型流感病毒H5血凝素蛋白的受体结合域和免疫表位等重要功能结构域的序列比较保守稳定,在A1和A2裂解位点含高致病禽流感病毒分子特征相关的连续6个碱性氨基酸(R/K)序列。     

强直性脊柱炎患者检测骨代谢指标潜在的临床价值

目的:探讨骨代谢指标和人类白细胞抗原B27(HLA-B27)在检测强直性脊柱炎(AS)患者的临床意义,并分析其诊断价值。方法:研究对象为94 例AS 患者、239 例其他病种对照和80 例健康对照组,并对其结果进行回顾性分析。结果:AS 组β-胶原特殊序列(β-CTX)高于对照组,而骨钙素(OC)、25 羟基维生素D也25-(OH)D页和甲状旁腺素(PTH)低于对照组(P<0.05);AS 组C 反应蛋白(CRP)和β-CTX 呈明显的正相关(P<0.01),25-(OH)D 呈负相关(P<0.05),其他骨代谢指标和CRP 无相关性;AS 组HLA-B27 阳性率明显高于其他组(P<0.05),且HLA-B27 在诊断AS 时具有很高的敏感性和特异性;AS 组25-(OH)D 检测的敏感性高于β-CTX,但特异性低于β-CTX。结论:骨代谢指标对AS 早期筛查,临床诊断有着重要价值,尤其是β-CTX 和25-(OH)D 的诊断价值更为明显。     

不同时期H1N1甲型流感病毒H1血凝素蛋白的特征比较

目的比较2007—2014年分离的H1N1甲型流感病毒H1血凝素蛋白与分离于1934年的H1N1甲型流感病毒H1血凝素蛋白的差异性,以了解近几年流行的H1N1甲型流感病毒H1血凝素蛋白的变异特征。方法从Genebank的基因数据库中获取16株H1N1甲型流感病毒H1血凝素蛋白的核苷酸和氨基酸序列,采用在线软件SignalP4.1预测信号肽,运用Clustal X,Bioedit等国际通用软件进行氨基酸和核苷酸的序列比对,计算核苷酸及氨基酸的同源性。在线软件Antheprot分析二级结构。结果 H1血凝素蛋白编码框架长约1701bp,编码含566个氨基酸组成的多肽。16株H1N1甲型流感病毒H1血凝素氨基酸同源性为92.4%~99.8%,核苷酸同源性为91.8%~99.6%。H1血凝素蛋白aa1-aa17区域为潜在信号肽,血凝素蛋白A1和A2裂解序列为位于aa324-aa330序列IQSR↓GLF。H1血凝素蛋白富含潜在α螺旋(25%~32%)、β折叠(27%~28%)和卷曲结构(23%~26%)等二级结构。2007—2014年的15株病毒的血凝素蛋白A1高变区位于羧基端aa278-aa321,有11个位点变异,变异率高达25%。参与二硫键形成的10个半胱氨酸位点未发生变异,3个受体结合区的氨基酸序列(PKTS、VLVLWAIHH和SRYSKKFK)比较保守,有2个序列出现毒力相关位点D222G突变。结论与1934年的H1N1甲型流感病毒H1血凝素蛋白比较,2007—2014年间分离H1N1甲型流感病毒H1血凝素蛋白的重要功能结构域的序列仍保守稳定,但在某些位点出现较高频率的替代变异。